MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 59464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017325	GGC	2	6	60	65	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
2	NC_017325	CGT	2	6	195	200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
3	NC_017325	CGA	2	6	215	220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534465
4	NC_017325	AAT	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384534465
5	NC_017325	CAC	2	6	264	269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534465
6	NC_017325	CAG	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534465
7	NC_017325	GCG	2	6	382	387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
8	NC_017325	GTC	2	6	388	393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
9	NC_017325	CCG	2	6	402	407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
10	NC_017325	CGG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
11	NC_017325	GCC	2	6	433	438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
12	NC_017325	CGC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
13	NC_017325	TCG	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
14	NC_017325	TCT	2	6	648	653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534465
15	NC_017325	CGT	2	6	699	704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
16	NC_017325	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534465
17	NC_017325	TGC	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
18	NC_017325	GGT	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534465
19	NC_017325	CGC	2	6	903	908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
20	NC_017325	GGC	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
21	NC_017325	CGT	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
22	NC_017325	GCG	2	6	1039	1044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
23	NC_017325	CCG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
24	NC_017325	CGA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534465
25	NC_017325	CGT	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534465
26	NC_017325	CCG	2	6	1311	1316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
27	NC_017325	GCC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534465
28	NC_017325	CGG	2	6	1407	1412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534465
29	NC_017325	AGG	3	9	1703	1711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534466
30	NC_017325	CGA	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534466
31	NC_017325	CGG	3	9	1802	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534466
32	NC_017325	GCT	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
33	NC_017325	GGA	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534467
34	NC_017325	AGG	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534467
35	NC_017325	CCG	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
36	NC_017325	CGC	2	6	2186	2191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
37	NC_017325	TCG	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
38	NC_017325	GCG	2	6	2234	2239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534467
39	NC_017325	GCC	2	6	2261	2266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
40	NC_017325	GGA	2	6	2267	2272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534467
41	NC_017325	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
42	NC_017325	CGA	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
43	NC_017325	GCT	2	6	2354	2359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
44	NC_017325	GCA	2	6	2368	2373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
45	NC_017325	CAG	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
46	NC_017325	GCG	2	6	2472	2477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534467
47	NC_017325	AGC	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
48	NC_017325	GCC	2	6	2517	2522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
49	NC_017325	CGA	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
50	NC_017325	CCG	2	6	2644	2649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
51	NC_017325	CGA	2	6	2657	2662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
52	NC_017325	GCT	3	9	2681	2689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
53	NC_017325	CCG	2	6	2701	2706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
54	NC_017325	ATG	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534467
55	NC_017325	CTG	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
56	NC_017325	CGT	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
57	NC_017325	CGG	2	6	2811	2816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534467
58	NC_017325	GAT	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534467
59	NC_017325	CGC	2	6	2877	2882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534467
60	NC_017325	GCA	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
61	NC_017325	GAG	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534467
62	NC_017325	CCT	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534467
63	NC_017325	GTC	2	6	3009	3014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534467
64	NC_017325	TGG	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534467
65	NC_017325	TAT	2	6	3111	3116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534467
66	NC_017325	GCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534467
67	NC_017325	AGC	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534467
68	NC_017325	CCA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534467
69	NC_017325	GAA	3	9	3273	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534467
70	NC_017325	CGG	2	6	3391	3396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534468
71	NC_017325	CTC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534468
72	NC_017325	TCG	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534468
73	NC_017325	CGG	2	6	3687	3692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534468
74	NC_017325	GGC	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534468
75	NC_017325	GAG	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534469
76	NC_017325	GCC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534469
77	NC_017325	CGG	2	6	4033	4038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
78	NC_017325	GAG	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534469
79	NC_017325	GCG	2	6	4110	4115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
80	NC_017325	GGC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
81	NC_017325	GGC	2	6	4282	4287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
82	NC_017325	GGA	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534469
83	NC_017325	GCG	3	9	4385	4393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
84	NC_017325	AGG	3	9	4422	4430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534469
85	NC_017325	GGC	2	6	4487	4492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534469
86	NC_017325	GCC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534469
87	NC_017325	TGC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534469
88	NC_017325	TCG	3	9	4566	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534469
89	NC_017325	ACG	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534469
90	NC_017325	TGG	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534469
91	NC_017325	TCG	2	6	4701	4706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534469
