MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	TCCCG	2	10	534	543	0 %	20 %	20 %	60 %	384539800
2	NC_017327	GATCT	2	10	2004	2013	20 %	40 %	20 %	20 %	384539801
3	NC_017327	GATCG	2	10	2810	2819	20 %	20 %	40 %	20 %	384539802
4	NC_017327	CGGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	60 %	20 %	384539802
5	NC_017327	AGGGC	2	10	3398	3407	20 %	0 %	60 %	20 %	384539802
6	NC_017327	ACCGG	2	10	7313	7322	20 %	0 %	40 %	40 %	384539806
7	NC_017327	GCTTG	2	10	8337	8346	0 %	40 %	40 %	20 %	384539807
8	NC_017327	GTGCG	2	10	8791	8800	0 %	20 %	60 %	20 %	384539808
9	NC_017327	GAAGA	2	10	8864	8873	60 %	0 %	40 %	0 %	384539808
10	NC_017327	GACCA	2	10	14372	14381	40 %	0 %	20 %	40 %	384539812
11	NC_017327	CGTGG	2	10	15306	15315	0 %	20 %	60 %	20 %	384539813
12	NC_017327	CGGCC	2	10	17094	17103	0 %	0 %	40 %	60 %	384539815
13	NC_017327	GCCCC	2	10	17141	17150	0 %	0 %	20 %	80 %	384539815
14	NC_017327	CATTC	2	10	18904	18913	20 %	40 %	0 %	40 %	384539817
15	NC_017327	CGCGC	2	10	19477	19486	0 %	0 %	40 %	60 %	384539817
16	NC_017327	GAAAG	2	10	20644	20653	60 %	0 %	40 %	0 %	384539818
17	NC_017327	GATCG	2	10	25840	25849	20 %	20 %	40 %	20 %	384539823
18	NC_017327	GCTCT	2	10	26077	26086	0 %	40 %	20 %	40 %	384539823
19	NC_017327	GCCGG	2	10	26971	26980	0 %	0 %	60 %	40 %	384539824
20	NC_017327	CTTCG	2	10	32847	32856	0 %	40 %	20 %	40 %	384539829
21	NC_017327	CTCGC	2	10	33159	33168	0 %	20 %	20 %	60 %	384539829
22	NC_017327	GGCGA	2	10	36414	36423	20 %	0 %	60 %	20 %	384539833
23	NC_017327	TCTTT	2	10	38261	38270	0 %	80 %	0 %	20 %	384539837
24	NC_017327	CGCGG	2	10	38305	38314	0 %	0 %	60 %	40 %	384539837
25	NC_017327	TTTTC	2	10	38362	38371	0 %	80 %	0 %	20 %	384539837
26	NC_017327	CGCTT	2	10	40154	40163	0 %	40 %	20 %	40 %	384539839
27	NC_017327	TGCCG	2	10	40165	40174	0 %	20 %	40 %	40 %	384539839
28	NC_017327	CTCGA	2	10	42028	42037	20 %	20 %	20 %	40 %	384539840
29	NC_017327	CCGTC	2	10	42300	42309	0 %	20 %	20 %	60 %	384539840
30	NC_017327	CCTTG	2	10	42971	42980	0 %	40 %	20 %	40 %	384539841
31	NC_017327	TGCGA	2	10	43913	43922	20 %	20 %	40 %	20 %	384539842
32	NC_017327	CGGCG	2	10	46147	46156	0 %	0 %	60 %	40 %	384539843
33	NC_017327	CGGAT	2	10	51122	51131	20 %	20 %	40 %	20 %	384539847
34	NC_017327	AGGAG	2	10	52989	52998	40 %	0 %	60 %	0 %	384539848
35	NC_017327	GATGC	2	10	59247	59256	20 %	20 %	40 %	20 %	384539855
36	NC_017327	CGGCA	2	10	59274	59283	20 %	0 %	40 %	40 %	384539855
37	NC_017327	GGGTC	2	10	62426	62435	0 %	20 %	60 %	20 %	384539856
38	NC_017327	CGTTG	2	10	62618	62627	0 %	40 %	40 %	20 %	384539856
39	NC_017327	GGCAG	2	10	62707	62716	20 %	0 %	60 %	20 %	384539856
