MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017338	AGGAA	2	10	13817	13826	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017338	GTAGG	2	10	13875	13884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017338	TCGAT	2	10	23285	23294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017338	TTTCA	2	10	33765	33774	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017338	TAAAA	2	10	35218	35227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017338	AGATA	2	10	35376	35385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017338	ATGAG	2	10	37710	37719	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017338	TTTGT	2	10	44116	44125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017338	ATTTT	2	10	63080	63089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017338	AAAGT	2	10	71346	71355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017338	TGCCA	2	10	74758	74767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017338	ATTTA	2	10	75120	75129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017338	TTTTA	2	10	76073	76082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017338	ATTCA	2	10	83095	83104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017338	GTAAA	2	10	83869	83878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017338	CTAAT	2	10	83944	83953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017338	CAATT	2	10	85051	85060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017338	ATTGC	2	10	92414	92423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017338	TCATT	2	10	92602	92611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017338	TATAG	2	10	96877	96886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017338	ATTAT	2	10	103301	103310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017338	GTAAT	2	10	103337	103346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017338	ATTTT	2	10	126227	126236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017338	AAAGC	2	10	171445	171454	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017338	TATAA	2	10	177560	177569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017338	TATCA	2	10	179446	179455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017338	ATCAT	2	10	187579	187588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017338	AAAAG	2	10	199591	199600	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017338	CAACT	2	10	199725	199734	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017338	GCTTT	2	10	204237	204246	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017338	TGAAG	2	10	204439	204448	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017338	AAAAT	2	10	204510	204519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017338	TGATT	2	10	204583	204592	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017338	TAACA	2	10	210808	210817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017338	AATAT	2	10	229988	229997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017338	TATTT	2	10	235977	235986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017338	AACAT	2	10	244319	244328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017338	AGATA	2	10	244498	244507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017338	GATAA	2	10	248256	248265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017338	ATAAC	2	10	252903	252912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017338	TGAAT	2	10	253014	253023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017338	ATTAA	2	10	253155	253164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017338	TAAAA	2	10	261051	261060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017338	AAATT	2	10	262368	262377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017338	GTAAA	2	10	276715	276724	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017338	ATTTT	2	10	283658	283667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017338	GAAAA	2	10	284521	284530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017338	ATAAA	2	10	284639	284648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017338	TCATA	2	10	295877	295886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017338	ATTTA	2	10	311829	311838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017338	TAAAT	2	10	341264	341273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017338	ATTTT	2	10	346823	346832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017338	ATAGA	2	10	353063	353072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017338	TGACA	2	10	353255	353264	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017338	TAATA	2	10	357432	357441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017338	GATAA	2	10	364269	364278	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017338	GTTGT	2	10	369701	369710	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017338	ATTTA	2	10	376043	376052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017338	TAAAA	2	10	389102	389111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017338	TTGCT	2	10	395963	395972	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017338	ATTCT	2	10	396605	396614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017338	AGAAT	2	10	400171	400180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017338	TAAGG	2	10	400235	400244	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017338	TAAAT	2	10	409050	409059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017338	ACAGT	2	10	411625	411634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017338	TGTAA	2	10	420900	420909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017338	ACATA	2	10	425517	425526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017338	AAATT	2	10	425733	425742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017338	TTTTG	2	10	432277	432286	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017338	AATAT	2	10	439537	439546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017338	AAATT	2	10	442859	442868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017338	TAAAG	2	10	451353	451362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017338	CTCAC	2	10	453271	453280	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017338	CAAAG	2	10	453296	453305	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017338	TTGTA	2	10	461248	461257	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017338	ATTAT	2	10	461417	461426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017338	TGGTG	2	10	488785	488794	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017338	CAACT	2	10	489350	489359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017338	GGTAA	2	10	489822	489831	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017338	TCGTG	2	10	490641	490650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017338	GATTG	2	10	492975	492984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017338	GATTT	2	10	497909	497918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017338	ATATA	2	10	500327	500336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017338	TTGAT	2	10	510043	510052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017338	ATGAA	2	10	510112	510121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017338	AGACA	2	10	524000	524009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017338	AAGTA	2	10	526621	526630	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017338	TTAAA	2	10	528745	528754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017338	GATAA	2	10	528784	528793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017338	GGTAA	2	10	534316	534325	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017338	TCGTG	2	10	535135	535144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017338	GATTG	2	10	537469	537478	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017338	CAAAA	2	10	539724	539733	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017338	ATATA	2	10	544364	544373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017338	AAAAT	2	10	549134	549143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017338	TTTAT	2	10	549243	549252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017338	TTATG	2	10	552250	552259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017338	ATTTA	2	10	552395	552404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017338	ACAAT	2	10	554200	554209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017338	TGAAT	2	10	558668	558677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017338	GTATA	2	10	558725	558734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017338	ATTTA	2	10	561438	561447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017338	TATAA	2	10	562442	562451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017338	GTTTA	2	10	578608	578617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017338	TAAAG	2	10	582801	582810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017338	GAAGC	2	10	584157	584166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017338	TAAAA	2	10	588856	588865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017338	ATATT	2	10	588938	588947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017338	TTAAC	2	10	592351	592360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017338	AATTT	2	10	592435	592444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017338	ATAAA	2	10	600755	600764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017338	TTATA	2	10	615131	615140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017338	ATGAT	2	10	624578	624587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017338	TAATT	2	10	628066	628075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017338	GATAT	2	10	628189	628198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017338	TATAT	2	10	636213	636222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017338	TAAAT	2	10	638175	638184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017338	AAATT	2	10	640179	640188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017338	TAAAA	2	10	647123	647132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017338	ATTAA	2	10	649311	649320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017338	TTATT	2	10	649360	649369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017338	CAATA	2	10	649426	649435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017338	TTAAT	2	10	652053	652062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017338	AAATA	2	10	654318	654327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017338	ATTTT	2	10	654340	654349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017338	ATAAA	2	10	661032	661041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017338	TTTTA	2	10	663298	663307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017338	AAAGG	2	10	663619	663628	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017338	ATATA	2	10	666723	666732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017338	AAACT	2	10	670248	670257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017338	TTTGT	2	10	679369	679378	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017338	AATGA	2	10	679442	679451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017338	GGTTG	2	10	686443	686452	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017338	AGTAG	2	10	696150	696159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017338	AAGTT	2	10	696599	696608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017338	AATTG	2	10	696631	696640	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017338	AAACT	2	10	698506	698515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017338	ATTTA	2	10	698896	698905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017338	AAAGT	2	10	701142	701151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017338	AATTT	2	10	703751	703760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017338	AGAAT	2	10	705694	705703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017338	CATGA	2	10	705911	705920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017338	ATCAT	2	10	710574	710583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017338	AATTT	2	10	715473	715482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017338	AATTA	2	10	722275	722284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017338	ATTTA	2	10	726456	726465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017338	AAAGT	2	10	726549	726558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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