MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02

Total Repeats: 1222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017323	GCGCA	2	10	1728	1737	20 %	0 %	40 %	40 %	384532949
2	NC_017323	TTGCC	2	10	4767	4776	0 %	40 %	20 %	40 %	384532950
3	NC_017323	GCGCC	2	10	6278	6287	0 %	0 %	40 %	60 %	384532952
4	NC_017323	CTGCT	2	10	6464	6473	0 %	40 %	20 %	40 %	384532953
5	NC_017323	GCCGC	2	10	6945	6954	0 %	0 %	40 %	60 %	384532953
6	NC_017323	CGCTG	2	10	8322	8331	0 %	20 %	40 %	40 %	384532954
7	NC_017323	TCAGG	2	10	11878	11887	20 %	20 %	40 %	20 %	384532957
8	NC_017323	CGGTT	2	10	11896	11905	0 %	40 %	40 %	20 %	384532957
9	NC_017323	CGGCT	2	10	12422	12431	0 %	20 %	40 %	40 %	384532957
10	NC_017323	CCTTT	2	10	12608	12617	0 %	60 %	0 %	40 %	384532957
11	NC_017323	GCCCG	2	10	18421	18430	0 %	0 %	40 %	60 %	384532962
12	NC_017323	GGCGC	2	10	18998	19007	0 %	0 %	60 %	40 %	384532963
13	NC_017323	CGGGA	2	10	19073	19082	20 %	0 %	60 %	20 %	384532963
14	NC_017323	TGCAA	2	10	20302	20311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017323	GCGCT	2	10	20734	20743	0 %	20 %	40 %	40 %	384532964
16	NC_017323	CGACC	2	10	23917	23926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017323	GCGCC	2	10	26782	26791	0 %	0 %	40 %	60 %	384532970
18	NC_017323	CCGCA	2	10	30309	30318	20 %	0 %	20 %	60 %	384532973
19	NC_017323	GATCG	2	10	33371	33380	20 %	20 %	40 %	20 %	384532976
20	NC_017323	GCTCT	2	10	33608	33617	0 %	40 %	20 %	40 %	384532976
21	NC_017323	TTGCC	2	10	36406	36415	0 %	40 %	20 %	40 %	384532979
22	NC_017323	GAAAA	2	10	36696	36705	80 %	0 %	20 %	0 %	384532980
23	NC_017323	GATCA	2	10	36821	36830	40 %	20 %	20 %	20 %	384532980
24	NC_017323	GTCCG	2	10	37789	37798	0 %	20 %	40 %	40 %	384532981
25	NC_017323	CGCGC	2	10	38699	38708	0 %	0 %	40 %	60 %	384532983
26	NC_017323	CCATT	2	10	38782	38791	20 %	40 %	0 %	40 %	384532983
27	NC_017323	GCGCA	2	10	39703	39712	20 %	0 %	40 %	40 %	384532983
28	NC_017323	AATCG	2	10	42003	42012	40 %	20 %	20 %	20 %	384532983
29	NC_017323	ACAAA	2	10	42355	42364	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017323	GGTCG	2	10	46592	46601	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017323	GCTCG	2	10	48301	48310	0 %	20 %	40 %	40 %	384532988
32	NC_017323	CTGGC	2	10	49192	49201	0 %	20 %	40 %	40 %	384532989
33	NC_017323	TCTTG	2	10	55682	55691	0 %	60 %	20 %	20 %	384532995
34	NC_017323	TGCTC	2	10	58164	58173	0 %	40 %	20 %	40 %	384532997
35	NC_017323	TCCGC	2	10	62565	62574	0 %	20 %	20 %	60 %	384533000
36	NC_017323	GGCAT	2	10	62992	63001	20 %	20 %	40 %	20 %	384533001
37	NC_017323	AGGTG	2	10	63899	63908	20 %	20 %	60 %	0 %	384533001
38	NC_017323	CCGGA	2	10	64685	64694	20 %	0 %	40 %	40 %	384533002
39	NC_017323	CGGCG	2	10	67235	67244	0 %	0 %	60 %	40 %	384533004
40	NC_017323	TGCCA	2	10	69726	69735	20 %	20 %	20 %	40 %	384533006
41	NC_017323	GTTTT	2	10	70696	70705	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017323	CGACG	2	10	71387	71396	20 %	0 %	40 %	40 %	384533008
43	NC_017323	CGGCG	2	10	71540	71549	0 %	0 %	60 %	40 %	384533008
44	NC_017323	TACGG	2	10	71634	71643	20 %	20 %	40 %	20 %	384533008
45	NC_017323	CCGGC	2	10	71953	71962	0 %	0 %	40 %	60 %	384533008
46	NC_017323	GCGCA	2	10	72305	72314	20 %	0 %	40 %	40 %	384533008
47	NC_017323	GCCGG	2	10	73347	73356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017323	GCGCT	2	10	73952	73961	0 %	20 %	40 %	40 %	384533012
49	NC_017323	GAAGT	2	10	74275	74284	40 %	20 %	40 %	0 %	384533013
50	NC_017323	CTGCC	2	10	76577	76586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_017323	TGCGG	2	10	76913	76922	0 %	20 %	60 %	20 %	384533016
52	NC_017323	GCCAC	2	10	77162	77171	20 %	0 %	20 %	60 %	384533016
53	NC_017323	GCCCT	2	10	77884	77893	0 %	20 %	20 %	60 %	384533016
