MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017331	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017331	TAAATC	2	12	17154	17165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017331	TTTAAA	2	12	34354	34365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017331	TCTCAT	2	12	44820	44831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017331	TAAAAT	2	12	53812	53823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017331	ATAATT	2	12	54397	54408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017331	TGAATT	2	12	55147	55158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017331	GTCTAA	2	12	57939	57950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017331	TAAAGC	2	12	72709	72720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017331	ATATTA	2	12	73414	73425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017331	AAAAAT	2	12	75486	75497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017331	ATTTGG	2	12	94678	94689	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017331	AATATA	2	12	126273	126284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017331	TTAACA	2	12	136132	136143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017331	TAAGAA	2	12	158501	158512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017331	GTTTTT	2	12	172566	172577	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017331	TTTATA	2	12	220938	220949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017331	ATTAAT	2	12	220961	220972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017331	AAATTT	2	12	245477	245488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017331	AGTGGA	2	12	280845	280856	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017331	ATATAG	2	12	302616	302627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017331	ATAATT	2	12	308887	308898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017331	AATTAT	2	12	316309	316320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017331	AACGAT	2	12	319013	319024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017331	TAACTT	2	12	327388	327399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017331	TAAAAA	2	12	376462	376473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017331	GTAAAT	2	12	413479	413490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017331	TAAAAT	2	12	422337	422348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017331	ATATGA	2	12	422381	422392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017331	TTCATT	2	12	426836	426847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017331	TTGTAA	2	12	432139	432150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017331	AATGTA	2	12	470001	470012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017331	AATTTG	2	12	470108	470119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017331	TAAAGA	2	12	472081	472092	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017331	TTGTCT	2	12	493328	493339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017331	TTTTAT	2	12	518105	518116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017331	TTGAAA	2	12	524947	524958	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017331	TGTATA	2	12	540343	540354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017331	TTTTTA	2	12	547601	547612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017331	AAAATG	2	12	553034	553045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017331	ACGTTG	2	12	573481	573492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017331	AAAATA	2	12	574205	574216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017331	TATGGT	2	12	582343	582354	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017331	TTATAA	2	12	593518	593529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017331	AAATTT	2	12	600277	600288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017331	TTATAA	2	12	655416	655427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017331	GTTATA	2	12	656087	656098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017331	CTTAAA	2	12	664519	664530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017331	ACATGT	2	12	674489	674500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017331	ATTGCG	2	12	703683	703694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017331	AATGAT	2	12	707601	707612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017331	TAGATG	2	12	707674	707685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017331	TAAAAT	2	12	722995	723006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017331	TTTTAA	2	12	735101	735112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017331	CATTAT	2	12	751412	751423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017331	CATCAA	2	12	761810	761821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017331	TAATTT	2	12	766050	766061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017331	TGAATA	2	12	782528	782539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017331	GGATTC	2	12	793879	793890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017331	AAATAT	2	12	796671	796682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017331	TTAAAA	2	12	808674	808685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017331	TAGTTA	2	12	813109	813120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017331	TTTTTA	2	12	831384	831395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017331	TGAAAA	2	12	839626	839637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017331	AATGAT	2	12	868396	868407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017331	ACAAAA	2	12	908527	908538	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017331	TAAAAA	2	12	927669	927680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017331	TATCAA	2	12	934151	934162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017331	TTTTGA	2	12	937924	937935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017331	TCATTT	2	12	943917	943928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017331	TAAAAA	2	12	947004	947015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017331	TAATTA	2	12	955982	955993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017331	AAATTA	2	12	968591	968602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017331	AAGCAC	2	12	977322	977333	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017331	TAAAAT	2	12	984998	985009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017331	TTTAAT	2	12	1057666	1057677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017331	ACAATA	2	12	1075062	1075073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017331	AACGGA	2	12	1089584	1089595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017331	AAAAGC	2	12	1094183	1094194	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017331	CATTTA	2	12	1119504	1119515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017331	ATCATA	2	12	1121399	1121410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017331	TCAAAA	2	12	1127907	1127918	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017331	ATTGCA	2	12	1128986	1128997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017331	TTTTCT	2	12	1141714	1141725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017331	TTTATA	2	12	1177727	1177738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017331	GAATTA	2	12	1184300	1184311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017331	ATTTTT	2	12	1201677	1201688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017331	ATAATT	2	12	1202474	1202485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017331	TAATGA	2	12	1215513	1215524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017331	GTAAAA	2	12	1228504	1228515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017331	ATTTAT	2	12	