MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GCGTG	2	10	5981	5990	0 %	20 %	60 %	20 %	384538255
2	NC_017326	GGCTC	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	384538255
3	NC_017326	TGCCG	2	10	7688	7697	0 %	20 %	40 %	40 %	384538257
4	NC_017326	GCGCC	2	10	9097	9106	0 %	0 %	40 %	60 %	384538258
5	NC_017326	CCGCG	2	10	10132	10141	0 %	0 %	40 %	60 %	384538260
6	NC_017326	CAAGC	2	10	10498	10507	40 %	0 %	20 %	40 %	384538260
7	NC_017326	GCGCC	2	10	10860	10869	0 %	0 %	40 %	60 %	384538260
8	NC_017326	CCGAG	2	10	17191	17200	20 %	0 %	40 %	40 %	384538266
9	NC_017326	GGCTC	2	10	17658	17667	0 %	20 %	40 %	40 %	384538267
10	NC_017326	GGATG	2	10	18793	18802	20 %	20 %	60 %	0 %	384538269
11	NC_017326	CGCAG	2	10	19606	19615	20 %	0 %	40 %	40 %	384538270
12	NC_017326	GCCGA	2	10	20115	20124	20 %	0 %	40 %	40 %	384538270
13	NC_017326	GCCGG	2	10	21992	22001	0 %	0 %	60 %	40 %	384538272
14	NC_017326	TGACG	2	10	25114	25123	20 %	20 %	40 %	20 %	384538274
15	NC_017326	GCCAG	2	10	25720	25729	20 %	0 %	40 %	40 %	384538274
16	NC_017326	GCTCG	2	10	29577	29586	0 %	20 %	40 %	40 %	384538277
17	NC_017326	GCCCT	2	10	30976	30985	0 %	20 %	20 %	60 %	384538277
18	NC_017326	CGATC	2	10	32904	32913	20 %	20 %	20 %	40 %	384538279
19	NC_017326	CCGCA	2	10	38226	38235	20 %	0 %	20 %	60 %	384538283
20	NC_017326	TCGCC	2	10	40215	40224	0 %	20 %	20 %	60 %	384538285
21	NC_017326	CGGCC	2	10	41805	41814	0 %	0 %	40 %	60 %	384538285
22	NC_017326	GAAAA	2	10	42413	42422	80 %	0 %	20 %	0 %	384538286
23	NC_017326	TCCGG	2	10	42768	42777	0 %	20 %	40 %	40 %	384538286
24	NC_017326	CGGCG	2	10	44289	44298	0 %	0 %	60 %	40 %	384538287
25	NC_017326	TGTCA	2	10	44340	44349	20 %	40 %	20 %	20 %	384538287
26	NC_017326	CGCGG	2	10	44686	44695	0 %	0 %	60 %	40 %	384538288
27	NC_017326	TTCGC	2	10	45194	45203	0 %	40 %	20 %	40 %	384538288
28	NC_017326	ACGAA	2	10	47848	47857	60 %	0 %	20 %	20 %	384538290
29	NC_017326	CCGGT	2	10	48006	48015	0 %	20 %	40 %	40 %	384538290
30	NC_017326	CGGCA	2	10	49109	49118	20 %	0 %	40 %	40 %	384538291
31	NC_017326	GGCGA	2	10	54530	54539	20 %	0 %	60 %	20 %	384538296
32	NC_017326	GCAGG	2	10	57090	57099	20 %	0 %	60 %	20 %	384538298
33	NC_017326	GGATG	2	10	59560	59569	20 %	20 %	60 %	0 %	384538301
34	NC_017326	CGGGT	2	10	62932	62941	0 %	20 %	60 %	20 %	384538304
35	NC_017326	CTCGA	2	10	64304	64313	20 %	20 %	20 %	40 %	384538305
36	NC_017326	CTCGC	2	10	67580	67589	0 %	20 %	20 %	60 %	384538307
37	NC_017326	AACAC	2	10	68819	68828	60 %	0 %	0 %	40 %	384538308
38	NC_017326	CGGCG	2	10	73739	73748	0 %	0 %	60 %	40 %	384538313
39	NC_017326	GGCCG	2	10	78543	78552	0 %	0 %	60 %	40 %	384538318
40	NC_017326	GGCGG	2	10	81740	81749	0 %	0 %	80 %	20 %	384538321
41	NC_017326	GTGGC	2	10	83173	83182	0 %	20 %	60 %	20 %	384538323
42	NC_017326	TGCGC	2	10	85489	85498	0 %	20 %	40 %	40 %	384538324
43	NC_017326	TGCCG	2	10	88649	88658	0 %	20 %	40 %	40 %	384538327
44	NC_017326	GGGAC	2	10	91712	91721	20 %	0 %	60 %	20 %	384538329
45	NC_017326	GATCG	2	10	92533	92542	20 %	20 %	40 %	20 %	384538331
46	NC_017326	GAAAT	2	10	93939	93948	60 %	20 %	20 %	0 %	384538333
