MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 24807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	AGC	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
2	NC_017327	AAC	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539800
3	NC_017327	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
4	NC_017327	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
5	NC_017327	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539800
6	NC_017327	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
7	NC_017327	GGC	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
8	NC_017327	CGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
9	NC_017327	CAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
10	NC_017327	GCG	2	6	642	647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539800
11	NC_017327	CAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539800
12	NC_017327	TCG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
13	NC_017327	CCG	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
14	NC_017327	TCA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
15	NC_017327	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539800
16	NC_017327	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
17	NC_017327	TGA	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539800
18	NC_017327	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539800
19	NC_017327	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539800
20	NC_017327	TGC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539800
21	NC_017327	TCT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539801
22	NC_017327	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539801
23	NC_017327	TCG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539801
24	NC_017327	CTC	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539801
25	NC_017327	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
26	NC_017327	AGG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539801
27	NC_017327	CGC	2	6	1704	1709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539801
28	NC_017327	GCA	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539801
29	NC_017327	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539801
30	NC_017327	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539801
31	NC_017327	GCT	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017327	GAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539802
33	NC_017327	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539802
34	NC_017327	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
35	NC_017327	GTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
36	NC_017327	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539802
37	NC_017327	TCG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
38	NC_017327	GTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384539802
39	NC_017327	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539802
40	NC_017327	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384539802
41	NC_017327	AGG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384539802
42	NC_017327	CTG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539802
43	NC_017327	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384539802
44	NC_017327	TCG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017327	CCT	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017327	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017327	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017327	GTC	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017327	TGA	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539803
50	NC_017327	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
51	NC_017327	CGC	2	6	3941	3946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
52	NC_017327	AGC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539803
53	NC_017327	CGC	2	6	3987	3992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539803
54	NC_017327	GGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539803
55	NC_017327	AGG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017327	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017327	TGC	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017327	GCC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017327	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
60	NC_017327	CGG	2	6	4657	4662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
61	NC_017327	GCA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539804
62	NC_017327	CGG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539804
63	NC_017327	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384539804
64	NC_017327	GCT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539804
65	NC_017327	AGA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539804
66	NC_017327	CCG	2	6	5091	5096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539804
67	NC_017327	TTA	2	6	5205	5210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017327	GAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
69	NC_017327	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
70	NC_017327	GAA	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
71	NC_017327	AGC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
72	NC_017327	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
73	NC_017327	TCC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
74	NC_017327	CGA	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
75	NC_017327	CAA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
76	NC_017327	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
77	NC_017327	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
78	NC_017327	CGG	2	6	5871	5876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
79	NC_017327	GGC	2	6	5895	5900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
80	NC_017327	GCG	2	6	5920	5925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
81	NC_017327	CAA	2	6	5926	5931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384539805
82	NC_017327	AGA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
83	NC_017327	CCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539805
84	NC_017327	GAA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539805
85	NC_017327	TGC	2	6	6176	6181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
86	NC_017327	CGG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
87	NC_017327	TCT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539805
88	NC_017327	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
89	NC_017327	GGC	2	6	6525	6530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
90	NC_017327	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
91	NC_017327	TGC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
92	NC_017327	CGG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539805
93	NC_017327	GCT	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
94	NC_017327	CGA	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
95	NC_017327	GCT	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
96	NC_017327	TCG	3	9	6737	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539805
97	NC_017327	ACG	2	6	6752	6757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539805
98	NC_017327	CCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539805
99	NC_017327	GGT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017327	CGG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017327	GCT	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
102	NC_017327	CGG	2	6	7251	7256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539806
103	NC_017327	CCG	2	6	7281	7286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
104	NC_017327	CAG	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
105	NC_017327	ACG	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
106	NC_017327	CGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539806
107	NC_017327	TCG	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
108	NC_017327	CGA	2	6	7438	7443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
109	NC_017327	CAG	3	9	7541	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
110	NC_017327	CAT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
111	NC_017327	GTC	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539806
112	NC_017327	CGA	2	6	7954	7959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539806
113	NC_017327	ACC	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539806
114	NC_017327	TCA	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539806
115	NC_017327	ACT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017327	CCA	2	6	8121	8126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539807
117	NC_017327	ACG	3	9	8238	8246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
118	NC_017327	CGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
119	NC_017327	CGG	2	6	8263	8268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539807
120	NC_017327	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539807
121	NC_017327	GCA	2	6	8407	8412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539807
122	NC_017327	GGC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539807
123	NC_017327	AAT	2	6	8644	8649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017327	TGA	2	6	8805	8810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
125	NC_017327	CAG	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539808
126	NC_017327	CTT	2	6	8919	8924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384539808
127	NC_017327	TCG	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
128	NC_017327	CCT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384539808
129	NC_017327	TCG	2	6	9224	9229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
130	NC_017327	CGA	2	6	9230	9235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539808
131	NC_017327	GAT	2	6	9343	9348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
132	NC_017327	GCC	2	6	9361	9366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539808
133	NC_017327	GTC	2	6	9392	9397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384539808
134	NC_017327	GCC	2	6	9398	9403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539808
135	NC_017327	TGA	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
136	NC_017327	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539808
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139	NC_017327	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539808
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142	NC_017327	TGA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_017327	AGC	2	6	16641	16646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539814
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244	NC_017327	GCC	2	6	16799	16804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384539814
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248	NC_017327	ATC	2	6	16992	16997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384539815
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252	NC_017327	GAC	2	6	17117	17122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539815
253	NC_017327	AAG	2	6	17166	17171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539815
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356	NC_017327	CGA	2	6	22343	22348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384539819
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358	NC_017327	CGG	2	6	22484	22489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539819
359	NC_017327	GAT	2	6	22530	22535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384539819
360	NC_017327	CGG	2	6	22628	22633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539819
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362	NC_017327	AGC	2	6	22871	22876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_017327	GGT	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
364	NC_017327	GAA	2	6	23117	23122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384539820
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368	NC_017327	CAC	2	6	23272	23277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384539820
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373	NC_017327	CGG	2	6	23554	23559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384539820
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