MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20

Total Repeats: 1332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017331	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141640
2	NC_017331	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141644
3	NC_017331	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387141644
4	NC_017331	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141644
5	NC_017331	ACAATT	2	12	11250	11261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387141646
6	NC_017331	TAGCAT	2	12	11345	11356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141646
7	NC_017331	AGTTCA	2	12	16360	16371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141650
8	NC_017331	GCTTTA	2	12	17432	17443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141651
9	NC_017331	TTTGAA	2	12	18253	18264	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141651
10	NC_017331	TAAAGG	2	12	20300	20311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387141653
11	NC_017331	TTGAAG	2	12	20497	20508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141653
12	NC_017331	TGATTG	2	12	21701	21712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141654
13	NC_017331	AAGGAA	2	12	22470	22481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141655
14	NC_017331	TGAATT	2	12	25385	25396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141656
15	NC_017331	CGTATT	2	12	26466	26477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141657
16	NC_017331	ATTTCA	2	12	27869	27880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141658
17	NC_017331	GTTCTG	2	12	29168	29179	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387141659
18	NC_017331	ATCAGC	2	12	31183	31194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387141661
19	NC_017331	AAAAGA	2	12	33824	33835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387141662
20	NC_017331	TTTTGA	2	12	34612	34623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387141663
21	NC_017331	TAAACA	2	12	35031	35042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387141664
22	NC_017331	TGGTAG	2	12	35697	35708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387141664
23	NC_017331	ATGCCT	2	12	38353	38364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387141665
24	NC_017331	TGAAGA	2	12	38541	38552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387141665
25	NC_017331	GAACAA	2	12	43997	44008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387141670
26	NC_017331	ATGTTA	2	12	45789	45800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141672
27	NC_017331	ATTTTT	2	12	46427	46438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387141673
28	NC_017331	CCATGC	2	12	47589	47600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387141673
29	NC_017331	TTAATT	2	12	48221	48232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141674
30	NC_017331	AGAAAA	2	12	48411	48422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387141674
31	NC_017331	GAAAAT	2	12	54009	54020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141681
32	NC_017331	GTTTAA	2	12	58830	58841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141685
33	NC_017331	GTTTAA	2	12	66623	66634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141694
34	NC_017331	GTTTAA	2	12	68465	68476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141696
35	NC_017331	GAACAG	2	12	71865	71876	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387141698
36	NC_017331	GTTTAA	2	12	73715	73726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141699
37	NC_017331	AATGAA	2	12	76722	76733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141703
38	NC_017331	ACAACT	2	12	78787	78798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387141704
39	NC_017331	TTCATC	2	12	86870	86881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387141712
40	NC_017331	TTTTCT	2	12	90248	90259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387141715
41	NC_017331	AATTAA	2	12	90438	90449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141715
42	NC_017331	GGCATG	2	12	91069	91080	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387141716
43	NC_017331	TAAAAA	2	12	92231	92242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387141716
44	NC_017331	TTCTTT	2	12	100552	100563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387141726
45	NC_017331	TTAAAC	2	12	100977	100988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387141727
46	NC_017331	GTAAAA	2	12	102231	102242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141728
47	NC_017331	TTAAAA	2	12	102321	102332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141728
48	NC_017331	GGGCTT	2	12	107507	107518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387141732
49	NC_017331	ACCCTT	2	12	112930	112941	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387141737
50	NC_017331	TTTAGC	2	12	114838	114849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141740
51	NC_017331	AAATAA	2	12	114889	114900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387141740
52	NC_017331	AAAAGA	2	12	117067	117078	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387141741
53	NC_017331	TACAAG	2	12	119815	119826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141743
54	NC_017331	GTAGAA	2	12	123736	123747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387141746
55	NC_017331	AACCAC	2	12	124571	124582	50 %	0 %	0 %	50 %	387141746
56	NC_017331	AACCGA	2	12	127884	127895	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387141748
57	NC_017331	CATTAC	2	12	129585	129596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141749
58	NC_017331	CTTTTA	2	12	129654	129665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387141749
59	NC_017331	TATCAT	2	12	131156	131167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141750
60	NC_017331	TTTATT	2	12	131564	131575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387141751
61	NC_017331	TATTTG	2	12	131650	131661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387141751
62	NC_017331	TAAATA	2	12	133083	133094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141751
63	NC_017331	TTTTTC	2	12	134681	134692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387141752
64	NC_017331	TTTGAA	2	12	138788	138799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141756
65	NC_017331	TACCAT	2	12	142224	142235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141759
66	NC_017331	TGAAGA	2	12	148579	148590	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387141763
67	NC_017331	TTTCAT	2	12	149260	149271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387141764
