MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133 chromosome

Total Repeats: 1514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017337	GTTGAA	2	12	3193	3204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546271
2	NC_017337	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017337	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017337	TGGCGG	2	12	5371	5382	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384546274
5	NC_017337	GTTATC	2	12	7299	7310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384546275
6	NC_017337	CAGATA	2	12	8208	8219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546275
7	NC_017337	CAAGCT	2	12	8267	8278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546275
8	NC_017337	GTAATG	2	12	9255	9266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546275
9	NC_017337	AGATGA	2	12	9649	9660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546275
10	NC_017337	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384546277
11	NC_017337	TTAGCA	2	12	11346	11357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546277
12	NC_017337	GCTTTA	2	12	17444	17455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384546282
13	NC_017337	TTTGAA	2	12	18265	18276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546282
14	NC_017337	TTGGTG	2	12	19109	19120	0 %	50 %	50 %	0 %	384546283
15	NC_017337	TAAAGG	2	12	20312	20323	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546284
16	NC_017337	TTGAAG	2	12	20509	20520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546284
17	NC_017337	TGATTG	2	12	21713	21724	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546285
18	NC_017337	GATGAA	2	12	21988	21999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546285
19	NC_017337	TGAAAT	2	12	22044	22055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546285
20	NC_017337	AAGGAA	2	12	22483	22494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546286
21	NC_017337	TGAATT	2	12	25403	25414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546287
22	NC_017337	ATTTCA	2	12	27887	27898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546289
23	NC_017337	GTTCTG	2	12	29186	29197	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384546290
24	NC_017337	ATCAGC	2	12	31201	31212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546292
25	NC_017337	AAAAGA	2	12	33842	33853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384546293
26	NC_017337	AATACT	2	12	36197	36208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384546294
27	NC_017337	GATTAG	2	12	36940	36951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546294
28	NC_017337	TTGTTC	2	12	37567	37578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017337	TTAATT	2	12	40807	40818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017337	ATTTAT	2	12	43572	43583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546302
31	NC_017337	TTAATG	2	12	44096	44107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546303
32	NC_017337	AAGTCA	2	12	45304	45315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546305
33	NC_017337	AAAAAG	2	12	45418	45429	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384546305
34	NC_017337	GAAAAA	2	12	45731	45742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384546305
35	NC_017337	AATTAT	2	12	47970	47981	50 %	50 %	0 %	0 %	384546307
36	NC_017337	ACCCTT	2	12	49806	49817	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384546308
37	NC_017337	TTTAGC	2	12	51715	51726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384546311
38	NC_017337	AAATAA	2	12	51766	51777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384546311
39	NC_017337	GAAACC	2	12	51779	51790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384546311
40	NC_017337	AAAAGA	2	12	53943	53954	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384546312
41	NC_017337	AATTAA	2	12	55858	55869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017337	TACAAG	2	12	58355	58366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546316
43	NC_017337	GCTAAA	2	12	58420	58431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546316
44	NC_017337	GTAGAA	2	12	62272	62283	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546318
45	NC_017337	AACCAC	2	12	63107	63118	50 %	0 %	0 %	50 %	384546318
46	NC_017337	AATATA	2	12	64809	64820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017337	AACCGA	2	12	66422	66433	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384546320
48	NC_017337	CATTAC	2	12	68123	68134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546321
49	NC_017337	TATCAT	2	12	69695	69706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546322
50	NC_017337	TTTATT	2	12	70103	70114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384546323
51	NC_017337	TATTTG	2	12	70189	70200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384546323
52	NC_017337	TAAATA	2	12	71622	71633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546323
53	NC_017337	TTTTTC	2	12	73514	73525	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384546324
54	NC_017337	TTAAAT	2	12	73609	73620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017337	TAAGCC	2	12	75375	75386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546326
56	NC_017337	ATCGCA	2	12	76590	76601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546327
57	NC_017337	TTTGAA	2	12	77621	77632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546328
58	NC_017337	TGAAGA	2	12	87413	87424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546335
59	NC_017337	TTTCAT	2	12	88094	88105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384546336
60	NC_017337	ATTTTT	2	12	90307	90318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384546339
61	NC_017337	TGTATA	2	12	92958	92969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546342
62	NC_017337	AATTAT	2	12	93317	93328	50 %	50 %	0 %	0 %	384546343
63	NC_017337	TCGAAA	2	12	94459	94470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546344
64	NC_017337	CTATTG	2	12	97045	97056	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384546346