40	NC_017327	TGGCA	2	10	64087	64096	20 %	20 %	40 %	20 %	384539857
41	NC_017327	CCGAT	2	10	64209	64218	20 %	20 %	20 %	40 %	384539857
42	NC_017327	CGGCG	2	10	65424	65433	0 %	0 %	60 %	40 %	384539858
43	NC_017327	CAGGC	2	10	65461	65470	20 %	0 %	40 %	40 %	384539858
44	NC_017327	GCAGG	2	10	66511	66520	20 %	0 %	60 %	20 %	384539860
45	NC_017327	TAGAG	2	10	67171	67180	40 %	20 %	40 %	0 %	384539860
46	NC_017327	CCATT	2	10	71303	71312	20 %	40 %	0 %	40 %	384539868
47	NC_017327	CTGGG	2	10	71631	71640	0 %	20 %	60 %	20 %	384539869
48	NC_017327	AGGGG	2	10	73605	73614	20 %	0 %	80 %	0 %	384539872
49	NC_017327	AGGGG	2	10	74110	74119	20 %	0 %	80 %	0 %	384539872
50	NC_017327	AGCTG	2	10	74556	74565	20 %	20 %	40 %	20 %	384539873
51	NC_017327	CCGGC	2	10	74579	74588	0 %	0 %	40 %	60 %	384539873
52	NC_017327	CCGCC	2	10	75087	75096	0 %	0 %	20 %	80 %	384539875
53	NC_017327	AGGGG	2	10	77974	77983	20 %	0 %	80 %	0 %	384539881
54	NC_017327	CTTAT	2	10	79541	79550	20 %	60 %	0 %	20 %	384539884
55	NC_017327	GCGCC	2	10	81772	81781	0 %	0 %	40 %	60 %	384539886
56	NC_017327	CCGAT	2	10	83842	83851	20 %	20 %	20 %	40 %	384539888
57	NC_017327	CCCAT	2	10	84451	84460	20 %	20 %	0 %	60 %	384539888
58	NC_017327	CGAAG	2	10	85423	85432	40 %	0 %	40 %	20 %	384539888
59	NC_017327	GATGC	2	10	87058	87067	20 %	20 %	40 %	20 %	384539888
60	NC_017327	GACGA	2	10	92173	92182	40 %	0 %	40 %	20 %	384539893
61	NC_017327	CCTTC	2	10	96447	96456	0 %	40 %	0 %	60 %	384539896
62	NC_017327	ATCGC	2	10	97137	97146	20 %	20 %	20 %	40 %	384539898
63	NC_017327	CCGGC	2	10	103322	103331	0 %	0 %	40 %	60 %	384539909
64	NC_017327	CTTCA	2	10	105100	105109	20 %	40 %	0 %	40 %	384539912
65	NC_017327	GCGCG	2	10	106016	106025	0 %	0 %	60 %	40 %	384539913
66	NC_017327	GTTGA	2	10	106389	106398	20 %	40 %	40 %	0 %	384539913
67	NC_017327	AAAGC	2	10	106429	106438	60 %	0 %	20 %	20 %	384539913
68	NC_017327	GGCAA	2	10	110631	110640	40 %	0 %	40 %	20 %	384539918
69	NC_017327	GGCAC	2	10	113605	113614	20 %	0 %	40 %	40 %	384539921
70	NC_017327	GAAAC	2	10	115988	115997	60 %	0 %	20 %	20 %	384539924
71	NC_017327	CCGGC	2	10	116799	116808	0 %	0 %	40 %	60 %	384539925
72	NC_017327	GCAAG	2	10	120160	120169	40 %	0 %	40 %	20 %	384539927
73	NC_017327	GCCCG	2	10	120541	120550	0 %	0 %	40 %	60 %	384539928
74	NC_017327	TTGGT	2	10	120832	120841	0 %	60 %	40 %	0 %	384539928
75	NC_017327	CGCGT	2	10	125990	125999	0 %	20 %	40 %	40 %	384539935
76	NC_017327	GCGCG	2	10	127057	127066	0 %	0 %	60 %	40 %	384539935
77	NC_017327	CGTCT	2	10	128309	128318	0 %	40 %	20 %	40 %	384539937
78	NC_017327	GCCGC	2	10	133564	133573	0 %	0 %	40 %	60 %	384539949
79	NC_017327	GCGCG	2	10	134521	134530	0 %	0 %	60 %	40 %	384539950
