MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 3502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	GCT	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017327	TCG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017327	CCT	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017327	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017327	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017327	GTC	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017327	AGG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017327	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017327	TGC	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017327	GCC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017327	TTA	2	6	5205	5210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017327	GGT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017327	CGG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017327	ACT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017327	AAT	2	6	8644	8649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017327	CAC	2	6	10124	10129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017327	TGA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017327	GGC	2	6	10857	10862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017327	GGT	2	6	10941	10946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017327	GTG	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017327	CGC	2	6	10994	10999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017327	GCT	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017327	CGA	2	6	14699	14704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017327	CGG	2	6	14712	14717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017327	AGC	2	6	22871	22876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017327	GGT	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017327	TGC	2	6	24499	24504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017327	GAC	2	6	24528	24533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017327	TGC	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017327	ATG	2	6	25093	25098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017327	GCT	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017327	GTG	3	9	25170	25178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017327	CGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017327	GTC	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017327	TGA	2	6	25329	25334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017327	GCG	2	6	25435	25440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017327	CGT	2	6	25545	25550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017327	AAC	2	6	25560	25565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017327	GCC	3	9	27565	27573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017327	CAA	2	6	27612	27617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017327	GTT	2	6	27681	27686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017327	ATT	2	6	27721	27726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017327	GTT	2	6	27837	27842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017327	CGG	2	6	27930	27935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017327	CGT	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017327	TAA	2	6	28467	28472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017327	CTG	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017327	TCC	2	6	28577	28582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017327	GCA	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017327	GCC	2	6	28740	28745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017327	CAG	3	9	28760	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017327	GAG	2	6	28786	28791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017327	TGA	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017327	GAC	2	6	28963	28968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017327	CCG	2	6	29058	29063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017327	TGC	2	6	29098	29103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017327	TGT	2	6	29145	29150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017327	CCT	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017327	TCC	3	9	29212	29220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017327	CTC	3	9	29247	29255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017327	CCT	2	6	29295	29300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017327	CTT	2	6	30530	30535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017327	GAC	2	6	30564	30569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017327	CAC	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017327	TGA	2	6	34440	34445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017327	CGC	2	6	34484	34489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017327	TTG	2	6	34500	34505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017327	CAA	2	6	34585	34590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017327	GGC	2	6	34700	34705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017327	AGA	2	6	34726	34731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017327	CAT	2	6	34751	34756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017327	GTT	2	6	34766	34771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017327	TCG	2	6	36459	36464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017327	TGA	2	6	37267	37272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017327	AGC	2	6	37311	37316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017327	CCG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017327	AGC	2	6	46476	46481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017327	TCG	2	6	46545	46550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017327	CAA	2	6	46556	46561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017327	ACG	2	6	47130	47135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017327	CCA	2	6	47145	47150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017327	TCG	2	6	49760	49765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017327	GAA	2	6	49839	49844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017327	CGC	2	6	49894	49899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017327	CGC	2	6	49939	49944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017327	CGG	2	6	53742	53747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017327	TCC	2	6	53809	53814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017327	TCC	2	6	53848	53853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017327	GCC	2	6	53862	53867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017327	GCC	2	6	55237	55242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017327	CGA	2	6	56643	56648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017327	TGT	2	6	56738	56743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017327	AAG	2	6	56906	56911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017327	GAC	2	6	56916	56921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017327	CTT	2	6	56932	56937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017327	GGC	2	6	56952	56957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017327	CCG	2	6	56960	56965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017327	CAC	2	6	56980	56985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017327	ATC	2	6	56987	56992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017327	AGG	2	6	57033	57038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017327	GGC	2	6	57897	57902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017327	CCA	2	6	58769	58774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017327	TCG	2	6	58820	58825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017327	CGA	2	6	60862	60867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017327	GAA	2	6	63426	63431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017327	ATC	2	6	63513	63518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017327	GGC	2	6	64529	64534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017327	CGC	2	6	64579	64584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017327	CCG	2	6	67829	67834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017327	TCC	2	6	67852	67857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017327	GTC	3	9	68031	68039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017327	CAG	2	6	68043	68048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017327	GCG	2	6	68093	68098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017327	CGC	2	6	68099	68104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017327	ATC	2	6	68131	68136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017327	ATC	2	6	68162	68167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017327	CAA	2	6	68284	68289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017327	GAT	2	6	69231	69236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017327	AGG	2	6	69324	69329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017327	AGG	3	9	69382	69390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017327	TGA	2	6	69432	69437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017327	CGC	2	6	69552	69557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017327	GCA	2	6	69631	69636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017327	GAA	2	6	69682	69687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017327	TTC	2	6	69767	69772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017327	GTT	2	6	69780	69785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017327	GTA	2	6	69786	69791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017327	CTG	2	6	69825	69830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017327	GCC	2	6	69862	69867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017327	GCC	2	6	69921	69926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017327	ATC	2	6	69968	69973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017327	CGT	2	6	70659	70664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017327	GGC	2	6	70934	70939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017327	GTT	2	6	71443	71448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017327	GTC	2	6	71848	71853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017327	GGA	2	6	71896	71901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017327	GAT	2	6	72637	72642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017327	CCG	2	6	73051	73056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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