MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_5

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017330	TTC	2	6	223	228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545960
2	NC_017330	GCC	2	6	257	262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545960
3	NC_017330	TCG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545960
4	NC_017330	AAT	2	6	576	581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545961
5	NC_017330	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
6	NC_017330	GCG	2	6	832	837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545962
7	NC_017330	GCT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545962
8	NC_017330	ACA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
9	NC_017330	GAA	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
10	NC_017330	GCA	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545964
11	NC_017330	TTG	2	6	1332	1337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
12	NC_017330	CTG	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
13	NC_017330	CTG	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545964
14	NC_017330	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
15	NC_017330	ATC	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
16	NC_017330	ATT	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
17	NC_017330	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
18	NC_017330	TGA	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545964
19	NC_017330	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545964
20	NC_017330	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545964
21	NC_017330	AAG	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545964
22	NC_017330	TGT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
23	NC_017330	TTG	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964
24	NC_017330	ATT	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545964
25	NC_017330	TGT	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545964

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.