MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20

Total Repeats: 2008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017331	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387141639
2	NC_017331	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	387141640
3	NC_017331	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	387141640
4	NC_017331	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	387141640
5	NC_017331	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	387141643
6	NC_017331	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	387141643
7	NC_017331	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	387141644
8	NC_017331	TTATT	2	10	15433	15442	20 %	80 %	0 %	0 %	387141649
9	NC_017331	CGATT	2	10	16762	16771	20 %	40 %	20 %	20 %	387141650
10	NC_017331	TCAAT	2	10	18902	18911	40 %	40 %	0 %	20 %	387141652
11	NC_017331	AGTTA	2	10	22080	22089	40 %	40 %	20 %	0 %	387141654
12	NC_017331	ATGTA	2	10	23638	23647	40 %	40 %	20 %	0 %	387141655
13	NC_017331	ACCAA	2	10	26235	26244	60 %	0 %	0 %	40 %	387141657
14	NC_017331	ATCAA	2	10	26947	26956	60 %	20 %	0 %	20 %	387141657
15	NC_017331	GAAAC	2	10	27568	27577	60 %	0 %	20 %	20 %	387141658
16	NC_017331	GAAGT	2	10	27718	27727	40 %	20 %	40 %	0 %	387141658
17	NC_017331	ATTAT	2	10	29361	29370	40 %	60 %	0 %	0 %	387141659
18	NC_017331	AACGA	2	10	29434	29443	60 %	0 %	20 %	20 %	387141659
19	NC_017331	AAACG	2	10	31279	31288	60 %	0 %	20 %	20 %	387141661
20	NC_017331	TGGCG	2	10	31964	31973	0 %	20 %	60 %	20 %	387141661
21	NC_017331	AAGGT	2	10	32451	32460	40 %	20 %	40 %	0 %	387141661
22	NC_017331	TATGA	2	10	32648	32657	40 %	40 %	20 %	0 %	387141661
23	NC_017331	CATTA	2	10	33878	33887	40 %	40 %	0 %	20 %	387141662
24	NC_017331	GAATA	2	10	35019	35028	60 %	20 %	20 %	0 %	387141664
25	NC_017331	ATAAA	2	10	35498	35507	80 %	20 %	0 %	0 %	387141664
26	NC_017331	AAATC	2	10	40361	40370	60 %	20 %	0 %	20 %	387141667
27	NC_017331	CAAAC	2	10	40474	40483	60 %	0 %	0 %	40 %	387141667
28	NC_017331	TAAAT	2	10	43444	43453	60 %	40 %	0 %	0 %	387141669
29	NC_017331	AAAAT	2	10	43539	43548	80 %	20 %	0 %	0 %	387141669
30	NC_017331	ATTAA	2	10	45812	45821	60 %	40 %	0 %	0 %	387141672
31	NC_017331	ACGCA	2	10	46044	46053	40 %	0 %	20 %	40 %	387141672
32	NC_017331	GGATG	2	10	46067	46076	20 %	20 %	60 %	0 %	387141672
33	NC_017331	GAATC	2	10	48296	48305	40 %	20 %	20 %	20 %	387141674
34	NC_017331	GTAAT	2	10	49175	49184	40 %	40 %	20 %	0 %	387141675
35	NC_017331	TTATC	2	10	52696	52705	20 %	60 %	0 %	20 %	387141678
36	NC_017331	ACGAA	2	10	53183	53192	60 %	0 %	20 %	20 %	387141679
37	NC_017331	TTATT	2	10	53875	53884	20 %	80 %	0 %	0 %	387141681
38	NC_017331	AATAA	2	10	54365	54374	80 %	20 %	0 %	0 %	387141681
39	NC_017331	ATGGA	2	10	54802	54811	40 %	20 %	40 %	0 %	387141682
40	NC_017331	ATTCA	2	10	55330	55339	40 %	40 %	0 %	20 %	387141683
41	NC_017331	AAAAT	2	10	55535	55544	80 %	20 %	0 %	0 %	387141683
42	NC_017331	ATTTA	2	10	55682	55691	40 %	60 %	0 %	0 %	387141684
43	NC_017331	TTAGT	2	10	55707	55716	20 %	60 %	20 %	0 %	387141684
44	NC_017331	ATAAA	2	10	56241	56250	80 %	20 %	0 %	0 %	387141684
