MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 36882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	TAT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
2	NC_017338	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
3	NC_017338	TGT	2	6	201	206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548924
4	NC_017338	TAC	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548924
5	NC_017338	GAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
6	NC_017338	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548924
7	NC_017338	ACA	2	6	289	294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
8	NC_017338	AAC	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548924
9	NC_017338	ATT	2	6	453	458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
10	NC_017338	TCA	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548924
11	NC_017338	ATA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548924
12	NC_017338	TTA	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
13	NC_017338	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
14	NC_017338	GAT	2	6	655	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548924
15	NC_017338	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
16	NC_017338	ACC	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
17	NC_017338	AGA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
18	NC_017338	TTG	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548924
19	NC_017338	CCA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
20	NC_017338	AGA	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
21	NC_017338	GAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
22	NC_017338	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548924
23	NC_017338	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548924
24	NC_017338	CTG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548924
25	NC_017338	GAA	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
26	NC_017338	TGG	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548924
27	NC_017338	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
28	NC_017338	AAG	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548924
29	NC_017338	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
30	NC_017338	TTA	2	6	1671	1676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
31	NC_017338	AAC	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548925
32	NC_017338	AGT	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
33	NC_017338	TTG	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548925
34	NC_017338	TTA	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
35	NC_017338	AGA	2	6	2215	2220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
36	NC_017338	TCA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548925
37	NC_017338	GAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
38	NC_017338	TCT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
39	NC_017338	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
40	NC_017338	ACA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548925
41	NC_017338	TTA	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
42	NC_017338	GGT	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548925
43	NC_017338	TTA	2	6	2505	2510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548925
44	NC_017338	TGA	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
45	NC_017338	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548925
46	NC_017338	TCT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
47	NC_017338	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548925
48	NC_017338	GGT	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548925
49	NC_017338	ATG	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548925
50	NC_017338	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548925
51	NC_017338	GAC	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548925
52	NC_017338	AAG	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548926
53	NC_017338	GTA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548926
54	NC_017338	ATT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548926
55	NC_017338	TGG	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548926
56	NC_017338	ATG	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
57	NC_017338	GTC	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548927
58	NC_017338	AGA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
59	NC_017338	CTC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384548927
60	NC_017338	GAC	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548927
61	NC_017338	CTG	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548927
62	NC_017338	AAT	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548927
63	NC_017338	CAG	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548927
64	NC_017338	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
65	NC_017338	ATT	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
66	NC_017338	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548927
67	NC_017338	ATA	2	6	4144	4149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548927
68	NC_017338	GAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
69	NC_017338	TTA	3	9	4332	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
70	NC_017338	GAT	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548927
71	NC_017338	TTA	2	6	4383	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548927
72	NC_017338	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548928
73	NC_017338	ATA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548928
74	NC_017338	GTT	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548928
75	NC_017338	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
76	NC_017338	CGG	2	6	4853	4858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
77	NC_017338	TGG	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
78	NC_017338	TCA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548928
79	NC_017338	TCA	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548928
80	NC_017338	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
81	NC_017338	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548928
82	NC_017338	AGA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
83	NC_017338	GGC	2	6	5208	5213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
84	NC_017338	GAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548928
85	NC_017338	ATA	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548928
86	NC_017338	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548928
87	NC_017338	AGA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
88	NC_017338	ATT	2	6	5603	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
89	NC_017338	TAT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
90	NC_017338	GGC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384548928
91	NC_017338	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548928
92	NC_017338	CGT	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548928
93	NC_017338	GAA	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
94	NC_017338	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
95	NC_017338	TTC	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548928
96	NC_017338	TAT	2	6	6177	6182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548928
97	NC_017338	ACA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548928
98	NC_017338	AGA	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548928
99	NC_017338	TCG	2	6	6626	6631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548929
100	NC_017338	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548929
101	NC_017338	GCA	3	9	6840	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384548929
102	NC_017338	TAA	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548929
103	NC_017338	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
104	NC_017338	TTA	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
105	NC_017338	CCA	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384548929
106	NC_017338	CTG	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548929
107	NC_017338	GAA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
108	NC_017338	TTG	2	6	7264	7269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548929
109	NC_017338	TGA	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
110	NC_017338	CAT	2	6	7474	7479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384548929
111	NC_017338	TTA	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
112	NC_017338	AAG	2	6	7534	7539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
113	NC_017338	ATT	2	6	7549	7554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
114	NC_017338	GTT	2	6	7572	7577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384548929
115	NC_017338	AGA	2	6	7578	7583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
116	NC_017338	ATT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
117	NC_017338	CAA	2	6	7722	7727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384548929
118	NC_017338	TTA	2	6	7830	7835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
119	NC_017338	TGA	2	6	7868	7873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
120	NC_017338	TTA	2	6	7881	7886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548929
121	NC_017338	TGA	2	6	7931	7936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
122	NC_017338	TCG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384548929
123	NC_017338	AGA	2	6	7997	8002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
124	NC_017338	ATA	2	6	8026	8031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384548929
125	NC_017338	GTG	2	6	8077	8082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548929
126	NC_017338	GTG	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384548929
127	NC_017338	GAA	2	6	8112	8117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
128	NC_017338	ATG	2	6	8272	8277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384548929
129	NC_017338	CTT	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384548929
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131	NC_017338	AGA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384548929
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261	NC_017338	TAT	2	6	17518	17523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384548936
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