MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	TC	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017326	GC	3	6	5209	5214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017326	GC	3	6	10995	11000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017326	CG	3	6	12110	12115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017326	GC	3	6	16405	16410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017326	CG	3	6	21573	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017326	GC	3	6	27455	27460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017326	CG	3	6	28432	28437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017326	CA	3	6	28648	28653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017326	AC	3	6	43138	43143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017326	CT	3	6	58841	58846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017326	CT	3	6	61759	61764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017326	CG	3	6	63606	63611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017326	CG	3	6	71976	71981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017326	CG	3	6	71992	71997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017326	GA	3	6	73294	73299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017326	TG	3	6	84405	84410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017326	CG	4	8	84559	84566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017326	GA	3	6	89001	89006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017326	CG	3	6	101535	101540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017326	GC	3	6	101557	101562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017326	GC	3	6	107171	107176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017326	GA	3	6	128145	128150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017326	GC	3	6	132429	132434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017326	CT	3	6	147659	147664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017326	CA	3	6	147692	147697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017326	CG	3	6	149731	149736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017326	CG	3	6	165186	165191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017326	CG	4	8	170061	170068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017326	GC	4	8	170095	170102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017326	CG	3	6	177083	177088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017326	CG	3	6	205226	205231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017326	TC	3	6	206570	206575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017326	GT	3	6	206633	206638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017326	AG	3	6	206685	206690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017326	GC	3	6	207764	207769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017326	CG	3	6	208682	208687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017326	GC	3	6	212413	212418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017326	GT	4	8	219913	219920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017326	CG	3	6	219943	219948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017326	GC	3	6	227488	227493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017326	CG	3	6	229840	229845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017326	CG	3	6	236285	236290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017326	CG	3	6	236364	236369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017326	GT	3	6	236973	236978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017326	CG	3	6	238784	238789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017326	GA	3	6	238830	238835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017326	CA	3	6	243003	243008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017326	CG	3	6	246431	246436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017326	CT	3	6	255272	255277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017326	AT	3	6	255314	255319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017326	GC	3	6	256330	256335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017326	CG	3	6	262853	262858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017326	CG	3	6	274753	274758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017326	CG	3	6	280008	280013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017326	CA	3	6	283762	283767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017326	GC	4	8	284960	284967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017326	GC	3	6	285290	285295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017326	GA	3	6	292623	292628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017326	CG	3	6	297805	297810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017326	CG	3	6	299672	299677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017326	GC	3	6	299884	299889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017326	GA	3	6	306047	306052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017326	TG	3	6	321836	321841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017326	GC	3	6	322028	322033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017326	GC	3	6	325105	325110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017326	GC	3	6	326366	326371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017326	CG	3	6	334033	334038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017326	GT	3	6	337664	337669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017326	AG	3	6	340402	340407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017326	AG	3	6	345383	345388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017326	AC	3	6	348588	348593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017326	CT	3	6	349383	349388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017326	GT	3	6	367423	367428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017326	CG	3	6	367438	367443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017326	CT	3	6	368271	368276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017326	CG	3	6	368591	368596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017326	TC	3	6	371189	371194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017326	GC	3	6	371293	371298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017326	GA	3	6	371493	371498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017326	GC	3	6	371549	371554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017326	AT	3	6	372426	372431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017326	GA	3	6	376150	376155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017326	GA	3	6	378631	378636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017326	CG	3	6	387657	387662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017326	GC	3	6	387970	387975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017326	CA	3	6	391646	391651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017326	AG	3	6	392031	392036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017326	CG	3	6	392902	392907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017326	TG	3	6	395388	395393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017326	TC	3	6	397065	397070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017326	GC	3	6	397707	397712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017326	TC	3	6	397742	397747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017326	GT	3	6	397934	397939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017326	CG	4	8	398818	398825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017326	AG	3	6	398870	398875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017326	CT	3	6	399775	399780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017326	TC	3	6	399901	399906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017326	GC	3	6	400340	400345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017326	TC	3	6	401150	401155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017326	CG	3	6	401190	401195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017326	AG	3	6	402913	402918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017326	AT	3	6	403091	403096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017326	TG	3	6	404815	404820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017326	AG	3	6	405184	405189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017326	GC	3	6	405953	405958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017326	CG	3	6	406010	406015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017326	CG	3	6	409417	409422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017326	GC	3	6	409730	409735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017326	GC	3	6	409753	409758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017326	GC	3	6	411216	411221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017326	CG	3	6	414587	414592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017326	TC	3	6	415900	415905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017326	GA	3	6	417205	417210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017326	TC	3	6	418444	418449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017326	TC	3	6	425707	425712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017326	CT	3	6	426624	426629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017326	GT	3	6	433396	433401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017326	GC	3	6	435200	435205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017326	AG	3	6	440498	440503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017326	TA	3	6	441148	441153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017326	GC	3	6	441522	441527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017326	GC	4	8	449032	449039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017326	CA	3	6	453274	453279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017326	GC	4	8	455120	455127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017326	GC	3	6	455162	455167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017326	GC	3	6	457414	457419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017326	CG	3	6	457561	457566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017326	GC	3	6	458108	458113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017326	CT	3	6	458248	458253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017326	CT	3	6	466642	466647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017326	CT	3	6	466769	466774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017326	TC	3	6	470679	470684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017326	GC	3	6	474645	474650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017326	CT	3	6	474656	474661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017326	CT	3	6	477082	477087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017326	GC	3	6	477145	477150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017326	AC	3	6	478963	478968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017326	AT	3	6	478991	478996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017326	GC	3	6	484471	484476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017326	CT	3	6	484523	484528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017326	GT	3	6	499470	499475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017326	CG	3	6	507284	507289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017326	AT	3	6	507387	507392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017326	CA	3	6	508470	508475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017326	GC	3	6	511144	511149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017326	GC	3	6	525666	525671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017326	CA	3	6	531227	531232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017326	GA	18	36	541256	541291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017326	GA	3	6	541304	541309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017326	CG	3	6	542324	542329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017326	CG	3	6	547904	547909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017326	CG	3	6	548096	548101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.