65	NC_017337	CATATG	2	12	98248	98259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546347
66	NC_017337	CAGATT	2	12	103040	103051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546351
67	NC_017337	AGATAT	2	12	110438	110449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546358
68	NC_017337	GTTTTT	2	12	111347	111358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017337	TGAAAG	2	12	112216	112227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017337	GATATG	2	12	119720	119731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546364
71	NC_017337	ATTTGA	2	12	123626	123637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546367
72	NC_017337	TATAAA	2	12	124157	124168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546368
73	NC_017337	GATTTT	2	12	128319	128330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384546372
74	NC_017337	ACAAAG	2	12	132839	132850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384546376
75	NC_017337	TGTAAT	2	12	133863	133874	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546377
76	NC_017337	AAAGAT	2	12	134852	134863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384546379
77	NC_017337	ATTAAT	2	12	136759	136770	50 %	50 %	0 %	0 %	384546380
78	NC_017337	CAATAT	2	12	137325	137336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384546380
79	NC_017337	AATTAG	2	12	140051	140062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546384
80	NC_017337	TTGGTA	2	12	141178	141189	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546385
81	NC_017337	GCGATT	2	12	141198	141209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384546385
82	NC_017337	CTATTA	2	12	147421	147432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546388
83	NC_017337	TATGAT	2	12	148955	148966	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384546388
84	NC_017337	ATTGAA	2	12	149406	149417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546388
85	NC_017337	AGCAAC	2	12	155334	155345	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384546392
86	NC_017337	CACCTT	2	12	157386	157397	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384546394
87	NC_017337	ACCTTT	2	12	157891	157902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384546394
88	NC_017337	TTTATA	2	12	157987	157998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017337	ATTAAT	2	12	158010	158021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017337	ATTTCA	2	12	161597	161608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546397
91	NC_017337	GTAAAT	2	12	161628	161639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546397
92	NC_017337	ATTTTA	2	12	163222	163233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546399
93	NC_017337	TATCTT	2	12	167837	167848	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384546402
94	NC_017337	ATTTGG	2	12	168850	168861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546403
95	NC_017337	GAGTTT	2	12	172762	172773	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546405
96	NC_017337	CCCTGA	2	12	177340	177351	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384546409
97	NC_017337	TCCTGA	2	12	178159	178170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384546409
98	NC_017337	TCAATT	2	12	180310	180321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546411
99	NC_017337	AATATG	2	12	181610	181621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546412
100	NC_017337	AAATTT	2	12	185164	185175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017337	AGGACA	2	12	186240	186251	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384546415
102	NC_017337	ACATTT	2	12	186576	186587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546415
103	NC_017337	TTCTTG	2	12	191506	191517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384546419
104	NC_017337	GGACGT	2	12	202200	202211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384546428
105	NC_017337	ATATGA	2	12	204937	204948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017337	AAAACT	2	12	208385	208396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384546432
107	NC_017337	CTTCAA	2	12	210157	210168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017337	CATCTA	2	12	213041	213052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546434
109	NC_017337	AGCCAT	2	12	215818	215829	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546436
110	NC_017337	AGTGGA	2	12	219961	219972	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017337	TGGTAT	2	12	231546	231557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546449
112	NC_017337	TATAGA	2	12	234900	234911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546454
113	NC_017337	ATATAG	2	12	241193	241204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017337	ACGATG	2	12	241529	241540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384546459
115	NC_017337	ATTTTC	2	12	247320	247331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017337	ATAATT	2	12	248270	248281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017337	AGAATC	2	12	249898	249909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546464
118	NC_017337	GCAATT	2	12	253774	253785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546468
119	NC_017337	TCAATT	2	12	254335	254346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384546468
120	NC_017337	AATTAT	2	12	255692	255703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017337	AAGTAA	2	12	256069	256080	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384546470
122	NC_017337	ATAAAG	2	12	257050	257061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384546471
123	NC_017337	AACGAT	2	12	258451	258462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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350	NC_017337	GATTCA	2	12	628165	628176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546843
351	NC_017337	GACTCA	2	12	628183	628194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384546843
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