80	NC_017327	CCTGG	2	10	134531	134540	0 %	20 %	40 %	40 %	384539950
81	NC_017327	AGGGC	2	10	145739	145748	20 %	0 %	60 %	20 %	384539962
82	NC_017327	GATGG	2	10	147429	147438	20 %	20 %	60 %	0 %	384539964
83	NC_017327	TGAAG	2	10	147866	147875	40 %	20 %	40 %	0 %	384539964
84	NC_017327	TCATT	2	10	149060	149069	20 %	60 %	0 %	20 %	384539965
85	NC_017327	GCTTC	2	10	149076	149085	0 %	40 %	20 %	40 %	384539965
86	NC_017327	TGCGA	2	10	150580	150589	20 %	20 %	40 %	20 %	384539967
87	NC_017327	CCGCG	2	10	150777	150786	0 %	0 %	40 %	60 %	384539967
88	NC_017327	CGTTA	2	10	153397	153406	20 %	40 %	20 %	20 %	384539970
89	NC_017327	GATAG	2	10	156681	156690	40 %	20 %	40 %	0 %	384539976
90	NC_017327	CAATC	2	10	166116	166125	40 %	20 %	0 %	40 %	384539991
91	NC_017327	GCATT	2	10	167456	167465	20 %	40 %	20 %	20 %	384539993
92	NC_017327	CTGAT	2	10	170389	170398	20 %	40 %	20 %	20 %	384539996
93	NC_017327	GACCG	2	10	170439	170448	20 %	0 %	40 %	40 %	384539996
94	NC_017327	GTGGC	2	10	173591	173600	0 %	20 %	60 %	20 %	384540003
95	NC_017327	CTTGC	2	10	174267	174276	0 %	40 %	20 %	40 %	384540005
96	NC_017327	GCGCA	2	10	174484	174493	20 %	0 %	40 %	40 %	384540005
97	NC_017327	TTGCC	2	10	179248	179257	0 %	40 %	20 %	40 %	384540013
98	NC_017327	TCGCT	2	10	179368	179377	0 %	40 %	20 %	40 %	384540013
99	NC_017327	GCAAA	2	10	181058	181067	60 %	0 %	20 %	20 %	384540014
100	NC_017327	CGAGC	2	10	184345	184354	20 %	0 %	40 %	40 %	384540017
101	NC_017327	AGGTC	2	10	185165	185174	20 %	20 %	40 %	20 %	384540018
102	NC_017327	AGGGG	2	10	193013	193022	20 %	0 %	80 %	0 %	384540029
103	NC_017327	CTCGA	2	10	195188	195197	20 %	20 %	20 %	40 %	384540029
104	NC_017327	CGACG	2	10	197507	197516	20 %	0 %	40 %	40 %	384540034
105	NC_017327	GCCAA	2	10	198599	198608	40 %	0 %	20 %	40 %	384540035
106	NC_017327	GCAGG	2	10	204775	204784	20 %	0 %	60 %	20 %	384540038
107	NC_017327	TGGCC	2	10	210159	210168	0 %	20 %	40 %	40 %	384540045
108	NC_017327	CGAGC	2	10	211924	211933	20 %	0 %	40 %	40 %	384540047
109	NC_017327	GTTCC	2	10	212507	212516	0 %	40 %	20 %	40 %	384540047
110	NC_017327	CCGCG	2	10	212737	212746	0 %	0 %	40 %	60 %	384540047
111	NC_017327	CCCGG	2	10	213393	213402	0 %	0 %	40 %	60 %	384540047
112	NC_017327	GCCTT	2	10	215008	215017	0 %	40 %	20 %	40 %	384540050
113	NC_017327	GACAA	2	10	216243	216252	60 %	0 %	20 %	20 %	384540051
114	NC_017327	GTCGC	2	10	217621	217630	0 %	20 %	40 %	40 %	384540053
115	NC_017327	TCGCG	2	10	219440	219449	0 %	20 %	40 %	40 %	384540056
116	NC_017327	TTCCA	2	10	219692	219701	20 %	40 %	0 %	40 %	384540056
117	NC_017327	CAGTT	2	10	220530	220539	20 %	40 %	20 %	20 %	384540058
