MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 1309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
2	NC_017333	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387601296
3	NC_017333	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387601297
4	NC_017333	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387601297
5	NC_017333	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387601297
6	NC_017333	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
7	NC_017333	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601297
8	NC_017333	ACAATT	2	12	11256	11267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387601299
9	NC_017333	TTAGCA	2	12	11350	11361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601299
10	NC_017333	GCTTTA	2	12	17442	17453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387601304
11	NC_017333	TTTGAA	2	12	18263	18274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601304
12	NC_017333	TTGGTG	2	12	19107	19118	0 %	50 %	50 %	0 %	387601305
13	NC_017333	TAAAGG	2	12	20310	20321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601306
14	NC_017333	TTGAAG	2	12	20507	20518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601306
15	NC_017333	TGATTG	2	12	21711	21722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387601307
16	NC_017333	TGAAAT	2	12	22042	22053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601307
17	NC_017333	AAGGAA	2	12	22481	22492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601308
18	NC_017333	TGAATT	2	12	25530	25541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601309
19	NC_017333	ATTTCA	2	12	28014	28025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601311
20	NC_017333	GTTCTG	2	12	29313	29324	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387601312
21	NC_017333	AAAAGA	2	12	33970	33981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387601316
22	NC_017333	TTTTGA	2	12	34758	34769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387601317
23	NC_017333	TAAACA	2	12	35178	35189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387601318
24	NC_017333	TGGTAG	2	12	35844	35855	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387601318
25	NC_017333	ATGCCT	2	12	38498	38509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387601320
26	NC_017333	TGAAGA	2	12	38686	38697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601320
27	NC_017333	GAACAA	2	12	43336	43347	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387601325
28	NC_017333	CAAACA	2	12	43419	43430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601325
29	NC_017333	GTTTAA	2	12	44452	44463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601327
30	NC_017333	AATGAA	2	12	47419	47430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387601330
31	NC_017333	ACAACT	2	12	49484	49495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387601331
32	NC_017333	CATAAC	2	12	50565	50576	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387601333
33	NC_017333	TAAAAA	2	12	52555	52566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601335
34	NC_017333	AAATTA	2	12	52748	52759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601335
35	NC_017333	AAAATT	2	12	53137	53148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601335
36	NC_017333	GAACAA	2	12	59971	59982	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387601341
37	NC_017333	AAGTGA	2	12	60443	60454	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601342
38	NC_017333	GTTTAA	2	12	60861	60872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601343
39	NC_017333	TCATGA	2	12	64642	64653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601348
40	NC_017333	TTTGTA	2	12	68174	68185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387601349
41	NC_017333	TTTTTC	2	12	69188	69199	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387601351
42	NC_017333	TATTTT	2	12	69492	69503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387601351
43	NC_017333	ATAAAA	2	12	70684	70695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601353
44	NC_017333	ATTAAA	2	12	71589	71600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601354
45	NC_017333	AACTAA	2	12	72822	72833	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387601356
46	NC_017333	GAGAAA	2	12	73370	73381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601356
47	NC_017333	TAAAAA	2	12	74332	74343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601357
48	NC_017333	ATCATT	2	12	78769	78780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601363
49	NC_017333	AATAAA	2	12	79196	79207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601363
50	NC_017333	CATCTG	2	12	80410	80421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387601364
51	NC_017333	TTTACC	2	12	82653	82664	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387601366
52	NC_017333	ATCTTT	2	12	84862	84873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387601369
53	NC_017333	ATCTTT	2	12	85249	85260	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387601369
54	NC_017333	TAACTT	2	12	85281	85292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601369
55	NC_017333	ATATTT	2	12	87709	87720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601373
56	NC_017333	AGAGTT	2	12	88365	88376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601375
57	NC_017333	TTAATG	2	12	89688	89699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601376
58	NC_017333	TAAAAA	2	12	91805	91816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601378
59	NC_017333	TGATTT	2	12	92968	92979	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387601379
60	NC_017333	ATTTAA	2	12	93867	93878	50 %	50 %	0 %	0 %	387601380
61	NC_017333	CAGTTA	2	12	96141	96152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601383
62	NC_017333	GGGCTT	2	12	97488	97499	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387601385
63	NC_017333	ACCCTT	2	12	102913	102924	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387601392
64	NC_017333	TTTAGC	2	12	108038	108049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387601397