1236026	1236037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017331	ATTATA	2	12	1239944	1239955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017331	AAATTT	2	12	1240753	1240764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017331	AAGTAA	2	12	1262456	1262467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017331	TCGTTT	2	12	1265583	1265594	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017331	TTAATT	2	12	1276299	1276310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017331	AATTAA	2	12	1279035	1279046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017331	AGTAAT	2	12	1322210	1322221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017331	GAAATT	2	12	1323938	1323949	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017331	AATGAT	2	12	1336713	1336724	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017331	TTTCAT	2	12	1366996	1367007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017331	TATATT	2	12	1371655	1371666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017331	CATATT	2	12	1396724	1396735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017331	ATGTAT	2	12	1397345	1397356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017331	AAAGAA	2	12	1397577	1397588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017331	GTAAAA	2	12	1401725	1401736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017331	TTAAAG	2	12	1404164	1404175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017331	ATTAAA	2	12	1432771	1432782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017331	ATATAA	2	12	1440753	1440764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017331	AAAATA	2	12	1454821	1454832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017331	GTTTTA	2	12	1470568	1470579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017331	TAAAAT	2	12	1486143	1486154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017331	TATCTT	2	12	1508979	1508990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017331	TTGATT	2	12	1509042	1509053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017331	ATTCTA	2	12	1516382	1516393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017331	AATAAA	2	12	1519977	1519988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017331	TATTCT	2	12	1567403	1567414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017331	TACTTG	2	12	1577650	1577661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017331	AAAAAT	2	12	1577666	1577677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017331	TTAATC	2	12	1591173	1591184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017331	TATGAT	2	12	1631088	1631099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017331	AATAAA	2	12	1636203	1636214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017331	ATAAAA	2	12	1639991	1640002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017331	ATTATC	2	12	1643636	1643647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017331	ACAAGA	2	12	1645568	1645579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017331	TAAAAA	2	12	1658470	1658481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017331	TTATAG	2	12	1667603	1667614	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017331	AATTTA	2	12	1675638	1675649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017331	AGCCAA	2	12	1703524	1703535	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017331	TTGACT	2	12	1703543	1703554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017331	TTTAAC	2	12	1708427	1708438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017331	TTATAA	2	12	1710909	1710920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017331	ACCTTT	2	12	1720867	1720878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017331	TTTTAT	2	12	1723335	1723346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017331	TTTTAA	2	12	1723572	1723583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017331	TTTTAC	2	12	1725065	1725076	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017331	ATATTA	2	12	1725956	1725967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017331	AGTTTT	2	12	1750323	1750334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017331	AATTAA	2	12	1751568	1751579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017331	TAAAAC	2	12	1754708	1754719	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017331	TTAAAT	2	12	1762027	1762038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017331	AATTTA	2	12	1764517	1764528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017331	ATTTTC	2	12	1770552	1770563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_017331	TAAAAA	2	12	1810054	1810065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017331	TTTCAT	2	12	1831908	1831919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_017331	TAATTA	2	12	1865236	1865247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017331	TATCAA	2	12	1869150	1869161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_017331	TAAAAA	2	12	1871350	1871361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017331	CTTTGT	2	12	1878321	1878332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_017331	TTTTAC	2	12	1933819	1933830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_017331	ATTATA	2	12	1945813	1945824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017331	ATCAAA	2	12	1958140	1958151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_017331	TATAAT	2	12	1964559	1964570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017331	ATTCAA	2	12	1970543	1970554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017331	TAAAAA	2	12	1981287	1981298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017331	TAAAAA	2	12	1981544	1981555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017331	TTTATT	2	12	1983062	1983073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017331	TTCTAC	2	12	1994420	1994431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_017331	ATTTAA	2	12	2788802	2788813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017331	AATTAA	2	12	2793303	2793314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_017331	ATTTCG	2	12	2805581	2805592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_017331	TTTTGT	2	12	2817045	2817056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017331	CAATTG	2	12	2833796	2833807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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250	NC_017331	ATTTAT	3	18	2856706	2856723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017331	TTTGAA	2	12	2861166	2861177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017331	TTATTT	2	12	2870008	2870019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017331	TCATTT	2	12	2898708	2898719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_017331	GTAAAT	2	12	2914059	2914070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017331	TAGTAT	2	12	2924025	2924036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017331	GTTAAA	2	12	2928605	2928616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017331	TTAATT	2	12	2933028	2933039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017331	ATTGTT	2	12	2933442	2933453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017331	ATAATT	2	12	2989259	2989270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017331	ATTTTA	2	12	3008421	3008432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017331	CTATTT	2	12	3008969	3008980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_017331	ATTCGA	2	12	3013301	3013312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
263	NC_017331	GATTTT	2	12	3030221	3030232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017331	ATATAA	2	12	3036468	3036479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.