MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017324	TTGCTT	2	12	4457	4468	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017324	TCCTTG	2	12	11742	11753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017324	CTGGCA	2	12	41678	41689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017324	CGGGCC	2	12	48911	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017324	GTTTCT	2	12	67734	67745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017324	GTGGCT	2	12	78972	78983	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017324	CGTCCG	2	12	82728	82739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017324	GGCGCG	2	12	126265	126276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017324	GCTTCG	2	12	152953	152964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017324	CTGCGG	2	12	157856	157867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017324	ATGACG	2	12	167465	167476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017324	TGCGCT	2	12	187798	187809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017324	TCACTG	2	12	234100	234111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017324	CGGTCC	2	12	251029	251040	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017324	CGGCAA	2	12	260475	260486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017324	GCGACG	2	12	269208	269219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017324	AGCGCG	2	12	269283	269294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017324	GGCAGT	2	12	269705	269716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017324	TTGGCA	2	12	284148	284159	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017324	TCACTC	2	12	287626	287637	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017324	ATCGGC	2	12	287740	287751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017324	GTGGCG	2	12	309834	309845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017324	GAGGGG	2	12	383573	383584	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017324	CGGGTG	2	12	406035	406046	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017324	CATTTT	2	12	454143	454154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017324	CGATGC	2	12	489142	489153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017324	TCTTGC	2	12	495164	495175	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017324	CAGCGC	2	12	519897	519908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017324	ATGCAC	2	12	595094	595105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017324	GGCGAC	2	12	611600	611611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017324	CGCCAT	2	12	623963	623974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017324	TTCCCT	2	12	626891	626902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017324	TCGGCA	2	12	659530	659541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017324	TGCCGC	2	12	659658	659669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017324	GTCCCA	2	12	693975	693986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017324	GCCGAC	2	12	694360	694371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017324	GTCCCA	2	12	714024	714035	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017324	GCCGAC	2	12	714410	714421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017324	TCGCCT	2	12	750505	750516	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017324	CGATGC	2	12	771081	771092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017324	GAAACG	2	12	794592	794603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017324	GGAAGC	2	12	804545	804556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017324	CTACGC	2	12	830316	830327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017324	CAGGCG	2	12	845696	845707	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017324	GATTTT	2	12	852039	852050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017324	CAACGA	2	12	880621	880632	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017324	GCTTCC	2	12	897618	897629	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017324	AGGGGA	2	12	905600	905611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017324	GACCCT	2	12	905922	905933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017324	GTCGAC	2	12	910965	910976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017324	CGGGCT	2	12	930511	930522	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017324	GTCTAT	2	12	930734	930745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017324	GCAGTC	2	12	943010	943021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017324	CCACTC	2	12	952638	952649	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017324	CGAGGA	2	12	954355	954366	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017324	AGTCGC	2	12	960339	960350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017324	TTGCAT	2	12	963547	963558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017324	CGGCGC	2	12	963748	963759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017324	GAGCGC	2	12	968452	968463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017324	CCATTC	2	12	1030724	1030735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017324	GCCGCA	2	12	1052198	1052209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017324	AGGCCG	2	12	1055677	1055688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017324	TCAGCG	2	12	1067843	1067854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017324	TTGCGC	2	12	1071558	1071569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017324	CGCTGA	2	12	1095515	1095526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017324	GGCCGG	2	12	1157559	1157570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017324	CCCTGC	2	12	1178760	1178771	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017324	GCCGCA	2	12	1213388	1213399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017324	GCTCCA	2	12	1215777	1215788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017324	CCTTGG	2	12	1238278	1238289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017324	CCGGAT	2	12	1252605	1252616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017324	AAGCCA	2	12	1311066	1311077	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017324	TCCTGT	2	12	1332989	1333000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017324	GCGCCC	2	12	1333947	1333958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017324	TTCCGT	2	12	1345644	1345655	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017324	GGCTGC	2	12	1371169	1371180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017324	ATGGCA	2	12	1399170	1399181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017324	TTCCTC	2	12	1425934	1425945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017324	CGGGTG	2	12	1438274	1438285	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017324	ATCGAT	2	12	1439478	1439489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017324	GAGCCG	2	12	1452296	1452307	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017324	AACTTC	2	12	1473172	1473183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017324	CCCTTC	2	12	1475570	1475581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017324	GACAGC	2	12	1510232	1510243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017324	TCACCA	2	12	1529652	1529663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017324	GCGCGA	2	12	1535757	1535768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017324	CCGCTG	2	12	1554051	1554062	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017324	TCGGCG	2	12	1583421	1583432	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017324	CGTGAC	2	12	1585908	1585919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017324	TGCCTT	2	12	1590513	1590524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017324	CGAAAC	2	12	1614121	1614132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.