MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GTAAT	2	10	15045	15054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017326	GAGGG	2	10	28218	28227	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017326	GGTCG	2	10	28575	28584	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017326	TCCAC	2	10	32514	32523	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017326	CGTGC	2	10	49859	49868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017326	TGCCG	2	10	60753	60762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017326	GCCGA	2	10	77040	77049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017326	GGCCG	2	10	102598	102607	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017326	GGCCA	2	10	114456	114465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017326	CAACT	2	10	122135	122144	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017326	TGCAG	2	10	126625	126634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017326	TTGCG	2	10	126683	126692	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017326	TTCCT	2	10	140242	140251	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017326	GGGGA	2	10	141871	141880	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017326	AGCCG	2	10	148459	148468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017326	CAAAG	2	10	160340	160349	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017326	GGGCA	2	10	208621	208630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017326	CAGCC	2	10	209258	209267	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017326	CTGCC	2	10	215899	215908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017326	GGCAG	2	10	216060	216069	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017326	TTGAA	2	10	230594	230603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017326	CCGGC	2	10	246474	246483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017326	AGCAC	2	10	256354	256363	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017326	GTCGA	2	10	299590	299599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017326	TCCCG	2	10	333923	333932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017326	AGTGA	2	10	337970	337979	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017326	GGAGG	2	10	343523	343532	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017326	TTGCA	2	10	349419	349428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017326	GGCCG	2	10	353221	353230	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017326	CGTTG	2	10	363804	363813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017326	CTTAG	2	10	367392	367401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017326	GCAGC	2	10	371477	371486	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017326	CCCAT	2	10	392453	392462	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_017326	GGGAT	2	10	392468	392477	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017326	CAGAT	2	10	392655	392664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017326	CGAGG	2	10	395271	395280	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017326	GCGCA	2	10	411225	411234	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017326	TGCAA	2	10	429891	429900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017326	CGACC	2	10	433466	433475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017326	ACAAA	2	10	448965	448974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017326	GGTCG	2	10	453201	453210	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017326	GTTTT	2	10	477221	477230	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017326	GCCGG	2	10	479876	479885	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017326	CTGCC	2	10	483107	483116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017326	GGCAG	2	10	484428	484437	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017326	CGGGA	2	10	489065	489074	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017326	CCGCA	2	10	492219	492228	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017326	CGACC	2	10	499536	499545	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017326	GGGAG	2	10	518694	518703	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017326	CGCGG	2	10	553935	553944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017326	TCGGA	2	10	578928	578937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017326	TGCAG	2	10	580014	580023	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017326	GTGCG	2	10	595208	595217	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017326	CCTTG	2	10	609995	610004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017326	TCCGG	2	10	615335	615344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017326	GAGCG	2	10	619707	619716	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017326	GGGCA	2	10	621727	621736	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017326	CGCCC	2	10	633884	633893	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_017326	AAATC	2	10	657632	657641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017326	TCCGG	2	10	679128	679137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017326	GGTCG	2	10	695947	695956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017326	CATGG	2	10	697591	697600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017326	TGGGC	2	10	724238	724247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017326	GACGT	2	10	724770	724779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017326	GGGCG	2	10	724868	724877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017326	TTTTA	2	10	742846	742855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017326	GCCCT	2	10	743693	743702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_017326	AGAGC	2	10	759290	759299	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017326	ATTTG	2	10	786493	786502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017326	CGACC	2	10	803683	803692	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_017326	TGCGG	2	10	815136	815145	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017326	CGCAT	2	10	830757	830766	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017326	GCCGC	2	10	836379	836388	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017326	CGGGG	2	10	852335	852344	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017326	GGCGG	2	10	862839	862848	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017326	AAAAT	2	10	892136	892145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017326	CTTCG	2	10	897774	897783	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017326	TCCCG	2	10	900623	900632	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_017326	CCCCT	2	10	904202	904211	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