65	NC_017333	AAATAA	2	12	108089	108100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601397
66	NC_017333	TACAAG	2	12	112569	112580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387601402
67	NC_017333	GCTAAA	2	12	112634	112645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387601402
68	NC_017333	GTAGAA	2	12	116486	116497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601405
69	NC_017333	AACCAC	2	12	117321	117332	50 %	0 %	0 %	50 %	387601405
70	NC_017333	AACCGA	2	12	120634	120645	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387601407
71	NC_017333	CATTAC	2	12	122335	122346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601408
72	NC_017333	TATCAT	2	12	123906	123917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601409
73	NC_017333	TTTATT	2	12	124314	124325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387601410
74	NC_017333	TATTTG	2	12	124400	124411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387601410
75	NC_017333	TAAATA	2	12	125833	125844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601410
76	NC_017333	TTTTTC	2	12	127605	127616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387601411
77	NC_017333	ATCGCA	2	12	130681	130692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387601414
78	NC_017333	TTTGAA	2	12	131712	131723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601415
79	NC_017333	GGCAAT	2	12	140655	140666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387601422
80	NC_017333	TGAAGA	2	12	141491	141502	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601423
81	NC_017333	TTTCAT	2	12	142172	142183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387601424
82	NC_017333	AGAATG	2	12	144141	144152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601426
83	NC_017333	TTGAAA	2	12	144159	144170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601426
84	NC_017333	TGTTTA	2	12	146869	146880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387601431
85	NC_017333	TCGAAA	2	12	148367	148378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387601433
86	NC_017333	CATATG	2	12	152156	152167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601436
87	NC_017333	CAGATT	2	12	157799	157810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601441
88	NC_017333	AGATAT	2	12	165198	165209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601448
89	NC_017333	TGAAAG	2	12	166977	166988	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387601449
90	NC_017333	GATATG	2	12	174480	174491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601455
91	NC_017333	ATTTGA	2	12	178386	178397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601458
92	NC_017333	AAAGCT	2	12	184902	184913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387601465
93	NC_017333	ACAAAG	2	12	187417	187428	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387601467
94	NC_017333	TGTAAT	2	12	188440	188451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601468
95	NC_017333	AAAGAT	2	12	189429	189440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387601470
96	NC_017333	CAATAT	2	12	191900	191911	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387601472
97	NC_017333	AATTAG	2	12	194629	194640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601476
98	NC_017333	TTGGTA	2	12	195756	195767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387601477
99	NC_017333	GCGATT	2	12	195776	195787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387601477
100	NC_017333	AAATTT	2	12	195874	195885	50 %	50 %	0 %	0 %	387601477
101	NC_017333	ACCTGC	2	12	198776	198787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387601480
102	NC_017333	AAGATA	2	12	198922	198933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387601480
103	NC_017333	CTATTA	2	12	203706	203717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601482
104	NC_017333	TATGAT	2	12	205240	205251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387601482
105	NC_017333	ATTGAA	2	12	205691	205702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601482
106	NC_017333	AGCAAC	2	12	211641	211652	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387601487
107	NC_017333	CGGGTG	2	12	212830	212841	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387601488
108	NC_017333	CACCTT	2	12	213693	213704	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387601489
109	NC_017333	CCTTTA	2	12	214199	214210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387601489
110	NC_017333	ATTTCA	2	12	219889	219900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601494
111	NC_017333	GTAAAT	2	12	219920	219931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601494
112	NC_017333	ATTTTA	2	12	221514	221525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601496
113	NC_017333	TATCTT	2	12	226128	226139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387601499
114	NC_017333	ATTTGG	2	12	227141	227152	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387601500
115	NC_017333	GAGTTT	2	12	231052	231063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387601502
116	NC_017333	CCCTGA	2	12	233562	233573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387601504
117	NC_017333	TCCTGA	2	12	234381	234392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387601504
118	NC_017333	TCAATT	2	12	236532	236543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387601506
119	NC_017333	AATATG	2	12	237832	237843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387601507
120	NC_017333	AAAAAT	2	12	241339	241350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387601509
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233	NC_017333	GTTGGT	2	12	557137	557148	0 %	50 %	50 %	0 %	387601828
234	NC_017333	GCTATT	2	12	557209	557220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387601828
235	NC_017333	GATCAT	2	12	558805	558816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387601829
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462	NC_017333	TAAAAG	2	12	944907	944918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387602181
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