MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 2585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387601292
2	NC_017333	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	387601293
3	NC_017333	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	387601293
4	NC_017333	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	387601293
5	NC_017333	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	387601296
6	NC_017333	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	387601296
7	NC_017333	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017333	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	387601297
9	NC_017333	ATCGC	2	10	10189	10198	20 %	20 %	20 %	40 %	387601298
10	NC_017333	CGTTG	2	10	11732	11741	0 %	40 %	40 %	20 %	387601299
11	NC_017333	GTAGG	2	10	14401	14410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017333	TTATT	2	10	15442	15451	20 %	80 %	0 %	0 %	387601302
13	NC_017333	GATTT	2	10	16773	16782	20 %	60 %	20 %	0 %	387601303
14	NC_017333	TCAAT	2	10	18912	18921	40 %	40 %	0 %	20 %	387601305
15	NC_017333	AGTTA	2	10	22090	22099	40 %	40 %	20 %	0 %	387601307
16	NC_017333	TTTTA	2	10	22211	22220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017333	ATGTA	2	10	23649	23658	40 %	40 %	20 %	0 %	387601308
18	NC_017333	TCGAT	2	10	23813	23822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017333	ATATT	2	10	24351	24360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017333	AATTT	2	10	25103	25112	40 %	60 %	0 %	0 %	387601309
21	NC_017333	ACCAA	2	10	26380	26389	60 %	0 %	0 %	40 %	387601310
22	NC_017333	ATCAA	2	10	27092	27101	60 %	20 %	0 %	20 %	387601310
23	NC_017333	GAAAC	2	10	27713	27722	60 %	0 %	20 %	20 %	387601311
24	NC_017333	GAAGT	2	10	27863	27872	40 %	20 %	40 %	0 %	387601311
25	NC_017333	ATTAT	2	10	29506	29515	40 %	60 %	0 %	0 %	387601312
26	NC_017333	AACGA	2	10	29579	29588	60 %	0 %	20 %	20 %	387601312
27	NC_017333	AAACG	2	10	31427	31436	60 %	0 %	20 %	20 %	387601314
28	NC_017333	AAGGT	2	10	32599	32608	40 %	20 %	40 %	0 %	387601314
29	NC_017333	TATGA	2	10	32796	32805	40 %	40 %	20 %	0 %	387601314
30	NC_017333	GTTGT	2	10	33189	33198	0 %	60 %	40 %	0 %	387601314
31	NC_017333	CATTA	2	10	34024	34033	40 %	40 %	0 %	20 %	387601316
32	NC_017333	CAATT	2	10	34471	34480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017333	GAATA	2	10	35166	35175	60 %	20 %	20 %	0 %	387601318
34	NC_017333	ATAAA	2	10	35645	35654	80 %	20 %	0 %	0 %	387601318
35	NC_017333	AAATC	2	10	40506	40515	60 %	20 %	0 %	20 %	387601322
36	NC_017333	CAAAC	2	10	40619	40628	60 %	0 %	0 %	40 %	387601322
37	NC_017333	TATGA	2	10	41030	41039	40 %	40 %	20 %	0 %	387601324
38	NC_017333	AAGCT	2	10	42255	42264	40 %	20 %	20 %	20 %	387601324
39	NC_017333	GAAAT	2	10	42734	42743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017333	CATGG	2	10	44260	44269	20 %	20 %	40 %	20 %	387601327
41	NC_017333	ATGAG	2	10	46057	46066	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017333	TGAAT	2	10	46404	46413	40 %	40 %	20 %	0 %	387601329
43	NC_017333	TTGGT	2	10	46446	46455	0 %	60 %	40 %	0 %	387601329
44	NC_017333	AATAT	2	10	46514	46523	60 %	40 %	0 %	0 %	387601329
45	NC_017333	TTCGT	2	10	46725	46734	0 %	60 %	20 %	20 %	387601329
46	NC_017333	CAAAA	2	10	47085	47094	80 %	0 %	0 %	20 %	387601330
47	NC_017333	AAATT	2	10	49184	49193	60 %	40 %	0 %	0 %	387601331
48	NC_017333	GCCAT	2	10	50416	50425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017333	TCAAA	2	10	52487	52496	60 %	20 %	0 %	20 %	387601335
50	NC_017333	AAACT	2	10	53426	53435	60 %	20 %	0 %	20 %	387601335
51	NC_017333	ATAAA	2	10	53532	53541	80 %	20 %	0 %	0 %	387601335