80	NC_017326	TTTCA	2	10	904408	904417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017326	CCGGC	2	10	912501	912510	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017326	CCGTT	2	10	920994	921003	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017326	TTGCG	2	10	922419	922428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017326	GCGCA	2	10	928809	928818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017326	CGCTG	2	10	928834	928843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017326	CGGGT	2	10	938132	938141	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017326	CGGCC	2	10	983723	983732	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_017326	GCGGA	2	10	987910	987919	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017326	CGCCC	2	10	990633	990642	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
90	NC_017326	TGCAG	2	10	999939	999948	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017326	CGGTG	2	10	1001588	1001597	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017326	TGCGC	2	10	1002246	1002255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017326	CCGTT	2	10	1003966	1003975	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017326	GCCGC	2	10	1009508	1009517	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_017326	CTAAC	2	10	1015809	1015818	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017326	AGGAA	2	10	1017348	1017357	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017326	CCCGG	2	10	1019150	1019159	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017326	GACGC	2	10	1022301	1022310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017326	GCGCC	2	10	1050375	1050384	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_017326	CCCCG	2	10	1058553	1058562	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
101	NC_017326	GCCGC	2	10	1067008	1067017	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_017326	GCGAC	2	10	1067268	1067277	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017326	AGGGA	2	10	1068737	1068746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017326	CGCCA	2	10	1070764	1070773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_017326	TCACC	2	10	1070819	1070828	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_017326	GACGC	2	10	1086731	1086740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017326	GCATC	2	10	1095737	1095746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017326	GTCTG	2	10	1106220	1106229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017326	CCTGC	2	10	1108819	1108828	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017326	GCTAT	2	10	1110131	1110140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017326	ACGGC	2	10	1119625	1119634	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017326	GTCCC	2	10	1127023	1127032	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_017326	AAATC	2	10	1132430	1132439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017326	TCTGG	2	10	1141851	1141860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017326	CGCGC	2	10	1142213	1142222	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017326	CCCGG	2	10	1149967	1149976	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_017326	GAAAG	2	10	1152149	1152158	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017326	CAACA	2	10	1155105	1155114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017326	CCTTT	2	10	1156053	1156062	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017326	AGCCT	2	10	1162402	1162411	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017326	CTTCC	2	10	1184190	1184199	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017326	CGACG	2	10	1208884	1208893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017326	ACTCC	2	10	1212195	1212204	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017326	CGATT	2	10	1243422	1243431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017326	TTCCG	2	10	1257527	1257536	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017326	AAACG	2	10	1262071	1262080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017326	CGCCA	2	10	1265680	1265689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017326	GAAAG	2	10	1277855	1277864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017326	CTGCC	2	10	1280390	1280399	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017326	TAGAG	2	10	1285835	1285844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017326	GTCAA	2	10	1285921	1285930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017326	GGTCG	2	10	1305105	1305114	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017326	GGGAG	2	10	1321729	1321738	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017326	TGTTA	2	10	1326990	1326999	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017326	AAATA	2	10	1363944	1363953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017326	AAAGG	2	10	1370640	1370649	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017326	GCCGG	2	10	1374916	1374925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017326	TTTGC	2	10	1395961	1395970	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017326	ACAAA	2	10	1412061	1412070	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017326	GAAAA	2	10	1415494	1415503	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017326	AACAT	2	10	1427414	1427423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017326	ATCAA	2	10	1428977	1428986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017326	CTTTC	2	10	1439482	1439491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017326	TATTT	2	10	1442312	1442321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017326	CCAAG	2	10	1473926	1473935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017326	AAGCC	2	10	1481058	1481067	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017326	AGGGC	2	10	1504185	1504194	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017326	ACACT	2	10	1526407	1526416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017326	CCCCG	2	10	1528631	1528640	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
150	NC_017326	GCGGT	2	10	1544690	1544699	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017326	AGATT	2	10	1550392	1550401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017326	TGAAA	2	10	1550548	1550557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017326	TGCAC	2	10	1550685	1550694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_017326	TTGCG	2	10	1567665	1567674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017326	TTTCC	2	10	1572085	1572094	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017326	GCGCC	2	10	1579261	1579270	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_017326	GGCGC	2	10	1592737	1592746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017326	TCAAT	2	10	1604464	1604473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_017326	GTGCC	2	10	1614668	1614677	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017326	CGACC	2	10	1618714	1618723	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.