47	NC_017326	TGTCG	2	10	95076	95085	0 %	40 %	40 %	20 %	384538334
48	NC_017326	GATGC	2	10	96528	96537	20 %	20 %	40 %	20 %	384538336
49	NC_017326	CGGAG	2	10	97112	97121	20 %	0 %	60 %	20 %	384538336
50	NC_017326	AGGGC	2	10	97544	97553	20 %	0 %	60 %	20 %	384538336
51	NC_017326	TGCCG	2	10	100543	100552	0 %	20 %	40 %	40 %	384538339
52	NC_017326	GGCCC	2	10	105770	105779	0 %	0 %	40 %	60 %	384538345
53	NC_017326	TCGGC	2	10	106403	106412	0 %	20 %	40 %	40 %	384538345
54	NC_017326	CGGTC	2	10	107283	107292	0 %	20 %	40 %	40 %	384538346
55	NC_017326	GGCGA	2	10	108205	108214	20 %	0 %	60 %	20 %	384538346
56	NC_017326	TCGCC	2	10	108471	108480	0 %	20 %	20 %	60 %	384538346
57	NC_017326	AGATC	2	10	114489	114498	40 %	20 %	20 %	20 %	384538350
58	NC_017326	TCGTC	2	10	116661	116670	0 %	40 %	20 %	40 %	384538351
59	NC_017326	CGCGC	2	10	118459	118468	0 %	0 %	40 %	60 %	384538351
60	NC_017326	AGCGC	2	10	118695	118704	20 %	0 %	40 %	40 %	384538351
61	NC_017326	GCCTT	2	10	118964	118973	0 %	40 %	20 %	40 %	384538352
62	NC_017326	CCGAT	2	10	119584	119593	20 %	20 %	20 %	40 %	384538352
63	NC_017326	TCGCC	2	10	119837	119846	0 %	20 %	20 %	60 %	384538352
64	NC_017326	CCGAC	2	10	125259	125268	20 %	0 %	20 %	60 %	384538355
65	NC_017326	GGCGA	2	10	125300	125309	20 %	0 %	60 %	20 %	384538355
66	NC_017326	TCGGC	2	10	127377	127386	0 %	20 %	40 %	40 %	384538358
67	NC_017326	GGCGA	2	10	128259	128268	20 %	0 %	60 %	20 %	384538359
68	NC_017326	GCTCG	2	10	128903	128912	0 %	20 %	40 %	40 %	384538359
69	NC_017326	CCTTG	2	10	133798	133807	0 %	40 %	20 %	40 %	384538364
70	NC_017326	GCCGC	2	10	136697	136706	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
71	NC_017326	GCCGC	2	10	137545	137554	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
72	NC_017326	ACGCG	2	10	138092	138101	20 %	0 %	40 %	40 %	384538367
73	NC_017326	GAAAG	2	10	140395	140404	60 %	0 %	40 %	0 %	384538370
74	NC_017326	GCCGG	2	10	141567	141576	0 %	0 %	60 %	40 %	384538372
75	NC_017326	TCGCC	2	10	146194	146203	0 %	20 %	20 %	60 %	384538377
76	NC_017326	AAGCG	2	10	146849	146858	40 %	0 %	40 %	20 %	384538377
77	NC_017326	CATCG	2	10	148804	148813	20 %	20 %	20 %	40 %	384538379
78	NC_017326	TACGC	2	10	149827	149836	20 %	20 %	20 %	40 %	384538380
79	NC_017326	CGGCG	2	10	149881	149890	0 %	0 %	60 %	40 %	384538380
80	NC_017326	GCTCG	2	10	150106	150115	0 %	20 %	40 %	40 %	384538380
81	NC_017326	GGAAC	2	10	151157	151166	40 %	0 %	40 %	20 %	384538381
82	NC_017326	GCTCG	2	10	151795	151804	0 %	20 %	40 %	40 %	384538381
83	NC_017326	TCGCC	2	10	154131	154140	0 %	20 %	20 %	60 %	384538383
84	NC_017326	CGCGC	2	10	154735	154744	0 %	0 %	40 %	60 %	384538384
85	NC_017326	ACCGG	2	10	155278	155287	20 %	0 %	40 %	40 %	384538385
86	NC_017326	CCGCG	2	10	157965	157974	0 %	0 %	40 %	60 %	384538388
87	NC_017326	TCGGC	2	10	163655	163664	0 %	20 %	40 %	40 %	384538392
88	NC_017326	TCCGG	2	10	164523	164532	0 %	20 %	40 %	40 %	384538393
89	NC_017326	CGATG	2	10	164929	164938	20 %	20 %	40 %	20 %	384538393
90	NC_017326	TGGCA	2	10	165271	165280	20 %	20 %	40 %	20 %	384538394
91	NC_017326	ACGGC	2	10	168457	168466	20 %	0 %	40 %	40 %	384538397
