MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 1883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	CAAAT	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	384548924
2	NC_017338	AATTT	2	10	1977	1986	40 %	60 %	0 %	0 %	384548925
3	NC_017338	CAATT	2	10	2043	2052	40 %	40 %	0 %	20 %	384548925
4	NC_017338	AAATT	2	10	2421	2430	60 %	40 %	0 %	0 %	384548925
5	NC_017338	CAAAT	2	10	4708	4717	60 %	20 %	0 %	20 %	384548928
6	NC_017338	TGAAT	2	10	6218	6227	40 %	40 %	20 %	0 %	384548928
7	NC_017338	TTCAA	2	10	7205	7214	40 %	40 %	0 %	20 %	384548929
8	NC_017338	ATCGC	2	10	9661	9670	20 %	20 %	20 %	40 %	384548930
9	NC_017338	ACAAT	2	10	10578	10587	60 %	20 %	0 %	20 %	384548931
10	NC_017338	CTTTG	2	10	11373	11382	0 %	60 %	20 %	20 %	384548931
11	NC_017338	TTATT	2	10	14914	14923	20 %	80 %	0 %	0 %	384548934
12	NC_017338	GCAAG	2	10	16088	16097	40 %	0 %	40 %	20 %	384548935
13	NC_017338	TTTGA	2	10	16247	16256	20 %	60 %	20 %	0 %	384548935
14	NC_017338	AGTTA	2	10	21562	21571	40 %	40 %	20 %	0 %	384548939
15	NC_017338	ACAAT	2	10	21583	21592	60 %	20 %	0 %	20 %	384548939
16	NC_017338	ATGTA	2	10	23121	23130	40 %	40 %	20 %	0 %	384548940
17	NC_017338	ACCAA	2	10	25718	25727	60 %	0 %	0 %	40 %	384548942
18	NC_017338	ATCAA	2	10	26430	26439	60 %	20 %	0 %	20 %	384548942
19	NC_017338	GAAAC	2	10	27051	27060	60 %	0 %	20 %	20 %	384548943
20	NC_017338	GAAGT	2	10	27201	27210	40 %	20 %	40 %	0 %	384548943
21	NC_017338	ATTAT	2	10	28844	28853	40 %	60 %	0 %	0 %	384548944
22	NC_017338	AACGA	2	10	28917	28926	60 %	0 %	20 %	20 %	384548944
23	NC_017338	AAACG	2	10	30763	30772	60 %	0 %	20 %	20 %	384548946
24	NC_017338	TGGCG	2	10	31448	31457	0 %	20 %	60 %	20 %	384548946
25	NC_017338	TATGA	2	10	32132	32141	40 %	40 %	20 %	0 %	384548946
26	NC_017338	GTTGT	2	10	32525	32534	0 %	60 %	40 %	0 %	384548946
27	NC_017338	CATTA	2	10	33362	33371	40 %	40 %	0 %	20 %	384548947
28	NC_017338	AAATG	2	10	35006	35015	60 %	20 %	20 %	0 %	384548948
29	NC_017338	ATTTT	2	10	35087	35096	20 %	80 %	0 %	0 %	384548948
30	NC_017338	TGAAT	2	10	38057	38066	40 %	40 %	20 %	0 %	384548952
31	NC_017338	TTGGT	2	10	38099	38108	0 %	60 %	40 %	0 %	384548952
32	NC_017338	AATAT	2	10	38167	38176	60 %	40 %	0 %	0 %	384548952
33	NC_017338	TTCGT	2	10	38378	38387	0 %	60 %	20 %	20 %	384548952
34	NC_017338	CAAAA	2	10	38738	38747	80 %	0 %	0 %	20 %	384548953
35	NC_017338	AAATT	2	10	40837	40846	60 %	40 %	0 %	0 %	384548954
36	NC_017338	TTGAA	2	10	42866	42875	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
37	NC_017338	TTGAA	2	10	43212	43221	40 %	40 %	20 %	0 %	384548956
38	NC_017338	TTTGA	2	10	47466	47475	20 %	60 %	20 %	0 %	384548960
39	NC_017338	GTTTT	2	10	47549	47558	0 %	80 %	20 %	0 %	384548960
40	NC_017338	GTTTG	2	10	48179	48188	0 %	60 %	40 %	0 %	384548961
41	NC_017338	TTGCT	2	10	48507	48516	0 %	60 %	20 %	20 %	384548961
42	NC_017338	TATTT	2	10	52001	52010	20 %	80 %	0 %	0 %	384548964
43	NC_017338	TATGT	2	10	55262	55271	20 %	60 %	20 %	0 %	384548967
44	NC_017338	GATTT	2	10	56583	56592	20 %	60 %	20 %	0 %	384548969
45	NC_017338	AAAGA	2	10	57224	57233	80 %	0 %	20 %	0 %	384548970
