MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017325	CGCAGG	2	12	37763	37774	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017325	GACAGG	2	12	82651	82662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017325	CGGAGG	2	12	85707	85718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017325	CGGCCG	2	12	101519	101530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017325	CAAAAA	2	12	160130	160141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017325	AAGGTG	2	12	250882	250893	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017325	TCCGCC	2	12	257468	257479	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017325	CATCGG	2	12	321298	321309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017325	CGGCTT	2	12	336435	336446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017325	GACAAG	2	12	359614	359625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017325	CGGGCC	2	12	367207	367218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017325	AGAGAT	2	12	376658	376669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017325	AACAAA	2	12	406791	406802	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017325	CTTCTG	2	12	429684	429695	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017325	GAAGCG	2	12	468097	468108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017325	CGTCGG	2	12	488790	488801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017325	CCGAAC	2	12	508500	508511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017325	GGCCGC	2	12	517488	517499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017325	TTCGTC	2	12	532258	532269	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017325	GGCAGG	2	12	532926	532937	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017325	CGGAGG	2	12	619758	619769	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017325	AAATAT	2	12	631347	631358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017325	CGATAG	2	12	635693	635704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017325	TATAGG	2	12	649241	649252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017325	TCAACG	2	12	650340	650351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017325	GGCCAT	2	12	653168	653179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017325	CTGGCT	2	12	686289	686300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017325	GCTTGC	2	12	727208	727219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017325	TTCGGC	2	12	729897	729908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017325	GTTTAC	2	12	732962	732973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017325	CTTCCC	2	12	737474	737485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017325	CCGGCT	2	12	738391	738402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017325	GAATCG	2	12	749615	749626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017325	ATTCCC	2	12	750942	750953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017325	GTCCCG	2	12	789319	789330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017325	CTCCAG	2	12	799987	799998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017325	TCGTCC	2	12	870460	870471	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017325	GAATCA	2	12	878980	878991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017325	AGCCGC	2	12	903956	903967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017325	AGTCTA	2	12	942019	942030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017325	CCACAA	3	18	950298	950315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017325	CGGCCT	2	12	994255	994266	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017325	GCGCCG	2	12	1096089	1096100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017325	TGCTCG	2	12	1103117	1103128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017325	GAATTA	2	12	1103626	1103637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017325	CCGAAA	2	12	1106964	1106975	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017325	CTTTTT	2	12	1129891	1129902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017325	GAACCG	2	12	1166543	1166554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017325	CCCCAG	2	12	1192747	1192758	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017325	CGGAGG	2	12	1234006	1234017	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017325	ACGCGG	2	12	1248138	1248149	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017325	GCCTTG	2	12	1300164	1300175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017325	ATCCCG	2	12	1308465	1308476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017325	CCTTCT	2	12	1362795	1362806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017325	AGCGCC	2	12	1380807	1380818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017325	GTTTTT	2	12	1442757	1442768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017325	TCGGTC	2	12	1450204	1450215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017325	GCACCG	2	12	1450246	1450257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017325	TAGCAC	2	12	1501363	1501374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017325	GCGACA	2	12	1580642	1580653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017325	GAGATC	2	12	1653262	1653273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017325	CGGTGC	2	12	1747657	1747668	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017325	TTCGGT	2	12	1777609	1777620	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017325	GTTTTT	2	12	1795453	1795464	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017325	TGACGA	2	12	1805833	1805844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017325	TTTGTC	2	12	1814332	1814343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017325	AGGCCA	2	12	1826683	1826694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017325	GAAAAG	2	12	1827655	1827666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017325	GACCTT	2	12	1848557	1848568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017325	AGCACC	2	12	1862940	1862951	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017325	TCAGCC	2	12	1862987	1862998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017325	AGGTGA	2	12	1867477	1867488	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017325	CGGCTC	2	12	1897297	1897308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017325	ATAATG	2	12	1902201	1902212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017325	GTCAAC	2	12	1935466	1935477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017325	AAGGGT	2	12	1940727	1940738	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017325	TTCCGA	2	12	1945214	1945225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017325	AATTTG	2	12	1984990	1985001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017325	CCGTCT	2	12	2012919	