MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 24986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	GCA	2	6	6	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
2	NC_017326	GAG	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
3	NC_017326	AGA	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538251
4	NC_017326	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
5	NC_017326	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
6	NC_017326	CCG	2	6	279	284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
7	NC_017326	CGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
8	NC_017326	GCA	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
9	NC_017326	TCG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
10	NC_017326	GTC	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
11	NC_017326	GGT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538251
12	NC_017326	GAC	3	9	390	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
13	NC_017326	TCA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538251
14	NC_017326	GGT	2	6	573	578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538251
15	NC_017326	GAT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538251
16	NC_017326	TTC	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538251
17	NC_017326	TCG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
18	NC_017326	CGC	2	6	758	763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538251
19	NC_017326	TCA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538251
20	NC_017326	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538251
21	NC_017326	ACG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538251
22	NC_017326	TGC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538251
23	NC_017326	GAT	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538251
24	NC_017326	GGA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538251
25	NC_017326	TCG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
26	NC_017326	GGA	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538252
27	NC_017326	TCG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
28	NC_017326	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538252
29	NC_017326	CAG	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
30	NC_017326	ACA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538252
31	NC_017326	CGG	2	6	1550	1555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
32	NC_017326	GGC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
33	NC_017326	ACG	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
34	NC_017326	AAC	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384538252
35	NC_017326	GGC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538252
36	NC_017326	GAT	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538252
37	NC_017326	CGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538252
38	NC_017326	CCG	2	6	1824	1829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538252
39	NC_017326	CAT	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538252
40	NC_017326	ACG	2	6	2101	2106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538252
41	NC_017326	AAG	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538252
42	NC_017326	GAC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
43	NC_017326	GCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
44	NC_017326	CGC	2	6	2432	2437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
45	NC_017326	CCG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
46	NC_017326	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
47	NC_017326	ACG	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
48	NC_017326	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
49	NC_017326	GCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
50	NC_017326	TCG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
51	NC_017326	GCC	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
52	NC_017326	ATC	2	6	2851	2856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538253
53	NC_017326	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
54	NC_017326	AGC	3	9	2947	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
55	NC_017326	GCA	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538253
56	NC_017326	GCC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538253
57	NC_017326	TCC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538253
58	NC_017326	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
59	NC_017326	GTC	3	9	3429	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
60	NC_017326	TGC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538253
61	NC_017326	GGC	2	6	3558	3563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538253
62	NC_017326	TGC	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
63	NC_017326	GCA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538254
64	NC_017326	CCG	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
65	NC_017326	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
66	NC_017326	AGT	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538254
67	NC_017326	GCC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
68	NC_017326	CGC	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
69	NC_017326	GAA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538254
70	NC_017326	CTC	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538254
71	NC_017326	TCG	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
72	NC_017326	GCG	2	6	4578	4583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
73	NC_017326	TCA	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538254
74	NC_017326	TCG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538254
75	NC_017326	CCG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
76	NC_017326	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538254
77	NC_017326	GCG	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
78	NC_017326	GGC	2	6	4847	4852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
79	NC_017326	CGC	2	6	4941	4946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538254
80	NC_017326	GCG	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538254
81	NC_017326	GCT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
82	NC_017326	GCC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
83	NC_017326	GCG	3	9	5492	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
84	NC_017326	GCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
85	NC_017326	CGC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
86	NC_017326	GCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
87	NC_017326	GGC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
88	NC_017326	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
89	NC_017326	GCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
90	NC_017326	GCT	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
91	NC_017326	GTC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
92	NC_017326	GAC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538255
93	NC_017326	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538255
94	NC_017326	CGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
95	NC_017326	CTT	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538255
96	NC_017326	GCA	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538255
97	NC_017326	CTT	2	6	6098	6103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538255
98	NC_017326	CGG	2	6	6246	6251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
99	NC_017326	CCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
100	NC_017326	CGC	2	6	6417	6422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538255
101	NC_017326	GCG	2	6	6423	6428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538255
102	NC_017326	CCG	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538256
103	NC_017326	CAC	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538256
104	NC_017326	CGC	2	6	6617	6622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538256
105	NC_017326	CGG	2	6	6703	6708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538256
106	NC_017326	AGC	2	6	6907	6912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538256
107	NC_017326	GCC	3	9	6918	6926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538256
108	NC_017326	GCC	2	6	6958	6963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538256
109	NC_017326	TCG	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538256
110	NC_017326	CCG	2	6	7047	7052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538256
111	NC_017326	CAT	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538256
112	NC_017326	CGA	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
113	NC_017326	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538257
114	NC_017326	GCA	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
115	NC_017326	AGA	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538257
116	NC_017326	TGG	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538257
117	NC_017326	GCC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538257
118	NC_017326	CGA	2	6	7635	7640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
119	NC_017326	CGA	3	9	7704	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
120	NC_017326	CGC	3	9	7761	7769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538257
121	NC_017326	AGG	2	6	7802	7807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538257
122	NC_017326	ACG	2	6	8063	8068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538257
123	NC_017326	GGT	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538258
124	NC_017326	CTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538258
125	NC_017326	GCG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538258
126	NC_017326	GCC	2	6	8571	8576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538258
127	NC_017326	GGA	2	6	8589	8594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538258
128	NC_017326	GCG	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538258
129	NC_017326	GCC	3	9	8632	8640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538258
130	NC_017326	TGC	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538258
131	NC_017326	GCA	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538258
132	NC_017326	CTG	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538258
133	NC_017326	TCG	2	6	8816	8821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538258
134	NC_017326	CTC	2	6	8851	8856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538258
135	NC_017326	CGC	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538258
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254	NC_017326	TTC	2	6	15988	15993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538265
255	NC_017326	CAG	2	6	16038	16043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538265
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258	NC_017326	GGC	2	6	16245	16250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538265
259	NC_017326	TCA	2	6	16268	16273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538265
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