MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 776

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	AACG	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017327	GGCC	2	8	4371	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017327	TCGC	2	8	10903	10910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017327	TCCG	2	8	14781	14788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017327	CGTT	2	8	22993	23000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017327	ACGA	2	8	25230	25237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017327	CGGG	2	8	25336	25343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017327	TGCC	2	8	27918	27925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017327	ACCG	2	8	28334	28341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017327	CCTA	2	8	28344	28351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017327	GTGC	2	8	28391	28398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017327	ACTC	2	8	28423	28430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017327	TCCG	2	8	28645	28652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017327	CGCT	2	8	28656	28663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017327	GCGA	2	8	29200	29207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017327	ACCA	2	8	47352	47359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017327	GTAA	2	8	49878	49885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017327	ATGG	2	8	53697	53704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017327	ACGT	2	8	53759	53766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017327	AGAA	2	8	56816	56823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017327	CATT	2	8	56855	56862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017327	GCAT	2	8	58757	58764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017327	CCGT	2	8	63375	63382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017327	CTTG	2	8	66146	66153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017327	GCCC	2	8	71411	71418	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017327	AGCG	2	8	71975	71982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017327	AGGC	2	8	80732	80739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017327	CTGG	2	8	81201	81208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017327	GCAC	2	8	82250	82257	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017327	GGGC	2	8	82430	82437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017327	GTTG	2	8	87784	87791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017327	CCCT	2	8	90241	90248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017327	CCGT	2	8	90534	90541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017327	CAGT	2	8	94971	94978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017327	GCGG	2	8	95135	95142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017327	CTGA	2	8	95380	95387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017327	ACGA	2	8	95548	95555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017327	GGGC	2	8	95655	95662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017327	GGCC	2	8	96661	96668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017327	TCAG	2	8	98346	98353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017327	CTTC	2	8	98621	98628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017327	CGTG	2	8	98677	98684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017327	TTGT	2	8	98743	98750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017327	ACGC	2	8	99445	99452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017327	GCGG	2	8	99535	99542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017327	ATCA	2	8	103022	103029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017327	ATCG	2	8	103058	103065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017327	CTGG	2	8	103642	103649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017327	CGGG	2	8	103657	103664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017327	GGCC	2	8	103733	103740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017327	AGTG	2	8	104995	105002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017327	ATTT	2	8	106806	106813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017327	GTGC	2	8	108084	108091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017327	GTGC	2	8	108626	108633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017327	TCTG	2	8	116485	116492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017327	CGTT	2	8	123859	123866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017327	GAGG	2	8	123943	123950	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017327	CCCT	2	8	124109	124116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017327	GCCG	2	8	125356	125363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017327	CGGG	2	8	125365	125372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017327	CAAC	2	8	129272	129279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017327	ACGC	2	8	129940	129947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017327	ATCG	2	8	130589	130596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017327	CCGG	2	8	131100	131107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017327	TCGT	2	8	132738	132745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017327	TCTT	2	8	132755	132762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017327	TCAA	2	8	132764	132771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017327	CAGC	2	8	135257	135264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017327	CTTC	2	8	136428	136435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017327	AATT	2	8	144122	144129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017327	GCGG	2	8	145166	145173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017327	GTCG	2	8	145289	145296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017327	TCCG	2	8	145892	145899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017327	AGGT	2	8	148139	148146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017327	CAGG	2	8	148360	148367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017327	TCGC	2	8	149185	149192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017327	TCGA	2	8	149372	149379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017327	CCAC	2	8	149529	149536	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017327	GGGC	2	8	152212	152219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017327	CCTG	2	8	152400	152407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017327	GCCC	2	8	157721	157728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017327	TTGA	2	8	161669	161676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017327	CTTC	2	8	161962	161969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017327	AGGA	2	8	161979	161986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017327	TGAA	2	8	164302	164309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017327	TCCG	2	8	167467	167474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017327	CCAT	2	8	167734	167741	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017327	CAGG	2	8	168360	168367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017327	ACCA	2	8	168581	168588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017327	TCGC	2	8	171982	171989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017327	CCGA	3	12	172063	172074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017327	TTTC	2	8	172255	172262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017327	GTTG	2	8	172616	172623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017327	TTCG	2	8	173805	173812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017327	ATGC	2	8	174159	174166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017327	CATT	2	8	174567	174574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017327	AGGA	2	8	174711	174718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017327	GTCA	2	8	175330	175337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017327	CCTT	2	8	175422	175429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017327	CCGA	2	8	175430	175437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017327	GATC	2	8	177237	177244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017327	TGTT	2	8	177374	177381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017327	GATT	2	8	177441	177448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017327	CCTT	2	8	177499	177506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017327	CACC	2	8	178786	178793	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017327	CGAA	2	8	179922	179929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017327	CCGA	2	8	180272	180279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017327	CGAT	2	8	184119	184126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017327	GATT	2	8	184955	184962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017327	CGAA	2	8	185677	185684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017327	AGGC	2	8	185696	185703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017327	AGCC	2	8	186301	186308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017327	CGCT	2	8	188423	188430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017327	TTTC	2	8	190020	190027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017327	AGCT	2	8	192051	192058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017327	ATGG	2	8	195553	195560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017327	AGTC	2	8	195602	195609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017327	GCTC	2	8	195655	195662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017327	CCGC	2	8	202371	202378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_017327	GGCC	2	8	202392	202399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017327	TGCT	2	8	202414	202421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017327	TGAA	2	8	202453	202460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017327	CATG	2	8	202465	202472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017327	TCGG	2	8	202506	202513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017327	CGTT	2	8	202521	202528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017327	AATG	2	8	202529	202536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017327	CACC	2	8	219848	219855	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017327	TCAA	2	8	223070	223077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017327	TTTC	2	8	227395	227402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017327	TTGG	2	8	227455	227462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017327	CGAT	2	8	231182	231189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017327	GGCT	2	8	231291	231298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017327	AAGC	2	8	236609	236616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017327	TGAG	2	8	242805	242812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017327	GCCG	2	8	243151	243158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017327	TGCC	2	8	247642	247649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017327	AGGC	2	8	247718	247725	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017327	CTTT	2	8	250038	250045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017327	AAGG	2	8	251331	251338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017327	GCCG	2	8	251772	251779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017327	GCCG	2	8	260883	260890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017327	GATC	2	8	262783	262790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017327	CTTT	2	8	268620	268627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017327	TCGG	2	8	268814	268821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017327	CTTT	2	8	269463	269470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017327	ATCA	2	8	269954	269961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017327	AACC	2	8	270071	270078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017327	GCTG	2	8	273629	273636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017327	CCTC	2	8	273774	273781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_017327	TTCA	2	8	275439	275446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017327	AGAC	2	8	275507	275514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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