2012930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017325	AGGAAA	2	12	2064754	2064765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017325	CATTCG	2	12	2069512	2069523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017325	CGGCCG	2	12	2076888	2076899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017325	GGTCCC	2	12	2088089	2088100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017325	GGTCCC	2	12	2089808	2089819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017325	ACCGAG	2	12	2113976	2113987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017325	CCGGCG	2	12	2120675	2120686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017325	CCGGCA	2	12	2137801	2137812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017325	TAAAAA	2	12	2161962	2161973	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017325	CGACAA	2	12	2163171	2163182	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017325	CTCCCT	2	12	2175265	2175276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017325	TTCCTG	2	12	2189813	2189824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017325	CGCGTC	2	12	2205858	2205869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017325	ATTTGC	2	12	2351877	2351888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017325	TTGCGC	2	12	2371414	2371425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017325	TCCTTG	2	12	2371438	2371449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017325	TGACGG	2	12	2383296	2383307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017325	TGAGGC	2	12	2489440	2489451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017325	ACCGGC	2	12	2492913	2492924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017325	CGGAAA	2	12	2503160	2503171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017325	GACGAA	2	12	2529048	2529059	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017325	AAATGA	2	12	2605422	2605433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017325	ACGATC	2	12	2612597	2612608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017325	GCGGCC	2	12	2641217	2641228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017325	TCGCCC	2	12	2654294	2654305	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017325	GGCTGC	2	12	2731539	2731550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017325	ATGTGT	2	12	2733807	2733818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017325	CCGGAT	2	12	2735115	2735126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017325	GAGAAA	2	12	2738254	2738265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017325	TTTCTC	2	12	2740134	2740145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017325	GAATAA	2	12	2750897	2750908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017325	GACCGA	2	12	2753243	2753254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017325	ACGTAA	2	12	2778978	2778989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017325	AGCGGC	2	12	2824914	2824925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017325	AGAGCG	2	12	2847036	2847047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017325	GTCTAG	2	12	2868981	2868992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017325	CTCGAT	2	12	2908909	2908920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017325	TCATGT	2	12	2962653	2962664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017325	ACATGA	2	12	2962688	2962699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017325	GAAGCG	2	12	2979582	2979593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017325	GCGTTC	2	12	2986058	2986069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017325	CGCAGG	2	12	3017654	3017665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017325	GATTGA	2	12	3063201	3063212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017325	GAAAAG	2	12	3065248	3065259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017325	CAAGCG	2	12	3114571	3114582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017325	TATGTG	2	12	3141407	3141418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017325	CCGGAT	2	12	3142686	3142697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017325	GAGAAA	2	12	3145825	3145836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017325	TTTCTC	2	12	3147705	3147716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017325	ACGTAA	2	12	3253025	3253036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017325	CCTGCG	2	12	3271537	3271548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017325	GGCATC	2	12	3307872	3307883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017325	CATGTT	2	12	3312920	3312931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017325	CAGCCC	2	12	3365702	3365713	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017325	GGGGCC	2	12	3396345	3396356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017325	GAATCG	2	12	3397191	3397202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017325	GCATAT	2	12	3408642	3408653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017325	CCTCTC	2	12	3424212	3424223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017325	CTCGGT	2	12	3471779	3471790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017325	AGTGTC	2	12	3509817	3509828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017325	TCCCGC	2	12	3556286	3556297	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017325	ACCGAG	2	12	3561516	3561527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017325	CGTTTC	2	12	3581225	3581236	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017325	AGAGAA	2	12	3587987	3587998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017325	TTTCTC	2	12	3589868	3589879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017325	ATCCGG	2	12	3593007	3593018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017325	CAAAAG	2	12	3624147	3624158	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_017325	GCGCGA	2	12	3664678	3664689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017325	AGCCGC	2	12	3684148	3684159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017325	CAGCGG	2	12	3716122	3716133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017325	CGCGCT	2	12	3758278	3758289	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017325	CTGCCC	2	12	3759388	3759399	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017325	ACGGAA	2	12	3786112	3786123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_017325	ATGGTG	2	12	3830375	3830386	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017325	TCGACT	2	12	3858484	3858495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017325	CGGGAA	2	12	3875751	3875762	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_017325	ACCGAG	2	12	3878807	3878818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017325	GGATAT	2	12	3882542	3882553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.