92	NC_017326	CGCGT	2	10	168596	168605	0 %	20 %	40 %	40 %	384538398
93	NC_017326	CGGCG	2	10	171723	171732	0 %	0 %	60 %	40 %	384538400
94	NC_017326	TGTAT	2	10	174172	174181	20 %	60 %	20 %	0 %	384538401
95	NC_017326	GGGTC	2	10	174508	174517	0 %	20 %	60 %	20 %	384538401
96	NC_017326	TTGCG	2	10	174622	174631	0 %	40 %	40 %	20 %	384538401
97	NC_017326	GCCGG	2	10	175809	175818	0 %	0 %	60 %	40 %	384538402
98	NC_017326	GTGCG	2	10	176991	177000	0 %	20 %	60 %	20 %	384538403
99	NC_017326	TGATT	2	10	177040	177049	20 %	60 %	20 %	0 %	384538403
100	NC_017326	TCCTG	2	10	180191	180200	0 %	40 %	20 %	40 %	384538407
101	NC_017326	GCCCG	2	10	181032	181041	0 %	0 %	40 %	60 %	384538407
102	NC_017326	CGGCT	2	10	190242	190251	0 %	20 %	40 %	40 %	384538417
103	NC_017326	CCGGT	2	10	193652	193661	0 %	20 %	40 %	40 %	384538419
104	NC_017326	GGCGC	2	10	194096	194105	0 %	0 %	60 %	40 %	384538419
105	NC_017326	CGATC	2	10	197848	197857	20 %	20 %	20 %	40 %	384538421
106	NC_017326	GCCCA	2	10	198709	198718	20 %	0 %	20 %	60 %	384538422
107	NC_017326	AAGGG	2	10	200100	200109	40 %	0 %	60 %	0 %	384538423
108	NC_017326	GCCCG	2	10	201028	201037	0 %	0 %	40 %	60 %	384538424
109	NC_017326	GCGCG	2	10	202137	202146	0 %	0 %	60 %	40 %	384538426
110	NC_017326	GCGAC	2	10	202878	202887	20 %	0 %	40 %	40 %	384538426
111	NC_017326	ACCTC	2	10	214178	214187	20 %	20 %	0 %	60 %	384538439
112	NC_017326	CGGCG	2	10	214994	215003	0 %	0 %	60 %	40 %	384538440
113	NC_017326	GCGAT	2	10	215056	215065	20 %	20 %	40 %	20 %	384538440
114	NC_017326	ATCCG	2	10	215092	215101	20 %	20 %	20 %	40 %	384538440
115	NC_017326	CGGCG	2	10	215700	215709	0 %	0 %	60 %	40 %	384538440
116	NC_017326	TCTTG	2	10	217034	217043	0 %	60 %	20 %	20 %	384538441
117	NC_017326	GGGGC	2	10	221412	221421	0 %	0 %	80 %	20 %	384538445
118	NC_017326	CAGAA	2	10	221915	221924	60 %	0 %	20 %	20 %	384538445
119	NC_017326	TGCGC	2	10	222271	222280	0 %	20 %	40 %	40 %	384538446
120	NC_017326	AGCGC	2	10	223922	223931	20 %	0 %	40 %	40 %	384538448
121	NC_017326	GATCA	2	10	230419	230428	40 %	20 %	20 %	20 %	384538454
122	NC_017326	AGGGA	2	10	230901	230910	40 %	0 %	60 %	0 %	384538455
123	NC_017326	CGGCG	2	10	231346	231355	0 %	0 %	60 %	40 %	384538456
124	NC_017326	GATGT	2	10	232278	232287	20 %	40 %	40 %	0 %	384538456
125	NC_017326	CAGTG	2	10	233301	233310	20 %	20 %	40 %	20 %	384538457
126	NC_017326	GGCCG	2	10	234147	234156	0 %	0 %	60 %	40 %	384538458
127	NC_017326	AGCGC	2	10	235004	235013	20 %	0 %	40 %	40 %	384538459
128	NC_017326	TGCGA	2	10	235807	235816	20 %	20 %	40 %	20 %	384538459
129	NC_017326	GTCGC	2	10	236002	236011	0 %	20 %	40 %	40 %	384538459
130	NC_017326	GAGCG	2	10	240334	240343	20 %	0 %	60 %	20 %	384538464
131	NC_017326	GCATG	2	10	241553	241562	20 %	20 %	40 %	20 %	384538465
132	NC_017326	GGCCG	2	10	242710	242719	0 %	0 %	60 %	40 %	384538465
133	NC_017326	GCGCC	2	10	245781	245790	0 %	0 %	40 %	60 %	384538468
134	NC_017326	GCGAC	2	10	249535	249544	20 %	0 %	40 %	40 %	384538474
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258	NC_017326	GGCGA	2	10	464203	464212	20 %	0 %	60 %	20 %	384538703
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