MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017326	C	6	6	554	559	0 %	0 %	0 %	100 %	384538251
2	NC_017326	A	7	7	3087	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	384538253
3	NC_017326	T	6	6	4200	4205	0 %	100 %	0 %	0 %	384538254
4	NC_017326	C	6	6	7002	7007	0 %	0 %	0 %	100 %	384538256
5	NC_017326	T	6	6	7258	7263	0 %	100 %	0 %	0 %	384538257
6	NC_017326	C	6	6	15156	15161	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_017326	T	6	6	17824	17829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017326	G	6	6	19356	19361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017326	C	9	9	27445	27453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_017326	A	6	6	29220	29225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017326	G	6	6	30756	30761	0 %	0 %	100 %	0 %	384538277
12	NC_017326	G	6	6	43075	43080	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017326	T	6	6	49357	49362	0 %	100 %	0 %	0 %	384538291
14	NC_017326	G	7	7	66897	66903	0 %	0 %	100 %	0 %	384538306
15	NC_017326	C	7	7	84472	84478	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_017326	C	6	6	87078	87083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_017326	C	6	6	87178	87183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_017326	T	6	6	97254	97259	0 %	100 %	0 %	0 %	384538336
19	NC_017326	G	6	6	99616	99621	0 %	0 %	100 %	0 %	384538338
20	NC_017326	C	6	6	101815	101820	0 %	0 %	0 %	100 %	384538340
21	NC_017326	C	6	6	102611	102616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_017326	C	6	6	107206	107211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_017326	A	6	6	107454	107459	100 %	0 %	0 %	0 %	384538346
24	NC_017326	G	6	6	108030	108035	0 %	0 %	100 %	0 %	384538346
25	NC_017326	G	6	6	109047	109052	0 %	0 %	100 %	0 %	384538346
26	NC_017326	G	6	6	114468	114473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017326	G	6	6	118132	118137	0 %	0 %	100 %	0 %	384538351
28	NC_017326	G	6	6	120278	120283	0 %	0 %	100 %	0 %	384538352
29	NC_017326	C	6	6	126595	126600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017326	T	6	6	141306	141311	0 %	100 %	0 %	0 %	384538371
31	NC_017326	T	6	6	143881	143886	0 %	100 %	0 %	0 %	384538374
32	NC_017326	A	6	6	148429	148434	100 %	0 %	0 %	0 %	384538378
33	NC_017326	G	6	6	148533	148538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017326	A	6	6	150760	150765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017326	T	6	6	155161	155166	0 %	100 %	0 %	0 %	384538385
36	NC_017326	C	6	6	158598	158603	0 %	0 %	0 %	100 %	384538388
37	NC_017326	G	6	6	165348	165353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017326	G	6	6	167948	167953	0 %	0 %	100 %	0 %	384538397
39	NC_017326	C	6	6	176325	176330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_017326	A	6	6	178380	178385	100 %	0 %	0 %	0 %	384538405
41	NC_017326	C	6	6	196356	196361	0 %	0 %	0 %	100 %	384538420
42	NC_017326	T	6	6	196425	196430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017326	C	6	6	201273	201278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_017326	T	6	6	206288	206293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017326	G	6	6	206514	206519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017326	A	6	6	206561	206566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017326	A	6	6	213669	213674	100 %	0 %	0 %	0 %	384538438
48	NC_017326	G	6	6	215925	215930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017326	C	6	6	216026	216031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_017326	G	6	6	222666	222671	0 %	0 %	100 %	0 %	384538446
51	NC_017326	A	6	6	223451	223456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017326	A	6	6	227786	227791	100 %	0 %	0 %	0 %	384538451
53	NC_017326	T	6	6	230565	230570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017326	A	7	7	232508	232514	100 %	0 %	0 %	0 %	384538456
55	NC_017326	T	6	6	232722	232727	0 %	100 %	0 %	0 %	384538457
56	NC_017326	T	6	6	234172	234177	0 %	100 %	0 %	0 %	384538458
57	NC_017326	A	6	6	244786	244791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_017326	A	6	6	285452	285457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017326	A	6	6	287482	287487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017326	C	6	6	292668	292673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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67	NC_017326	T	7	7	304985	304991	0 %	100 %	0 %	0 %	384538528
68	NC_017326	G	8	8	305771	305778	0 %	0 %	100 %	0 %	384538530
69	NC_017326	C	6	6	307258	307263	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_017326	G	7	7	310214	310220	0 %	0 %	100 %	0 %	384538533
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83	NC_017326	A	6	6	372277	372282	100 %	0 %	0 %	0 %	384538603
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87	NC_017326	C	6	6	392725	392730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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91	NC_017326	T	6	6	409485	409490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_017326	G	6	6	417132	417137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_017326	C	6	6	443490	443495	0 %	0 %	0 %	100 %	384538683
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102	NC_017326	G	6	6	444754	444759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017326	T	7	7	445325	445331	0 %	100 %	0 %	0 %	384538686
104	NC_017326	G	6	6	457600	457605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017326	A	6	6	468088	468093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_017326	T	6	6	476050	476055	0 %	100 %	0 %	0 %	384538711
112	NC_017326	C	6	6	483100	483105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017326	G	6	6	484439	484444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017326	C	6	6	485946	485951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_017326	G	6	6	486058	486063	0 %	0 %	100 %	0 %	384538723
116	NC_017326	T	6	6	491347	491352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017326	A	7	7	491629	491635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017326	A	6	6	492206	492211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017326	C	6	6	492283	492288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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121	NC_017326	C	6	6	505492	505497	0 %	0 %	0 %	100 %	384538739
122	NC_017326	A	7	7	506812	506818	100 %	0 %	0 %	0 %	384538740
123	NC_017326	A	7	7	507656	507662	100 %	0 %	0 %	0 %	384538741
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126	NC_017326	A	6	6	512399	512404	100 %	0 %	0 %	0 %	384538746
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130	NC_017326	G	6	6	520613	520618	0 %	0 %	100 %	0 %	384538751
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144	NC_017326	A	6	6	564303	564308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.