MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 37779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
2	NC_017333	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
3	NC_017333	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601292
4	NC_017333	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601292
5	NC_017333	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
6	NC_017333	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601292
7	NC_017333	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
8	NC_017333	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601292
9	NC_017333	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
10	NC_017333	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601292
11	NC_017333	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601292
12	NC_017333	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
13	NC_017333	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
14	NC_017333	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601292
15	NC_017333	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
16	NC_017333	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
17	NC_017333	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
18	NC_017333	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601292
19	NC_017333	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
20	NC_017333	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
21	NC_017333	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
22	NC_017333	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601292
23	NC_017333	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601292
24	NC_017333	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601292
25	NC_017333	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
26	NC_017333	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601292
27	NC_017333	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
28	NC_017333	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601292
29	NC_017333	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
30	NC_017333	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
31	NC_017333	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601293
32	NC_017333	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
33	NC_017333	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601293
34	NC_017333	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
35	NC_017333	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
36	NC_017333	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601293
37	NC_017333	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
38	NC_017333	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
39	NC_017333	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
40	NC_017333	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601293
41	NC_017333	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
42	NC_017333	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601293
43	NC_017333	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601293
44	NC_017333	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
45	NC_017333	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601293
46	NC_017333	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
47	NC_017333	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601293
48	NC_017333	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601293
49	NC_017333	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601293
50	NC_017333	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601293
51	NC_017333	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601293
52	NC_017333	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601294
53	NC_017333	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601294
54	NC_017333	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601294
55	NC_017333	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601294
56	NC_017333	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
57	NC_017333	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601295
58	NC_017333	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601295
59	NC_017333	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387601295
60	NC_017333	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601295
61	NC_017333	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601295
62	NC_017333	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601295
63	NC_017333	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601295
64	NC_017333	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
65	NC_017333	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601295
66	NC_017333	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601295
67	NC_017333	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
68	NC_017333	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
69	NC_017333	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601295
70	NC_017333	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601295
71	NC_017333	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601296
72	NC_017333	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601296
73	NC_017333	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601296
74	NC_017333	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
75	NC_017333	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
76	NC_017333	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
77	NC_017333	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
78	NC_017333	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
79	NC_017333	ACA	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601296
80	NC_017333	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
81	NC_017333	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
82	NC_017333	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
83	NC_017333	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601296
84	NC_017333	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601296
85	NC_017333	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601296
86	NC_017333	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
87	NC_017333	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
88	NC_017333	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
89	NC_017333	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387601296
90	NC_017333	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
91	NC_017333	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
92	NC_017333	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
93	NC_017333	CTG	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601296
94	NC_017333	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
95	NC_017333	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601296
96	NC_017333	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601296
97	NC_017333	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601296
98	NC_017333	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601296
99	NC_017333	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601297
100	NC_017333	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601297
101	NC_017333	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387601297
102	NC_017333	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601297
103	NC_017333	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
104	NC_017333	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387601297
105	NC_017333	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601297
106	NC_017333	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601297
107	NC_017333	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601297
108	NC_017333	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
109	NC_017333	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387601297
110	NC_017333	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601297
111	NC_017333	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601297
112	NC_017333	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601297
113	NC_017333	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387601297
114	NC_017333	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601297
115	NC_017333	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601297
116	NC_017333	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387601297
117	NC_017333	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601297
118	NC_017333	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
119	NC_017333	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387601297
120	NC_017333	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
121	NC_017333	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387601297
122	NC_017333	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601297
123	NC_017333	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387601297
124	NC_017333	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601297
125	NC_017333	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601297
126	NC_017333	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387601297
127	NC_017333	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
128	NC_017333	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387601297
129	NC_017333	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387601297
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131	NC_017333	TGA	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387601297
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