45	NC_017331	TAAAG	2	10	60666	60675	60 %	20 %	20 %	0 %	387141686
46	NC_017331	AAAAG	2	10	61544	61553	80 %	0 %	20 %	0 %	387141687
47	NC_017331	TCAAG	2	10	62327	62336	40 %	20 %	20 %	20 %	387141689
48	NC_017331	TCGGT	2	10	65391	65400	0 %	40 %	40 %	20 %	387141692
49	NC_017331	GTTTA	2	10	69120	69129	20 %	60 %	20 %	0 %	387141697
50	NC_017331	AAATG	2	10	69201	69210	60 %	20 %	20 %	0 %	387141697
51	NC_017331	TTTTA	2	10	70092	70101	20 %	80 %	0 %	0 %	387141697
52	NC_017331	TGAAT	2	10	75707	75716	40 %	40 %	20 %	0 %	387141702
53	NC_017331	TTGGT	2	10	75749	75758	0 %	60 %	40 %	0 %	387141702
54	NC_017331	AATAT	2	10	75817	75826	60 %	40 %	0 %	0 %	387141702
55	NC_017331	TTCGT	2	10	76028	76037	0 %	60 %	20 %	20 %	387141702
56	NC_017331	CAAAA	2	10	76388	76397	80 %	0 %	0 %	20 %	387141703
57	NC_017331	AAATT	2	10	78487	78496	60 %	40 %	0 %	0 %	387141704
58	NC_017331	TTATT	2	10	81770	81779	20 %	80 %	0 %	0 %	387141707
59	NC_017331	TGGTG	2	10	83397	83406	0 %	40 %	60 %	0 %	387141708
60	NC_017331	CTTTT	2	10	84660	84669	0 %	80 %	0 %	20 %	387141709
61	NC_017331	ATAGC	2	10	86163	86172	40 %	20 %	20 %	20 %	387141711
62	NC_017331	GAAGT	2	10	87971	87980	40 %	20 %	40 %	0 %	387141713
63	NC_017331	GATTC	2	10	90365	90374	20 %	40 %	20 %	20 %	387141715
64	NC_017331	GTTGT	2	10	93541	93550	0 %	60 %	40 %	0 %	387141719
65	NC_017331	ATTTG	2	10	95249	95258	20 %	60 %	20 %	0 %	387141722
66	NC_017331	GAATT	2	10	95857	95866	40 %	40 %	20 %	0 %	387141722
67	NC_017331	AGATA	2	10	95887	95896	60 %	20 %	20 %	0 %	387141722
68	NC_017331	TGACT	2	10	99392	99401	20 %	40 %	20 %	20 %	387141725
69	NC_017331	CAATA	2	10	99497	99506	60 %	20 %	0 %	20 %	387141725
70	NC_017331	TGTTT	2	10	99693	99702	0 %	80 %	20 %	0 %	387141725
71	NC_017331	AATGA	2	10	99897	99906	60 %	20 %	20 %	0 %	387141725
72	NC_017331	TAAAT	2	10	100507	100516	60 %	40 %	0 %	0 %	387141726
73	NC_017331	AATTA	2	10	103757	103766	60 %	40 %	0 %	0 %	387141729
74	NC_017331	TGTAA	2	10	107281	107290	40 %	40 %	20 %	0 %	387141732
75	NC_017331	GTTGT	2	10	108619	108628	0 %	60 %	40 %	0 %	387141734
76	NC_017331	TGTAC	2	10	109539	109548	20 %	40 %	20 %	20 %	387141734
77	NC_017331	AACAA	2	10	111193	111202	80 %	0 %	0 %	20 %	387141735
78	NC_017331	TATAT	2	10	114552	114561	40 %	60 %	0 %	0 %	387141740
79	NC_017331	CAAAA	2	10	116224	116233	80 %	0 %	0 %	20 %	387141741
80	NC_017331	AAATG	2	10	118358	118367	60 %	20 %	20 %	0 %	387141741
81	NC_017331	GATAT	2	10	120941	120950	40 %	40 %	20 %	0 %	387141744
82	NC_017331	ATTGC	2	10	121879	121888	20 %	40 %	20 %	20 %	387141745
83	NC_017331	TCATT	2	10	122067	122076	20 %	60 %	0 %	20 %	387141745
84	NC_017331	CATGG	2	10	123283	123292	20 %	20 %	40 %	20 %	387141745
85	NC_017331	TCAAT	2	10	124323	124332	40 %	40 %	0 %	20 %	387141746
86	NC_017331	GTATT	2	10	124812	124821	20 %	60 %	20 %	0 %	387141747
87	NC_017331	CAATT	2	10	131124	131133	40 %	40 %	0 %	20 %	387141750
88	NC_017331	ATGTT	2	10	131958	131967	20 %	60 %	20 %	0 %	387141751
89	NC_017331	TTGCG	2	10	132529	132538	0 %	40 %	40 %	20 %	387141751
90	NC_017331	AGTTA	2	10	133993	134002	40 %	40 %	20 %	0 %	387141752
91	NC_017331	AGATG	2	10	137192	137201	40 %	20 %	40 %	0 %	387141754
