MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 chromosome

Total Repeats: 11266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017328	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017328	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017328	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017328	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017328	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017328	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017328	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017328	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017328	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017328	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017328	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017328	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017328	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017328	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017328	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017328	TGC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017328	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017328	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017328	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017328	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017328	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017328	GGA	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017328	GCA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017328	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017328	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017328	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017328	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017328	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017328	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017328	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017328	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017328	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017328	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017328	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017328	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017328	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017328	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017328	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017328	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017328	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017328	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017328	AGG	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017328	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017328	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017328	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017328	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017328	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017328	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017328	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017328	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017328	ATT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017328	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017328	ATT	2	6	18342	18347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017328	AGT	2	6	18433	18438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017328	CAT	2	6	18472	18477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017328	ATG	2	6	18647	18652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017328	AGC	2	6	19706	19711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017328	TTG	2	6	19779	19784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017328	CTT	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017328	AGC	2	6	26149	26154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017328	GAA	2	6	26199	26204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017328	TAT	2	6	28123	28128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017328	TCT	2	6	28244	28249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017328	TGT	2	6	28255	28260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017328	TCT	2	6	28320	28325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017328	TGC	2	6	28326	28331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017328	GAT	2	6	28356	28361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017328	ATA	2	6	28405	28410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017328	GCC	2	6	28460	28465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017328	TCG	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017328	TCA	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017328	TGA	2	6	33015	33020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017328	TGA	2	6	33072	33077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017328	TGT	2	6	33653	33658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017328	GCG	2	6	38073	38078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017328	ATT	3	9	40921	40929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017328	TTA	2	6	41045	41050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017328	ACC	2	6	41157	41162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017328	ACG	2	6	41170	41175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017328	TGA	2	6	42045	42050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017328	ATG	2	6	42096	42101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017328	GAT	2	6	42172	42177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017328	GGC	2	6	42271	42276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017328	GCG	2	6	42299	42304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017328	CGG	2	6	42370	42375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017328	GAA	2	6	42389	42394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017328	CAG	2	6	42427	42432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017328	TGG	2	6	42576	42581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017328	GCA	2	6	42603	42608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017328	TTG	2	6	42873	42878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017328	TAA	2	6	46042	46047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017328	GCG	2	6	48494	48499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017328	CAA	2	6	53551	53556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017328	CAT	2	6	55931	55936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017328	GTG	2	6	56021	56026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017328	GCG	2	6	57052	57057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017328	ACC	2	6	60713	60718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017328	GTG	2	6	60740	60745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017328	AAT	2	6	67502	67507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017328	TAA	2	6	67595	67600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017328	CGC	2	6	69535	69540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017328	AAT	2	6	74681	74686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017328	AGG	2	6	74703	74708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017328	CAT	2	6	74855	74860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017328	CAG	2	6	74893	74898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017328	CTG	2	6	74906	74911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017328	CGC	2	6	74926	74931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017328	AGA	2	6	80985	80990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017328	TAG	4	12	80997	81008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017328	GGT	2	6	81166	81171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017328	TGA	2	6	81301	81306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017328	ATT	2	6	81359	81364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017328	GAT	2	6	81441	81446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017328	CAA	2	6	81483	81488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017328	ATT	2	6	81499	81504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017328	TAT	2	6	82788	82793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017328	GGA	2	6	82813	82818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017328	TCC	2	6	82841	82846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017328	TTA	2	6	82856	82861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017328	TAT	2	6	87234	87239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017328	AAT	2	6	87292	87297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017328	ATT	2	6	87325	87330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017328	GCG	2	6	87340	87345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017328	TGA	2	6	87523	87528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017328	AAC	2	6	87595	87600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017328	TCC	2	6	87668	87673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017328	AAG	2	6	98847	98852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017328	CGA	2	6	103360	103365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017328	CCG	2	6	104606	104611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017328	ATA	2	6	104652	104657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017328	TTA	2	6	106344	106349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017328	TTG	2	6	110925	110930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017328	GCA	2	6	110942	110947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017328	CAG	2	6	111023	111028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017328	ACC	2	6	111088	111093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017328	AAT	2	6	111102	111107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017328	TCA	2	6	111226	111231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017328	TGA	2	6	111273	111278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017328	GCG	2	6	113958	113963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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