68	NC_017331	TGTTTA	2	12	153478	153489	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387141768
69	NC_017331	TCGAAA	2	12	154976	154987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141770
70	NC_017331	CTATTG	2	12	157562	157573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141772
71	NC_017331	CATATG	2	12	158765	158776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141773
72	NC_017331	CAGATT	2	12	164258	164269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141778
73	NC_017331	AGATAT	2	12	171657	171668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141785
74	NC_017331	GATATG	2	12	180939	180950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141792
75	NC_017331	TAATGA	2	12	183915	183926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141794
76	NC_017331	ATTTGA	2	12	184845	184856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141795
77	NC_017331	TATAAA	2	12	185376	185387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141796
78	NC_017331	GATTTT	2	12	189538	189549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387141800
79	NC_017331	ACAAAG	2	12	194058	194069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387141804
80	NC_017331	TGTAAT	2	12	195082	195093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141805
81	NC_017331	AAAGAT	2	12	196071	196082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141807
82	NC_017331	CAATAT	2	12	198543	198554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387141808
83	NC_017331	AATTAG	2	12	201272	201283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141812
84	NC_017331	TTGGTA	2	12	202399	202410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141813
85	NC_017331	GCGATT	2	12	202419	202430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387141813
86	NC_017331	AAATTT	2	12	202517	202528	50 %	50 %	0 %	0 %	387141813
87	NC_017331	TTTGGA	2	12	205082	205093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141816
88	NC_017331	ACCTGC	2	12	205417	205428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387141816
89	NC_017331	AAGATA	2	12	205563	205574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141816
90	NC_017331	CTATTA	2	12	210348	210359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141818
91	NC_017331	TATGAT	2	12	211882	211893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141818
92	NC_017331	TTGAAA	2	12	212334	212345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141818
93	NC_017331	AGCAAC	2	12	218285	218296	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387141822
94	NC_017331	CACCTT	2	12	220337	220348	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387141824
95	NC_017331	GTAAAT	2	12	224580	224591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141827
96	NC_017331	ATTTTA	2	12	226174	226185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141828
97	NC_017331	TATCTT	2	12	230788	230799	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387141831
98	NC_017331	ATTTGG	2	12	231801	231812	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141832
99	NC_017331	GAGTTT	2	12	235145	235156	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141834
100	NC_017331	CCCTGA	2	12	237654	237665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387141836
101	NC_017331	TCCTGA	2	12	238473	238484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387141836
102	NC_017331	TCAATT	2	12	240624	240635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141838
103	NC_017331	AATATG	2	12	241924	241935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141839
104	NC_017331	AAGGAC	2	12	242248	242259	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387141839
105	NC_017331	AGGACA	2	12	246554	246565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387141842
106	NC_017331	ACATTT	2	12	246890	246901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141842
107	NC_017331	TTCTTG	2	12	251818	251829	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387141846
108	NC_017331	AGCCAT	2	12	275889	275900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387141864
109	NC_017331	TGGTAT	2	12	292427	292438	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387141877
110	NC_017331	TATAGA	2	12	295781	295792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387141881
111	NC_017331	ACGATG	2	12	302952	302963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387141886
112	NC_017331	AGAATC	2	12	310515	310526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141891
113	NC_017331	GCAATT	2	12	314391	314402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141895
114	NC_017331	CAATTG	2	12	314953	314964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141895
115	NC_017331	ATAAAG	2	12	317667	317678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387141898
116	NC_017331	GACATT	2	12	319366	319377	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141899
117	NC_017331	GATTTC	2	12	321185	321196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141901
118	NC_017331	TTCATA	2	12	321755	321766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387141902
119	NC_017331	GATTAT	2	12	326162	326173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387141906
120	NC_017331	ATGGTG	2	12	326295	326306	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387141906
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122	NC_017331	TAATGG	2	12	327890	327901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141907
123	NC_017331	TCTTCA	2	12	332261	332272	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387141911
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125	NC_017331	CTAAAG	2	12	333464	333475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141912
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231	NC_017331	CGTATT	2	12	607680	607691	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387142190
232	NC_017331	CGAAAC	2	12	609097	609108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387142191
233	NC_017331	CTTTAT	2	12	610361	610372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387142191
234	NC_017331	TTTATA	2	12	611733	611744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387142192
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340	NC_017331	TATACC	2	12	752604	752615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387142316
341	NC_017331	GTTTAA	2	12	752972	752983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387142317
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458	NC_017331	GTACTT	2	12	992839	992850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387142560
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