92	NC_017325	CAG	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534470
93	NC_017325	CCA	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534470
94	NC_017325	CGG	2	6	4790	4795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534470
95	NC_017325	TTC	2	6	4854	4859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534470
96	NC_017325	CGC	2	6	4997	5002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534470
97	NC_017325	GCC	2	6	5078	5083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534470
98	NC_017325	CCG	2	6	5234	5239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534470
99	NC_017325	ACG	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534470
100	NC_017325	GAT	2	6	5330	5335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534470
101	NC_017325	CCT	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534470
102	NC_017325	GCG	2	6	5773	5778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534470
103	NC_017325	CGC	2	6	5844	5849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534470
104	NC_017325	TCC	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534471
105	NC_017325	GAC	2	6	6122	6127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534471
106	NC_017325	CGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534471
107	NC_017325	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534471
108	NC_017325	CGA	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534471
109	NC_017325	CGA	3	9	6550	6558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534471
110	NC_017325	GCC	2	6	6732	6737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534472
111	NC_017325	CGG	2	6	6769	6774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534472
112	NC_017325	GGC	2	6	6843	6848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534472
113	NC_017325	CGC	2	6	6889	6894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534472
114	NC_017325	GAA	2	6	6899	6904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534472
115	NC_017325	GGC	2	6	6910	6915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534472
116	NC_017325	CGA	2	6	7293	7298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534473
117	NC_017325	AGC	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534473
118	NC_017325	TTC	3	9	7342	7350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534473
119	NC_017325	CCG	2	6	7368	7373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534473
120	NC_017325	GCC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534473
121	NC_017325	TCA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534473
122	NC_017325	GGC	2	6	7498	7503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534473
123	NC_017325	GCC	2	6	7612	7617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534473
124	NC_017325	CGA	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534473
125	NC_017325	CGC	2	6	7747	7752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534473
126	NC_017325	GCA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534473
127	NC_017325	GCC	2	6	7819	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534473
128	NC_017325	TCC	2	6	7850	7855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534473
129	NC_017325	CCG	2	6	8309	8314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534474
130	NC_017325	TGA	2	6	8413	8418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534474
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132	NC_017325	GGA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534474
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252	NC_017325	GGC	2	6	16764	16769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534482
253	NC_017325	TCG	2	6	16788	16793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534482
254	NC_017325	CGG	2	6	16801	16806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534482
255	NC_017325	GAT	2	6	16808	16813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534482
256	NC_017325	CGA	2	6	16956	16961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534482
257	NC_017325	GTT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534482
258	NC_017325	GGC	2	6	17174	17179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534483
259	NC_017325	TGC	2	6	17255	17260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534483
260	NC_017325	TCG	2	6	17356	17361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534483
261	NC_017325	CTT	2	6	17378	17383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534483
262	NC_017325	ACA	2	6	17431	17436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534483
263	NC_017325	GAC	2	6	17448	17453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534483
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267	NC_017325	CCG	2	6	17749	17754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534484
268	NC_017325	GCC	2	6	17829	17834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534484
269	NC_017325	CGC	2	6	18015	18020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534485
270	NC_017325	CGC	2	6	18029	18034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534485
271	NC_017325	GAA	2	6	18057	18062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534485
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275	NC_017325	GCA	2	6	18152	18157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534485
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279	NC_017325	CGG	2	6	18680	18685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534486
280	NC_017325	GGC	2	6	18712	18717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534486
281	NC_017325	GCC	2	6	18735	18740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534486
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285	NC_017325	GCG	2	6	18820	18825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534486
286	NC_017325	GCG	2	6	18890	18895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534486
287	NC_017325	CCG	2	6	18932	18937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534486
288	NC_017325	CTC	2	6	19162	19167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534486
289	NC_017325	CCT	2	6	19193	19198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534486
290	NC_017325	CGC	2	6	19326	19331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534486
291	NC_017325	CGA	2	6	19443	19448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534486
292	NC_017325	GAG	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534486
293	NC_017325	CAT	2	6	19497	19502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534486
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302	NC_017325	CCA	2	6	20113	20118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534487
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495	NC_017325	GGA	3	9	31828	31836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534494
496	NC_017325	CTG	2	6	31904	31909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534494
497	NC_017325	GTC	2	6	32015	32020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534494
498	NC_017325	TCG	2	6	32091	32096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534494
499	NC_017325	TGC	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534494
500	NC_017325	CTA	2	6	32221	32226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534494

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