MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GTCG	2	8	3727	3734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017326	CGAA	2	8	5295	5302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017326	GCTG	2	8	8146	8153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017326	CCGT	2	8	11005	11012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017326	CCAG	2	8	14036	14043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017326	ACTA	2	8	14109	14116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017326	AATC	2	8	14125	14132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017326	CGTC	2	8	15035	15042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017326	AAAG	2	8	15146	15153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017326	GGTC	2	8	17755	17762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017326	TCCC	2	8	18160	18167	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017326	TGCC	2	8	23713	23720	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017326	GAGG	2	8	28176	28183	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017326	GTCG	2	8	28200	28207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017326	GCGG	2	8	38352	38359	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017326	ACGG	2	8	42241	42248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017326	TCAA	2	8	43257	43264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017326	GAGG	2	8	48611	48618	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017326	CCAG	2	8	49734	49741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017326	TCCC	2	8	58809	58816	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017326	GGCG	2	8	63487	63494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017326	GAAG	2	8	63644	63651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017326	GCCG	2	8	63658	63665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017326	CCCG	2	8	73162	73169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017326	CCGC	2	8	79671	79678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017326	GGGC	2	8	81903	81910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017326	ACAG	2	8	81985	81992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017326	GCAA	2	8	83107	83114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017326	CCGC	2	8	84416	84423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017326	CTAA	2	8	84432	84439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017326	GCTT	2	8	92075	92082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017326	CCGC	2	8	97773	97780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_017326	TTAA	2	8	125199	125206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017326	CTTC	2	8	126585	126592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017326	TCCG	2	8	128105	128112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017326	CGGA	2	8	128125	128132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017326	CATG	2	8	132578	132585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017326	AAGT	2	8	136419	136426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017326	CTCC	2	8	139350	139357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017326	GCGG	2	8	145711	145718	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017326	CGCA	2	8	145724	145731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017326	AGGG	2	8	149807	149814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017326	AAGC	2	8	150829	150836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017326	GCCC	2	8	156507	156514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017326	GCCG	2	8	161067	161074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017326	TTCA	2	8	177127	177134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017326	CATC	2	8	179416	179423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017326	GCAC	2	8	201287	201294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017326	CCTT	2	8	202052	202059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017326	CTGT	2	8	205155	205162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017326	GGCC	2	8	206443	206450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017326	ATGG	2	8	208189	208196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017326	GATC	2	8	210897	210904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017326	CGCA	2	8	210938	210945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017326	GGTC	2	8	212396	212403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017326	TGCC	2	8	212616	212623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017326	CAAG	2	8	213730	213737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017326	GCCC	2	8	216104	216111	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017326	CAGG	2	8	216123	216130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017326	TGCC	2	8	218234	218241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017326	ACCG	2	8	219809	219816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017326	CGGA	2	8	223151	223158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017326	AGCC	2	8	223364	223371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017326	GAAA	2	8	223446	223453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017326	GCGG	2	8	224598	224605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017326	AACA	2	8	227415	227422	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017326	ATGA	2	8	230541	230548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017326	CGGA	2	8	234664	234671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017326	GGCC	2	8	246455	246462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017326	GGGT	2	8	246620	246627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017326	CCGC	2	8	259185	259192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_017326	CGGC	2	8	260951	260958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017326	GATG	2	8	263875	263882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017326	GCGG	3	12	269672	269683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017326	CCGC	2	8	269697	269704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017326	GGCG	2	8	274607	274614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017326	ACCA	2	8	274797	274804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017326	GCGG	2	8	283747	283754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017326	GGAA	2	8	284345	284352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017326	GACA	2	8	284412	284419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017326	AAGA	2	8	285428	285435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017326	CGGC	2	8	290382	290389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017326	TCGA	2	8	291927	291934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017326	GGAC	2	8	292332	292339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017326	GCGG	2	8	293681	293688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017326	