MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017333	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017333	TAAATC	2	12	17164	17175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017333	ATTATG	2	12	22187	22198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017333	TTTAAA	2	12	34500	34511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017333	AAAAAT	2	12	46183	46194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017333	TTAAAC	2	12	50223	50234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017333	AATTTA	2	12	51999	52010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017333	GTAGTG	2	12	52042	52053	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017333	ATGATT	2	12	93614	93625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017333	TAATTC	2	12	100422	100433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017333	AACAAA	2	12	113055	113066	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017333	AATATA	2	12	119023	119034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017333	GTTTTT	2	12	166107	166118	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017333	GATTTT	2	12	182897	182908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017333	TTTATA	2	12	214296	214307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017333	ATTAAT	2	12	214319	214330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017333	TTATAT	2	12	214593	214604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017333	ATATGA	2	12	261901	261912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017333	AGTGGA	2	12	277613	277624	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017333	ATTTTT	2	12	281502	281513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017333	ATATAG	2	12	299201	299212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017333	ATAATT	2	12	305469	305480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017333	AACGAT	2	12	315678	315689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017333	ATCATT	2	12	316560	316571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017333	TAACTT	2	12	324056	324067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017333	TTAGAA	2	12	347655	347666	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017333	ATGATA	2	12	366588	366599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017333	TAAAAA	2	12	370438	370449	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017333	TTTATA	2	12	372710	372721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017333	TTTAGA	2	12	381804	381815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017333	GTAAGT	2	12	413664	413675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017333	ATATGA	2	12	420187	420198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017333	TTGTAA	2	12	429943	429954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017333	TAATAT	2	12	438303	438314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017333	AATTTG	2	12	466443	466454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017333	TAAAGA	2	12	468423	468434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017333	TAAAAT	2	12	502797	502808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017333	TGTATA	2	12	517857	517868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017333	TTTTTA	2	12	529286	529297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017333	AAAATG	2	12	534720	534731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017333	ATAGTC	2	12	540293	540304	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017333	ACGTTG	2	12	555057	555068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017333	AAAATA	2	12	555783	555794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017333	TTATAA	2	12	574798	574809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017333	AAATTT	2	12	581557	581568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017333	TTATAA	2	12	641531	641542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017333	GTTATA	2	12	642202	642213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017333	CTTAAA	2	12	650634	650645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017333	ACATGT	2	12	660606	660617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017333	ATTGCG	2	12	686663	686674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017333	TAAAAT	2	12	706002	706013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017333	TCCCAC	2	12	716153	716164	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017333	TTTTAA	2	12	716906	716917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017333	CATCAA	2	12	743713	743724	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017333	TAATTT	2	12	747953	747964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017333	TGAATA	2	12	764430	764441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017333	AGGCAT	2	12	775905	775916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017333	ATATTT	2	12	785277	785288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017333	TTAAAA	2	12	790622	790633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017333	TAGTTA	2	12	795043	795054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017333	TTTTTA	2	12	813340	813351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017333	TGAAAA	2	12	821580	821591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017333	TATGTT	2	12	838105	838116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017333	TTGTGG	2	12	908679	908690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017333	TAAAAA	2	12	911015	911026	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017333	GATTCA	2	12	914756	914767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017333	TATCAA	2	12	917532	917543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017333	TTTTGA	2	12	921219	921230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017333	GTTGGG	2	12	935712	935723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017333	AAATTA	2	12	937734	937745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017333	AAGCAC	2	12	946472	946483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017333	TAAAAT	2	12	954279	954290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017333	TTTAAT	2	12	1043488	1043499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017333	AACGGA	2	12	1075409	1075420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017333	AATAAA	2	12	1083438	1083449	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017333	CATTTA	2	12	1103560	1103571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017333	ATCATA	2	12	1105456	1105467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017333	TCAAAA	2	12	1111761	1111772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017333	ATTGCA	2	12	1112844	1112855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017333	TTTTCT	2	12	1125573	1125584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017333	CTTAGG	2	12	1167068	1167079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017333	ATTTTT	2	12	1185488	1185499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017333	ATAATT	2	12	1186285	1186296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017333	TCATTA	2	12	1191429	1191440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017333	TAATGA	2	12	1199520	1199531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017333	ACACTT	2	12	1207092	1207103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017333	AAATAT	2	12	1209125	1209136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017333	TTCGAT	2	12	1214007	1214018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017333	ATTTAT	2	12	1218075	1218086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017333	ATTATA	2	12	1222001	1222012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017333	AAATTT	2	12	1222810	1222821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017333	AAGTAA	2	12	1244506	1244517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017333	TCGTTT	2	12	1247102	1247113	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017333	TTAATT	2	12	1257819	1257830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017333	AATTAA	2	12	1260555	1260566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017333	TGATTT	2	12	1265518	1265529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017333	GAAATT	2	12	1304670	1304681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017333	AATGAT	2	12	1317443	1317454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017333	TTTCAT	2	12	1347726	1347737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017333	TATATT	2	12	1352382	1352393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017333	ATGTAT	2	12	1379183	1379194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017333	AAAGAA	2	12	1379417	1379428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017333	ATAATT	2	12	1380150	1380161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017333	TTAAAG	2	12	1384818	1384829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017333	ATTAAA	2	12	1409740	1409751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017333	ATATAA	2	12	1417778	1417789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017333	GTTTTA	2	12	1447597	1447608	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017333	TATCTT	2	12	1486856	1486867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017333	TTGATT	2	12	1486919	1486930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017333	ATTCTA	2	12	1494268	1494279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017333	AATAAA	2	12	1497120	1497131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017333	TATTCT	2	12	1544612	1544623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017333	TACTTG	2	12	1554860	1554871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017333	TTAATC	2	12	1568339	1568350	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017333	AATTGA	2	12	1568869	1568880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017333	TAATTA	2	12	1598569	1598580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017333	TTATTT	2	12	1640607	1640618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017333	AATAAA	2	12	1659912	1659923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017333	ATAAAA	2	12	1663700	1663711	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017333	ACAAGA	2	12	1669276	1669287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017333	TAAAAA	2	12	1682178	1682189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017333	TTATAG	2	12	1691310	1691321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017333	AATTTA	2	12	1699345	1699356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017333	AGCCAA	2	12	1727232	1727243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017333	TTGACT	2	12	1727251	1727262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017333	TTTAAC	2	12	1732134	1732145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017333	TTATAA	2	12	1734675	1734686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017333	ACCTTT	2	12	1744632	1744643	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017333	AGTTTT	2	12	1772983	1772994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017333	AATTAA	2	12	1774228	1774239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017333	TAAAAC	2	12	1777368	1777379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017333	TTAAAT	2	12	1784687	1784698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017333	AATTTA	2	12	1787177	1787188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017333	ATTTTC	2	12	1793212	1793223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017333	CATTAT	2	12	1841170	1841181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_017333	TAATTA	2	12	1879819	1879830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017333	TATCAA	2	12	1883736	1883747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017333	TAAAAA	2	12	1885936	1885947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_017333	ATTATA	2	12	1955273	1955284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017333	TTTTAA	2	12	2050762	2050773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017333	TAATTT	2	12	2060690	2060701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017333	AATATT	2	12	2145458	2145469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017333	TTTTAT	2	12	2149533	2149544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017333	TCAAAA	2	12	2214017	2214028	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.