MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133 chromosome

Total Repeats: 676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017337	TGAAC	2	10	6977	6986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017337	TCGAT	2	10	23815	23824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017337	ATATT	2	10	24353	24362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017337	AAATA	2	10	34510	34519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017337	TTAAT	2	10	34520	34529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017337	TAAAA	2	10	37612	37621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017337	GTGTT	2	10	48580	48589	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017337	ATTCA	2	10	51168	51177	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017337	ATATA	2	10	59478	59487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017337	GTAAT	2	10	69231	69240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017337	TACTT	2	10	98968	98977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017337	TAATA	2	10	104331	104340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017337	GTTTT	2	10	137853	137862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017337	TAAAT	2	10	142949	142958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017337	TATCA	2	10	144718	144727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017337	ATCAT	2	10	152850	152859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017337	AAAAG	2	10	164844	164853	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017337	CAACT	2	10	164978	164987	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017337	GCTTT	2	10	169490	169499	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017337	TAACA	2	10	176632	176641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017337	AATAT	2	10	195285	195294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017337	TATTT	2	10	201274	201283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017337	AACAT	2	10	209785	209794	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017337	GATAA	2	10	213720	213729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017337	ATAAC	2	10	218367	218376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017337	TGAAT	2	10	218478	218487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017337	ATTAA	2	10	218619	218628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017337	AAAGT	2	10	222364	222373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017337	TAAAA	2	10	224077	224086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017337	AAATT	2	10	225394	225403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017337	AATTG	2	10	239522	239531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017337	TAAAA	2	10	239540	239549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017337	ATTCA	2	10	245640	245649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017337	GTTAA	2	10	246312	246321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017337	ATAAA	2	10	248259	248268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017337	TAATA	2	10	258041	258050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017337	TCATA	2	10	259523	259532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017337	ATTTA	2	10	274806	274815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017337	TAAAT	2	10	311819	311828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017337	ATTTT	2	10	317377	317386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017337	TTTGG	2	10	364296	364305	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017337	TTAGT	2	10	364539	364548	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017337	TTAAA	2	10	364560	364569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017337	TTATT	2	10	366630	366639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017337	AATAA	2	10	367264	367273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017337	ATAGA	2	10	371296	371305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017337	TGACA	2	10	371494	371503	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017337	TAATA	2	10	375671	375680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017337	GATAA	2	10	382510	382519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017337	TCAAA	2	10	391159	391168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017337	ATGAT	2	10	392168	392177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017337	TTGCA	2	10	392709	392718	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017337	TATCA	2	10	397217	397226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017337	ATTCT	2	10	414997	415006	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017337	TCAAT	2	10	415987	415996	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017337	TTGAA	2	10	418235	418244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017337	AGAAT	2	10	418563	418572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017337	TAAGG	2	10	418627	418636	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017337	ATGGT	2	10	419961	419970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017337	TAAAT	2	10	426219	426228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017337	ACAGT	2	10	428791	428800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017337	GATTG	2	10	435930	435939	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017337	ATATC	2	10	436789	436798	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017337	GCAAC	2	10	453805	453814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017337	CATAA	2	10	455187	455196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017337	TAAAA	2	10	455411	455420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017337	AATAT	2	10	457559	457568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017337	TATCC	2	10	466651	466660	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017337	AAATT	2	10	472779	472788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017337	ATAAA	2	10	475506	475515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017337	ATATT	2	10	475874	475883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017337	AATCA	2	10	476510	476519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017337	GAAAA	2	10	476534	476543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017337	ATTAT	2	10	476733	476742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017337	TTTAA	2	10	479206	479215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017337	TAAAG	2	10	479668	479677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017337	CTCAC	2	10	481573	481582	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_017337	CAAAG	2	10	481598	481607	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017337	CTTAA	2	10	499313	499322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017337	TGGTG	2	10	517133	517142	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017337	CAACT	2	10	517698	517707	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017337	GGTAA	2	10	518169	518178	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017337	TCGTG	2	10	518988	518997	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017337	GATTG	2	10	521383	521392	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017337	GATTT	2	10	526315	526324	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017337	ATATA	2	10	528733	528742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017337	CAAAG	2	10	535281	535290	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017337	TTGAT	2	10	538442	538451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017337	ATGAA	2	10	538512	538521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017337	AGACA	2	10	552400	552409	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017337	GAAAT	2	10	555025	555034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017337	TGGGG	2	10	555053	555062	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017337	AAGTA	2	10	555253	555262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017337	TTAAA	2	10	557377	557386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017337	GATAA	2	10	557416	557425	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017337	GGTAA	2	10	562946	562955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017337	TCGTG	2	10	563765	563774	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017337	GATTG	2	10	566158	566167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017337	CAAAA	2	10	568152	568161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017337	ATATA	2	10	572793	572802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017337	AAAAT	2	10	577568	577577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017337	TTTAT	2	10	577677	577686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017337	AAAAT	2	10	580309	580318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017337	TTATG	2	10	580683	580692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017337	ATTTA	2	10	580828	580837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017337	ACAAT	2	10	582633	582642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017337	TGAAT	2	10	587100	587109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017337	GTATA	2	10	587157	587166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017337	TATAA	2	10	590874	590883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017337	GTTTA	2	10	607041	607050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017337	TAAAG	2	10	611233	611242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017337	GAAGC	2	10	612589	612598	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017337	ATATT	2	10	617367	617376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017337	AATTT	2	10	620369	620378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017337	ATAAA	2	10	628450	628459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017337	ATATT	2	10	637037	637046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017337	TTATA	2	10	643125	643134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017337	ATGAT	2	10	652570	652579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017337	TAATT	2	10	656058	656067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017337	TAAAT	2	10	665421	665430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017337	AAATT	2	10	667425	667434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017337	TAAAA	2	10	674640	674649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017337	ATTAA	2	10	676828	676837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017337	TTATT	2	10	676877	676886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017337	CAATA	2	10	676943	676952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017337	AACAT	2	10	678912	678921	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017337	TTAAT	2	10	679785	679794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017337	TGAGT	2	10	680299	680308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017337	AAATA	2	10	682050	682059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017337	ATAAA	2	10	688764	688773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017337	AAAGG	2	10	691301	691310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017337	ATATA	2	10	694405	694414	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017337	AAACT	2	10	697930	697939	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017337	TTCAC	2	10	703143	703152	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017337	TTTGT	2	10	707051	707060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017337	AATGA	2	10	707124	707133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017337	GGTTG	2	10	714126	714135	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017337	AGTAG	2	10	723834	723843	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017337	AAGTT	2	10	724283	724292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017337	AATTG	2	10	724315	724324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017337	ATTTA	2	10	726579	726588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017337	AAAGT	2	10	728826	728835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017337	AATTT	2	10	731436	731445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017337	AGAAT	2	10	733379	733388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017337	CATGA	2	10	733596	733605	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_017337	AATTT	2	10	742919	742928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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