ACGC	2	8	299809	299816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017326	CTTC	2	8	305987	305994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017326	AGGC	2	8	307097	307104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017326	CCAG	2	8	312365	312372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017326	GCAT	2	8	312458	312465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017326	TTGC	2	8	323719	323726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017326	CGGA	2	8	323960	323967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017326	GCCT	2	8	326425	326432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017326	GCTC	2	8	333983	333990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017326	CGCC	2	8	334423	334430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_017326	ATTC	2	8	337566	337573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017326	CGGG	2	8	337889	337896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017326	CGAA	2	8	338263	338270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017326	CGAT	2	8	340370	340377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017326	CGCT	2	8	341636	341643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017326	TGCG	2	8	342273	342280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017326	TCGA	2	8	342886	342893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017326	GCCG	2	8	344794	344801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017326	CCGA	2	8	349435	349442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017326	GCTC	2	8	349525	349532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017326	GAAC	2	8	351934	351941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017326	GTCG	2	8	357045	357052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017326	CGAT	2	8	358370	358377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017326	TGCC	2	8	363796	363803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017326	CTGG	2	8	367314	367321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017326	CGGG	2	8	369543	369550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017326	CCAG	2	8	378535	378542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017326	GCGG	2	8	383554	383561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017326	TCGT	2	8	383564	383571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017326	CCAG	2	8	387727	387734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017326	CGGA	2	8	388009	388016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017326	GCAG	2	8	392404	392411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017326	GCTT	2	8	392486	392493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017326	ATGA	2	8	392621	392628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017326	CGGC	2	8	392948	392955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017326	GACG	2	8	393177	393184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017326	GGCG	2	8	393428	393435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017326	TCAC	2	8	393638	393645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017326	ACGA	2	8	395507	395514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017326	GCCG	2	8	395544	395551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017326	AGTG	2	8	396565	396572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017326	GCCA	2	8	398150	398157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017326	CTGC	2	8	398215	398222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017326	GCAA	2	8	400225	400232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017326	TGAT	2	8	401103	401110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017326	GCCG	2	8	401625	401632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017326	TCTT	2	8	404758	404765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017326	TCCG	2	8	405290	405297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017326	CGTC	2	8	406042	406049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017326	CGCA	2	8	409434	409441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017326	AAAT	2	8	409505	409512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017326	TGCA	2	8	411123	411130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017326	GGCC	2	8	413490	413497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017326	TACA	2	8	415061	415068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017326	TTGG	2	8	415917	415924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017326	ATGC	2	8	417008	417015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017326	AAGG	2	8	423921	423928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017326	GCCT	2	8	431769	431776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017326	CCGT	2	8	431878	431885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017326	TGGC	2	8	432050	432057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017326	CCGC	2	8	433410	433417	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017326	ATGT	2	8	435395	435402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017326	GGCT	2	8	437968	437975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017326	GCGG	2	8	438059	438066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017326	CGGA	2	8	441396	441403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017326	GAAG	2	8	441773	441780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017326	GATC	2	8	570386	570393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_017326	CCGG	2	8	581990	581997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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484	NC_017326	GGGC	2	8	1492661	1492668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
485	NC_017326	CAGG	2	8	1492676	1492683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_017326	GTCG	2	8	1492839	1492846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_017326	CCGC	2	8	1492857	1492864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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491	NC_017326	CGGG	2	8	1503443	1503450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_017326	GAGG	2	8	1503455	1503462	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017326	CCAG	2	8	1511488	1511495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_017326	CGCT	2	8	1515395	1515402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_017326	TCCG	2	8	1526762	1526769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
496	NC_017326	CTGG	2	8	1528648	1528655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_017326	GAAT	2	8	1538802	1538809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017326	CTCC	2	8	1541073	1541080	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_017326	TCCA	2	8	1550787	1550794	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_017326	TCGA	2	8	1553273	1553280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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