MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	CTCGAT	2	12	24990	25001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017327	TCCCGA	2	12	34661	34672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017327	TTGCCG	2	12	47206	47217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017327	CAGTGA	2	12	69409	69420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017327	TTCGGC	2	12	92071	92082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017327	GAGCCC	2	12	108143	108154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017327	TCGACA	2	12	116881	116892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017327	GCCCGC	2	12	129531	129542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017327	AGGAAC	2	12	148301	148312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017327	CCGCAG	2	12	167596	167607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017327	CAGGCG	2	12	177568	177579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017327	GCTTCC	2	12	189916	189927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017327	CCGAGC	2	12	223181	223192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017327	AATGAC	2	12	236061	236072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017327	TCGGAT	2	12	239728	239739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017327	CTGGCG	2	12	239772	239783	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017327	CTGGCG	2	12	243970	243981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017327	CGTTTG	2	12	253265	253276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017327	GCATTC	2	12	270327	270338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017327	CACCCG	2	12	311735	311746	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017327	GTTTCG	2	12	338144	338155	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017327	AAGACG	2	12	361806	361817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017327	GGGTAA	2	12	435622	435633	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017327	ATGTTC	2	12	462269	462280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017327	CGTCGC	2	12	465962	465973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017327	AGAAAC	2	12	475351	475362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017327	TCGATC	2	12	475623	475634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017327	GCTGTC	3	18	481742	481759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017327	GGCCCG	2	12	494127	494138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017327	TTAGAT	2	12	499195	499206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017327	TGCCAG	2	12	507080	507091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017327	TCGCCG	2	12	507110	507121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017327	CAAGGA	2	12	536868	536879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017327	AAAGCA	2	12	544153	544164	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017327	CGGTTT	2	12	550610	550621	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017327	CAGCGG	2	12	608090	608101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017327	GCCGAG	2	12	613163	613174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017327	TCGCGC	2	12	629332	629343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017327	GATGGT	2	12	638240	638251	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017327	TAAGGG	2	12	655890	655901	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017327	CGGGCG	2	12	663268	663279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017327	ACAGGA	2	12	664227	664238	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017327	TTGGCT	2	12	684483	684494	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017327	TCGCTA	2	12	687973	687984	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017327	ATCCGG	2	12	742944	742955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017327	CCAAGG	2	12	757270	757281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017327	TGGAGC	2	12	779790	779801	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017327	TGCGGC	2	12	782185	782196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017327	GCAGGG	2	12	816722	816733	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017327	CCGGCC	2	12	838048	838059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017327	ATTAGA	2	12	873648	873659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017327	GCGCAA	2	12	896081	896092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017327	CGCTGA	2	12	901103	901114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017327	GCTTTA	2	12	916747	916758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017327	GCCTTC	2	12	955320	955331	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017327	GGGAAT	2	12	977555	977566	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017327	CGTCCT	2	12	1016668	1016679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017327	CTCGAT	2	12	1038030	1038041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017327	TCCCCT	2	12	1061170	1061181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017327	TTCGGC	2	12	1125636	1125647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017327	TGTCAT	2	12	1141939	1141950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017327	CGCGCT	2	12	1192799	1192810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017327	CGTCGC	2	12	1196269	1196280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017327	GCGTCG	2	12	1230378	1230389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017327	TGGGAC	2	12	1230764	1230775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017327	CTTGCA	2	12	1324849	1324860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017327	ATGCAC	2	12	1336821	1336832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017327	CCCCTG	2	12	1339760	1339771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017327	AGAGCA	2	12	1342195	1342206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017327	GTCGCC	2	12	1359773	1359784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017327	GGCTGC	2	12	1436577	1436588	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017327	TTTGCT	2	12	1459300	1459311	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017327	ATGGCA	2	12	1463782	1463793	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017327	GCATCG	2	12	1471718	1471729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017327	AAAATG	2	12	1506799	1506810	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017327	GACGAA	2	12	1574204	1574215	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017327	CCCCCT	2	12	1579939	1579950	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.