MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017323	CCGGGT	2	12	23033	23044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017323	TCGGCA	2	12	32196	32207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017323	TGCCGC	2	12	32324	32335	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017323	GCGCCG	2	12	34975	34986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017323	GAAACT	2	12	46484	46495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017323	CCCGCT	2	12	77934	77945	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017323	TGCCTG	2	12	85646	85657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017323	TGCCGT	2	12	87213	87224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017323	CCGGGA	2	12	100687	100698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017323	TCGGCA	2	12	189296	189307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017323	TGCCGC	2	12	189424	189435	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017323	GCCTTC	2	12	274454	274465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017323	GCCTCC	2	12	376395	376406	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017323	TCGCAT	2	12	598375	598386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017323	AGCGTA	2	12	640968	640979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017323	GGCTTC	2	12	641347	641358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017323	CGAGTA	2	12	649776	649787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017323	GAACGG	2	12	699581	699592	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017323	TTGGGG	2	12	705457	705468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017323	AGTTCA	2	12	714629	714640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017323	GCCAAA	2	12	720829	720840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017323	ACGCGG	2	12	742623	742634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017323	TCACGC	2	12	742908	742919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017323	GCTGGC	2	12	763447	763458	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017323	GAAAGG	2	12	772727	772738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017323	CCGCTC	2	12	940779	940790	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017323	AGGCGA	2	12	1071983	1071994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017323	GCTTAT	2	12	1124963	1124974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017323	TAAATT	2	12	1131688	1131699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017323	CACCCT	2	12	1166709	1166720	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017323	CCTGCG	2	12	1217586	1217597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017323	GTTTCG	2	12	1253549	1253560	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017323	TGGGGC	2	12	1270948	1270959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017323	CGAAAC	2	12	1271735	1271746	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017323	GCTGAA	2	12	1319460	1319471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017323	GAAAGG	2	12	1376673	1376684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017323	CGATTG	2	12	1400582	1400593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017323	GCCTGT	2	12	1433352	1433363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017323	TTGCAC	2	12	1440442	1440453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017323	CGGCGC	2	12	1469924	1469935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017323	TTTGGG	2	12	1483124	1483135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017323	TCCGCA	2	12	1529205	1529216	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017323	AGCTCA	2	12	1542685	1542696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017323	CCCGCG	2	12	1559919	1559930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017323	CCGCCT	2	12	1577747	1577758	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017323	TGGCGG	2	12	1632234	1632245	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017323	AGCCAC	2	12	1644320	1644331	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017323	GTCTCG	2	12	1645131	1645142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017323	GTAGTC	2	12	1685181	1685192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017323	GGAATC	2	12	1686952	1686963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.