118	NC_017327	CCCAT	2	10	220934	220943	20 %	20 %	0 %	60 %	384540058
119	NC_017327	GGGCG	2	10	223243	223252	0 %	0 %	80 %	20 %	384540060
120	NC_017327	ATGGA	2	10	225992	226001	40 %	20 %	40 %	0 %	384540063
121	NC_017327	GCCGC	2	10	231380	231389	0 %	0 %	40 %	60 %	384540074
122	NC_017327	CAAGC	2	10	233488	233497	40 %	0 %	20 %	40 %	384540076
123	NC_017327	ATCGG	2	10	235020	235029	20 %	20 %	40 %	20 %	384540077
124	NC_017327	CCGCC	2	10	236102	236111	0 %	0 %	20 %	80 %	384540079
125	NC_017327	GATAT	2	10	241408	241417	40 %	40 %	20 %	0 %	384540086
126	NC_017327	TTCGG	2	10	248205	248214	0 %	40 %	40 %	20 %	384540092
127	NC_017327	CGTCT	2	10	250559	250568	0 %	40 %	20 %	40 %	384540095
128	NC_017327	GCCGC	2	10	254303	254312	0 %	0 %	40 %	60 %	384540101
129	NC_017327	ATGCC	2	10	256133	256142	20 %	20 %	20 %	40 %	384540102
130	NC_017327	TCGGC	2	10	256149	256158	0 %	20 %	40 %	40 %	384540102
131	NC_017327	GATGC	2	10	257019	257028	20 %	20 %	40 %	20 %	384540102
132	NC_017327	GAGCA	2	10	257373	257382	40 %	0 %	40 %	20 %	384540103
133	NC_017327	GGTCA	2	10	257808	257817	20 %	20 %	40 %	20 %	384540103
134	NC_017327	ACCGC	2	10	257842	257851	20 %	0 %	20 %	60 %	384540103
135	NC_017327	GCCGT	2	10	261683	261692	0 %	20 %	40 %	40 %	384540106
136	NC_017327	GCGAA	2	10	261905	261914	40 %	0 %	40 %	20 %	384540106
137	NC_017327	GACGC	2	10	263151	263160	20 %	0 %	40 %	40 %	384540108
138	NC_017327	CTTCG	2	10	263852	263861	0 %	40 %	20 %	40 %	384540109
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141	NC_017327	AGCGC	2	10	267512	267521	20 %	0 %	40 %	40 %	384540110
142	NC_017327	TCACG	2	10	271796	271805	20 %	20 %	20 %	40 %	384540114
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149	NC_017327	CTGCT	2	10	286119	286128	0 %	40 %	20 %	40 %	384540128
150	NC_017327	GCTGA	2	10	290449	290458	20 %	20 %	40 %	20 %	384540133
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166	NC_017327	CGCTG	2	10	310426	310435	0 %	20 %	40 %	40 %	384540159
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199	NC_017327	CCGAT	2	10	380089	380098	20 %	20 %	20 %	40 %	384540244
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253	NC_017327	GAATC	2	10	488644	488653	40 %	20 %	20 %	20 %	384540364
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256	NC_017327	GATGC	2	10	493429	493438	20 %	20 %	40 %	20 %	384540370
257	NC_017327	GCCGA	2	10	493861	493870	20 %	0 %	40 %	40 %	384540370
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259	NC_017327	GGGGA	2	10	494982	494991	20 %	0 %	80 %	0 %	384540372
260	NC_017327	GAGGC	2	10	495206	495215	20 %	0 %	60 %	20 %	384540372
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