46	NC_017338	ATTAT	2	10	59124	59133	40 %	60 %	0 %	0 %	384548971
47	NC_017338	TCTAC	2	10	60884	60893	20 %	40 %	0 %	40 %	384548972
48	NC_017338	CTAAA	2	10	62753	62762	60 %	20 %	0 %	20 %	384548973
49	NC_017338	AAATC	2	10	62875	62884	60 %	20 %	0 %	20 %	384548973
50	NC_017338	CTATT	2	10	64234	64243	20 %	60 %	0 %	20 %	384548974
51	NC_017338	ATTTA	2	10	64684	64693	40 %	60 %	0 %	0 %	384548975
52	NC_017338	ATTTT	2	10	65023	65032	20 %	80 %	0 %	0 %	384548975
53	NC_017338	GGTAG	2	10	65516	65525	20 %	20 %	60 %	0 %	384548975
54	NC_017338	TTTTG	2	10	66641	66650	0 %	80 %	20 %	0 %	384548976
55	NC_017338	TATGA	2	10	67305	67314	40 %	40 %	20 %	0 %	384548976
56	NC_017338	CTTTT	2	10	69240	69249	0 %	80 %	0 %	20 %	384548977
57	NC_017338	TAGTA	2	10	69567	69576	40 %	40 %	20 %	0 %	384548977
58	NC_017338	GAAAA	2	10	69661	69670	80 %	0 %	20 %	0 %	384548977
59	NC_017338	AGACG	2	10	69756	69765	40 %	0 %	40 %	20 %	384548977
60	NC_017338	ATTGC	2	10	71450	71459	20 %	40 %	20 %	20 %	384548980
61	NC_017338	TGTAA	2	10	71801	71810	40 %	40 %	20 %	0 %	384548980
62	NC_017338	GTTGT	2	10	73139	73148	0 %	60 %	40 %	0 %	384548982
63	NC_017338	AACAA	2	10	75712	75721	80 %	0 %	0 %	20 %	384548983
64	NC_017338	TATGA	2	10	77577	77586	40 %	40 %	20 %	0 %	384548985
65	NC_017338	ATTTT	2	10	79804	79813	20 %	80 %	0 %	0 %	384548989
66	NC_017338	TATGG	2	10	81817	81826	20 %	40 %	40 %	0 %	384548991
67	NC_017338	TAACT	2	10	82122	82131	40 %	40 %	0 %	20 %	384548991
68	NC_017338	TATAT	2	10	83356	83365	40 %	60 %	0 %	0 %	384548992
69	NC_017338	GTTCT	2	10	84575	84584	0 %	60 %	20 %	20 %	384548993
70	NC_017338	TGATG	2	10	84748	84757	20 %	40 %	40 %	0 %	384548993
71	NC_017338	ATTTA	2	10	85676	85685	40 %	60 %	0 %	0 %	384548994
72	NC_017338	TATCA	2	10	86122	86131	40 %	40 %	0 %	20 %	384548995
73	NC_017338	GAATG	2	10	86420	86429	40 %	20 %	40 %	0 %	384548995
74	NC_017338	TTAAA	2	10	86563	86572	60 %	40 %	0 %	0 %	384548995
75	NC_017338	TACTA	2	10	89012	89021	40 %	40 %	0 %	20 %	384548998
76	NC_017338	GATAT	2	10	89298	89307	40 %	40 %	20 %	0 %	384548998
77	NC_017338	TTTAC	2	10	89421	89430	20 %	60 %	0 %	20 %	384548998
78	NC_017338	AAATC	2	10	90413	90422	60 %	20 %	0 %	20 %	384548999
79	NC_017338	TGAAA	2	10	94486	94495	60 %	20 %	20 %	0 %	384549002
80	NC_017338	TCAAT	2	10	94858	94867	40 %	40 %	0 %	20 %	384549002
81	NC_017338	GTATT	2	10	95347	95356	20 %	60 %	20 %	0 %	384549003
82	NC_017338	ATGTT	2	10	104603	104612	20 %	60 %	20 %	0 %	384549009
83	NC_017338	TTGCG	2	10	105174	105183	0 %	40 %	40 %	20 %	384549009
84	NC_017338	AGTTA	2	10	106656	106665	40 %	40 %	20 %	0 %	384549010
85	NC_017338	TTGCG	2	10	107164	107173	0 %	40 %	40 %	20 %	384549010
86	NC_017338	AGATG	2	10	110029	110038	40 %	20 %	40 %	0 %	384549012
87	NC_017338	GAAAA	2	10	114062	114071	80 %	0 %	20 %	0 %	384549016
88	NC_017338	TGTAT	2	10	114394	114403	20 %	60 %	20 %	0 %	384549017
89	NC_017338	AATCA	2	10	117251	117260	60 %	20 %	0 %	20 %	384549018
90	NC_017338	ATTTT	2	10	117949	117958	20 %	80 %	0 %	0 %	384549019
91	NC_017338	ATCAA	2	10	117976	117985	60 %	20 %	0 %	20 %	384549019