52	NC_017333	AATAA	2	10	54011	54020	80 %	20 %	0 %	0 %	387601335
53	NC_017333	TATAG	2	10	54208	54217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017333	AGCTA	2	10	54462	54471	40 %	20 %	20 %	20 %	387601336
55	NC_017333	TAGAT	2	10	54633	54642	40 %	40 %	20 %	0 %	387601336
56	NC_017333	TATGA	2	10	57600	57609	40 %	40 %	20 %	0 %	387601339
57	NC_017333	CGGAG	2	10	58056	58065	20 %	0 %	60 %	20 %	387601339
58	NC_017333	AAATA	2	10	58789	58798	80 %	20 %	0 %	0 %	387601339
59	NC_017333	TAAAT	2	10	59418	59427	60 %	40 %	0 %	0 %	387601340
60	NC_017333	GAAAA	2	10	60219	60228	80 %	0 %	20 %	0 %	387601342
61	NC_017333	AAGGA	2	10	61669	61678	60 %	0 %	40 %	0 %	387601344
62	NC_017333	GAAAA	2	10	63287	63296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017333	ATGTT	2	10	63305	63314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017333	CAAAA	2	10	63782	63791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017333	TTGAA	2	10	63902	63911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017333	GAAGG	2	10	64168	64177	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017333	AAAAT	2	10	65775	65784	80 %	20 %	0 %	0 %	387601348
68	NC_017333	TAATG	2	10	66121	66130	40 %	40 %	20 %	0 %	387601348
69	NC_017333	GATTA	2	10	67392	67401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017333	GGCCA	2	10	68403	68412	20 %	0 %	40 %	40 %	387601350
71	NC_017333	AAAAT	2	10	70152	70161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017333	AAAGT	2	10	71749	71758	60 %	20 %	20 %	0 %	387601355
73	NC_017333	AATGA	2	10	73438	73447	60 %	20 %	20 %	0 %	387601356
74	NC_017333	TAAGT	2	10	73599	73608	40 %	40 %	20 %	0 %	387601356
75	NC_017333	AGGAA	2	10	73990	73999	60 %	0 %	40 %	0 %	387601356
76	NC_017333	GTCCT	2	10	75068	75077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017333	AATTC	2	10	75387	75396	40 %	40 %	0 %	20 %	387601358
78	NC_017333	TTGTC	2	10	77934	77943	0 %	60 %	20 %	20 %	387601362
79	NC_017333	TTTTC	2	10	78633	78642	0 %	80 %	0 %	20 %	387601363
80	NC_017333	TTTTC	2	10	79341	79350	0 %	80 %	0 %	20 %	387601363
81	NC_017333	ATTAT	2	10	79595	79604	40 %	60 %	0 %	0 %	387601363
82	NC_017333	AGAAA	2	10	79918	79927	80 %	0 %	20 %	0 %	387601363
83	NC_017333	ATAAA	2	10	80798	80807	80 %	20 %	0 %	0 %	387601364
84	NC_017333	TAAAA	2	10	81537	81546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017333	TAAAC	2	10	82734	82743	60 %	20 %	0 %	20 %	387601366
86	NC_017333	GCTTT	2	10	83015	83024	0 %	60 %	20 %	20 %	387601366
87	NC_017333	CTTTT	2	10	83175	83184	0 %	80 %	0 %	20 %	387601366
88	NC_017333	GTAAA	2	10	84281	84290	60 %	20 %	20 %	0 %	387601367
89	NC_017333	TTTAC	2	10	85208	85217	20 %	60 %	0 %	20 %	387601369
90	NC_017333	CTTTT	2	10	85265	85274	0 %	80 %	0 %	20 %	387601369
91	NC_017333	TAATT	2	10	88172	88181	40 %	60 %	0 %	0 %	387601374
92	NC_017333	AAAAT	2	10	88301	88310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017333	AATGA	2	10	88798	88807	60 %	20 %	20 %	0 %	387601375
94	NC_017333	TATAA	2	10	89645	89654	60 %	40 %	0 %	0 %	387601376
95	NC_017333	GACAT	2	10	91505	91514	40 %	20 %	20 %	20 %	387601377
96	NC_017333	GAAAA	2	10	91625	91634	80 %	0 %	20 %	0 %	387601377
97	NC_017333	TTTAT	2	10	92135	92144	20 %	80 %	0 %	0 %	387601378
98	NC_017333	TAAAA	2	10	92950	92959	80 %	20 %	0 %	0 %	387601379
99	NC_017333	ATTAT	2	10	93851	93860	40 %	60 %	0 %	0 %	387601380
100	NC_017333	AAAAG	2	10	94922	94931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017333	TTTCA	2	10	96308	96317	20 %	60 %	0 %	20 %	387601383
102	NC_017333	AAAGT	2	10	96807	96816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017333	ATTGC	2	10	96911	96920	20 %	40 %	20 %	20 %	387601385