92	NC_017331	GGTGA	2	10	137788	137797	20 %	20 %	60 %	0 %	387141755
93	NC_017331	GAAAA	2	10	141225	141234	80 %	0 %	20 %	0 %	387141758
94	NC_017331	AATCA	2	10	144414	144423	60 %	20 %	0 %	20 %	387141760
95	NC_017331	ATTTT	2	10	145111	145120	20 %	80 %	0 %	0 %	387141761
96	NC_017331	ATCAA	2	10	145138	145147	60 %	20 %	0 %	20 %	387141761
97	NC_017331	ATCAC	2	10	146371	146380	40 %	20 %	0 %	40 %	387141762
98	NC_017331	AACGA	2	10	147048	147057	60 %	0 %	20 %	20 %	387141762
99	NC_017331	ACACA	2	10	149104	149113	60 %	0 %	0 %	40 %	387141764
100	NC_017331	GACAA	2	10	150255	150264	60 %	0 %	20 %	20 %	387141765
101	NC_017331	ATTAC	2	10	152438	152447	40 %	40 %	0 %	20 %	387141767
102	NC_017331	TATCT	2	10	153097	153106	20 %	60 %	0 %	20 %	387141768
103	NC_017331	ATACG	2	10	155527	155536	40 %	20 %	20 %	20 %	387141770
104	NC_017331	TTATA	2	10	156185	156194	40 %	60 %	0 %	0 %	387141771
105	NC_017331	TATAA	2	10	156555	156564	60 %	40 %	0 %	0 %	387141771
106	NC_017331	TTTTA	2	10	156983	156992	20 %	80 %	0 %	0 %	387141771
107	NC_017331	TCAAC	2	10	157698	157707	40 %	20 %	0 %	40 %	387141772
108	NC_017331	AATAA	2	10	158089	158098	80 %	20 %	0 %	0 %	387141772
109	NC_017331	TACGC	2	10	158356	158365	20 %	20 %	20 %	40 %	387141772
110	NC_017331	TCCCT	2	10	161014	161023	0 %	40 %	0 %	60 %	387141775
111	NC_017331	GCTTT	2	10	163248	163257	0 %	60 %	20 %	20 %	387141777
112	NC_017331	TAATT	2	10	163333	163342	40 %	60 %	0 %	0 %	387141777
113	NC_017331	ATACT	2	10	164514	164523	40 %	40 %	0 %	20 %	387141779
114	NC_017331	TAATA	2	10	165680	165689	60 %	40 %	0 %	0 %	387141780
115	NC_017331	ATTTT	2	10	166671	166680	20 %	80 %	0 %	0 %	387141781
116	NC_017331	ATTTG	2	10	167983	167992	20 %	60 %	20 %	0 %	387141782
117	NC_017331	TTGTA	2	10	168895	168904	20 %	60 %	20 %	0 %	387141783
118	NC_017331	TGCAA	2	10	169900	169909	40 %	20 %	20 %	20 %	387141784
119	NC_017331	ATATG	2	10	171918	171927	40 %	40 %	20 %	0 %	387141785
120	NC_017331	TATGA	2	10	173598	173607	40 %	40 %	20 %	0 %	387141787
121	NC_017331	AATAT	2	10	174604	174613	60 %	40 %	0 %	0 %	387141787
122	NC_017331	CGAAC	2	10	176592	176601	40 %	0 %	20 %	40 %	387141788
123	NC_017331	TTCAA	2	10	178619	178628	40 %	40 %	0 %	20 %	387141789
124	NC_017331	ACATC	2	10	179462	179471	40 %	20 %	0 %	40 %	387141791
125	NC_017331	TTAAG	2	10	181693	181702	40 %	40 %	20 %	0 %	387141792
126	NC_017331	GTAAT	2	10	182435	182444	40 %	40 %	20 %	0 %	387141793
127	NC_017331	AGAGA	2	10	184711	184720	60 %	0 %	40 %	0 %	387141795
128	NC_017331	AATCC	2	10	185067	185076	40 %	20 %	0 %	40 %	387141795
129	NC_017331	TTGGA	2	10	188096	188105	20 %	40 %	40 %	0 %	387141798
130	NC_017331	TTATT	2	10	188511	188520	20 %	80 %	0 %	0 %	387141799
131	NC_017331	ATTTT	2	10	188577	188586	20 %	80 %	0 %	0 %	387141799
132	NC_017331	TATGG	2	10	188978	188987	20 %	40 %	40 %	0 %	387141799
133	NC_017331	ATCGT	2	10	189419	189428	20 %	40 %	20 %	20 %	387141799
134	NC_017331	TGAAT	2	10	194005	194014	40 %	40 %	20 %	0 %	387141804
135	NC_017331	CAAAA	2	10	195389	195398	80 %	0 %	0 %	20 %	387141806
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