92	NC_017338	ATCAC	2	10	119209	119218	40 %	20 %	0 %	40 %	384549020
93	NC_017338	AACGA	2	10	119886	119895	60 %	0 %	20 %	20 %	384549020
94	NC_017338	ACACA	2	10	121942	121951	60 %	0 %	0 %	40 %	384549022
95	NC_017338	GACAA	2	10	123093	123102	60 %	0 %	20 %	20 %	384549023
96	NC_017338	TCTTA	2	10	123876	123885	20 %	60 %	0 %	20 %	384549024
97	NC_017338	ATTAC	2	10	125923	125932	40 %	40 %	0 %	20 %	384549026
98	NC_017338	TATCT	2	10	126583	126592	20 %	60 %	0 %	20 %	384549027
99	NC_017338	ATACG	2	10	129016	129025	40 %	20 %	20 %	20 %	384549029
100	NC_017338	TTATA	2	10	129674	129683	40 %	60 %	0 %	0 %	384549030
101	NC_017338	TTTTA	2	10	130472	130481	20 %	80 %	0 %	0 %	384549030
102	NC_017338	AATAA	2	10	131578	131587	80 %	20 %	0 %	0 %	384549031
103	NC_017338	TACGC	2	10	131845	131854	20 %	20 %	20 %	40 %	384549031
104	NC_017338	TCCCT	2	10	134654	134663	0 %	40 %	0 %	60 %	384549034
105	NC_017338	GCTTT	2	10	136888	136897	0 %	60 %	20 %	20 %	384549036
106	NC_017338	TAATT	2	10	136973	136982	40 %	60 %	0 %	0 %	384549036
107	NC_017338	ATACT	2	10	138154	138163	40 %	40 %	0 %	20 %	384549038
108	NC_017338	TAATA	2	10	139320	139329	60 %	40 %	0 %	0 %	384549039
109	NC_017338	ATTTT	2	10	140311	140320	20 %	80 %	0 %	0 %	384549040
110	NC_017338	TAAAA	2	10	140510	140519	80 %	20 %	0 %	0 %	384549040
111	NC_017338	TTGTA	2	10	142535	142544	20 %	60 %	20 %	0 %	384549042
112	NC_017338	TGCAA	2	10	143540	143549	40 %	20 %	20 %	20 %	384549043
113	NC_017338	ATATG	2	10	145513	145522	40 %	40 %	20 %	0 %	384549044
114	NC_017338	TATGA	2	10	147190	147199	40 %	40 %	20 %	0 %	384549045
115	NC_017338	AATAT	2	10	148196	148205	60 %	40 %	0 %	0 %	384549045
116	NC_017338	CGAAC	2	10	150186	150195	40 %	0 %	20 %	40 %	384549046
117	NC_017338	TTCAA	2	10	152213	152222	40 %	40 %	0 %	20 %	384549047
118	NC_017338	ACATC	2	10	153056	153065	40 %	20 %	0 %	40 %	384549049
119	NC_017338	TAATT	2	10	155279	155288	40 %	60 %	0 %	0 %	384549050
120	NC_017338	AGAGA	2	10	158305	158314	60 %	0 %	40 %	0 %	384549053
121	NC_017338	AATCC	2	10	158661	158670	40 %	20 %	0 %	40 %	384549053
122	NC_017338	TTGGA	2	10	161690	161699	20 %	40 %	40 %	0 %	384549056
123	NC_017338	TTATT	2	10	162105	162114	20 %	80 %	0 %	0 %	384549057
124	NC_017338	ATTTT	2	10	162171	162180	20 %	80 %	0 %	0 %	384549057
125	NC_017338	TATGG	2	10	162572	162581	20 %	40 %	40 %	0 %	384549057
126	NC_017338	ATCGT	2	10	163013	163022	20 %	40 %	20 %	20 %	384549057
127	NC_017338	TGAAT	2	10	167599	167608	40 %	40 %	20 %	0 %	384549062
128	NC_017338	TGATT	2	10	168730	168739	20 %	60 %	20 %	0 %	384549064
129	NC_017338	CAAAA	2	10	168983	168992	80 %	0 %	0 %	20 %	384549064
130	NC_017338	TTCAT	2	10	171837	171846	20 %	60 %	0 %	20 %	384549066
131	NC_017338	TTTAC	2	10	172220	172229	20 %	60 %	0 %	20 %	384549066
132	NC_017338	TTATT	2	10	173198	173207	20 %	80 %	0 %	0 %	384549068
133	NC_017338	GGATT	2	10	174186	174195	20 %	40 %	40 %	0 %	384549069
134	NC_017338	CACAA	2	10	174850	174859	60 %	0 %	0 %	40 %	384549070
135	NC_017338	TAACT	2	10	177238	177247	40 %	40 %	0 %	20 %	384549072
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