MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_5

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017330	CTG	2	6	118	123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017330	TTC	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545960
3	NC_017330	GCC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545960
4	NC_017330	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545960
5	NC_017330	TGT	2	6	347	352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017330	GTT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017330	GGT	2	6	414	419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017330	AAT	2	6	576	581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545961
9	NC_017330	TTC	2	6	698	703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017330	GGT	2	6	776	781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017330	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
12	NC_017330	GCG	2	6	832	837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545962
13	NC_017330	GCT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
14	NC_017330	CTG	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017330	ACA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
16	NC_017330	GAA	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
17	NC_017330	GCA	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545964
18	NC_017330	TTG	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
19	NC_017330	CTG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
20	NC_017330	CTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
21	NC_017330	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
22	NC_017330	ATC	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
23	NC_017330	ATT	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
24	NC_017330	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
25	NC_017330	TGA	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545964
26	NC_017330	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
27	NC_017330	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
28	NC_017330	AAG	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
29	NC_017330	TGT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
30	NC_017330	TTG	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
31	NC_017330	ATT	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
32	NC_017330	TGT	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
33	NC_017330	CAT	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017330	TTG	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017330	TCT	2	6	2408	2413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017330	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017330	GCC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017330	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017330	GCA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.