104	NC_017333	TGTAA	2	10	97262	97271	40 %	40 %	20 %	0 %	387601385
105	NC_017333	GTTGT	2	10	98600	98609	0 %	60 %	40 %	0 %	387601387
106	NC_017333	ATTTA	2	10	100582	100591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017333	AACAA	2	10	101174	101183	80 %	0 %	0 %	20 %	387601390
108	NC_017333	TTTTA	2	10	101536	101545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017333	ATTTT	2	10	104200	104209	20 %	80 %	0 %	0 %	387601394
110	NC_017333	TATGG	2	10	106213	106222	20 %	40 %	40 %	0 %	387601396
111	NC_017333	TAACT	2	10	106518	106527	40 %	40 %	0 %	20 %	387601396
112	NC_017333	ATTCA	2	10	107491	107500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017333	TATAT	2	10	107752	107761	40 %	60 %	0 %	0 %	387601397
114	NC_017333	CTAAT	2	10	108340	108349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017333	GTTCT	2	10	108971	108980	0 %	60 %	20 %	20 %	387601398
116	NC_017333	TGATG	2	10	109144	109153	20 %	40 %	40 %	0 %	387601398
117	NC_017333	CAATT	2	10	109447	109456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017333	ATTTA	2	10	110072	110081	40 %	60 %	0 %	0 %	387601399
119	NC_017333	TATCA	2	10	110518	110527	40 %	40 %	0 %	20 %	387601400
120	NC_017333	TTAAA	2	10	110959	110968	60 %	40 %	0 %	0 %	387601400
121	NC_017333	ATATA	2	10	113692	113701	60 %	40 %	0 %	0 %	387601403
122	NC_017333	ATTGC	2	10	114629	114638	20 %	40 %	20 %	20 %	387601404
123	NC_017333	TCATT	2	10	114817	114826	20 %	60 %	0 %	20 %	387601404
124	NC_017333	CATGG	2	10	116033	116042	20 %	20 %	40 %	20 %	387601404
125	NC_017333	TGAAA	2	10	116701	116710	60 %	20 %	20 %	0 %	387601405
126	NC_017333	TCAAT	2	10	117073	117082	40 %	40 %	0 %	20 %	387601405
127	NC_017333	GTATT	2	10	117562	117571	20 %	60 %	20 %	0 %	387601406
128	NC_017333	GTAAT	2	10	123442	123451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017333	CAATT	2	10	123874	123883	40 %	40 %	0 %	20 %	387601409
130	NC_017333	ATGTT	2	10	124708	124717	20 %	60 %	20 %	0 %	387601410
131	NC_017333	TTGCG	2	10	125279	125288	0 %	40 %	40 %	20 %	387601410
132	NC_017333	AGTTA	2	10	126743	126752	40 %	40 %	20 %	0 %	387601411
133	NC_017333	TAAAA	2	10	127729	127738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017333	AGATG	2	10	130116	130125	40 %	20 %	40 %	0 %	387601413
135	NC_017333	GGTGA	2	10	130712	130721	20 %	20 %	60 %	0 %	387601414
136	NC_017333	GAAAA	2	10	134149	134158	80 %	0 %	20 %	0 %	387601417
137	NC_017333	AATCA	2	10	137325	137334	60 %	20 %	0 %	20 %	387601420
138	NC_017333	ATTTT	2	10	138023	138032	20 %	80 %	0 %	0 %	387601421
139	NC_017333	ATCAA	2	10	138050	138059	60 %	20 %	0 %	20 %	387601421
140	NC_017333	ATCAC	2	10	139283	139292	40 %	20 %	0 %	40 %	387601422
141	NC_017333	AACGA	2	10	139960	139969	60 %	0 %	20 %	20 %	387601422
142	NC_017333	ACACA	2	10	142016	142025	60 %	0 %	0 %	40 %	387601424
143	NC_017333	GACAA	2	10	143167	143176	60 %	0 %	20 %	20 %	387601425
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146	NC_017333	TCATT	2	10	146130	146139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017333	TATCT	2	10	146488	146497	20 %	60 %	0 %	20 %	387601430
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174	NC_017333	CGTTT	2	10	192427	192436	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_017333	ATGCA	2	10	201502	201511	40 %	20 %	20 %	20 %	387601482
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254	NC_017333	TAAAA	2	10	281727	281736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017333	AAGCG	2	10	282442	282451	40 %	0 %	40 %	20 %	387601541
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257	NC_017333	AAATT	2	10	283523	283532	60 %	40 %	0 %	0 %	387601543
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