54	NC_017323	GGCAG	2	10	77910	77919	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017323	GTATG	2	10	79529	79538	20 %	40 %	40 %	0 %	384533018
56	NC_017323	TATGA	2	10	79811	79820	40 %	40 %	20 %	0 %	384533018
57	NC_017323	CCGAT	2	10	80343	80352	20 %	20 %	20 %	40 %	384533018
58	NC_017323	CGGGA	2	10	82551	82560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017323	CGGCT	2	10	82965	82974	0 %	20 %	40 %	40 %	384533021
60	NC_017323	CCGCA	2	10	85706	85715	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017323	ACGGA	2	10	86316	86325	40 %	0 %	40 %	20 %	384533024
62	NC_017323	TGCGG	2	10	86995	87004	0 %	20 %	60 %	20 %	384533024
63	NC_017323	GTTCG	2	10	88407	88416	0 %	40 %	40 %	20 %	384533025
64	NC_017323	TCCGG	2	10	89744	89753	0 %	20 %	40 %	40 %	384533026
65	NC_017323	GCGAA	2	10	91276	91285	40 %	0 %	40 %	20 %	384533027
66	NC_017323	CGGGG	2	10	91745	91754	0 %	0 %	80 %	20 %	384533027
67	NC_017323	CAGTG	2	10	92434	92443	20 %	20 %	40 %	20 %	384533028
68	NC_017323	CGACC	2	10	93028	93037	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017323	CTTCC	2	10	94182	94191	0 %	40 %	0 %	60 %	384533030
70	NC_017323	GGCGC	2	10	94506	94515	0 %	0 %	60 %	40 %	384533030
71	NC_017323	ACCGT	2	10	96404	96413	20 %	20 %	20 %	40 %	384533031
72	NC_017323	GCCGA	2	10	97385	97394	20 %	0 %	40 %	40 %	384533031
73	NC_017323	GCCGT	2	10	97906	97915	0 %	20 %	40 %	40 %	384533032
74	NC_017323	GGGCG	2	10	98963	98972	0 %	0 %	80 %	20 %	384533033
75	NC_017323	TTCCA	2	10	98998	99007	20 %	40 %	0 %	40 %	384533033
76	NC_017323	CTTCG	2	10	101645	101654	0 %	40 %	20 %	40 %	384533034
77	NC_017323	GCGCC	2	10	102498	102507	0 %	0 %	40 %	60 %	384533035
78	NC_017323	CGGTG	2	10	103697	103706	0 %	20 %	60 %	20 %	384533036
79	NC_017323	CGCGG	2	10	105893	105902	0 %	0 %	60 %	40 %	384533038
80	NC_017323	ATCCG	2	10	106862	106871	20 %	20 %	20 %	40 %	384533039
81	NC_017323	TGCTC	2	10	107223	107232	0 %	40 %	20 %	40 %	384533040
82	NC_017323	TTCCG	2	10	111116	111125	0 %	40 %	20 %	40 %	384533042
83	NC_017323	GGAAT	2	10	112032	112041	40 %	20 %	40 %	0 %	384533042
84	NC_017323	GGGAG	2	10	112544	112553	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017323	CGGCG	2	10	113776	113785	0 %	0 %	60 %	40 %	384533044
86	NC_017323	GACGC	2	10	116209	116218	20 %	0 %	40 %	40 %	384533046
87	NC_017323	GCTGG	2	10	116297	116306	0 %	20 %	60 %	20 %	384533046
88	NC_017323	GCGAT	2	10	117715	117724	20 %	20 %	40 %	20 %	384533047
89	NC_017323	CGAGC	2	10	119360	119369	20 %	0 %	40 %	40 %	384533048
90	NC_017323	CACGA	2	10	120104	120113	40 %	0 %	20 %	40 %	384533049
91	NC_017323	GGCTG	2	10	121439	121448	0 %	20 %	60 %	20 %	384533049
92	NC_017323	CAGCC	2	10	123410	123419	20 %	0 %	20 %	60 %	384533051
93	NC_017323	GGCGA	2	10	125447	125456	20 %	0 %	60 %	20 %	384533053
94	NC_017323	GATGC	2	10	125481	125490	20 %	20 %	40 %	20 %	384533053
95	NC_017323	GCGGG	2	10	125589	125598	0 %	0 %	80 %	20 %	384533053
96	NC_017323	TTGCG	2	10	125784	125793	0 %	40 %	40 %	20 %	384533053
97	NC_017323	ATCGT	2	10	125858	125867	20 %	40 %	20 %	20 %	384533053
98	NC_017323	TCCGG	2	10	129937	129946	0 %	20 %	40 %	40 %	384533056
99	NC_017323	CGGTG	2	10	130928	130937	0 %	20 %	60 %	20 %	384533057
100	NC_017323	CGATC	2	10	138873	138882	20 %	20 %	20 %	40 %	384533064
101	NC_017323	ACGAA	2	10	144039	144048	60 %	0 %	20 %	20 %	384533069
102	NC_017323	CGCGG	2	10	147835	147844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017323	ATCAG	2	10	148016	148025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017323	GCTCG	2	10	148793	148802	0 %	20 %	40 %	40 %	384533073
105	NC_017323	ATAGG	2	10	153745	153754	40 %	20 %	40 %	0 %	384533077
106	NC_017323	GGCGA	2	10	153765	153774	20 %	0 %	60 %	20 %	384533077
107	NC_017323	CCGGC	2	10	154341	154350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017323	GGGCA	2	10	155180	155189	20 %	0 %	60 %	20 %	384533079
109	NC_017323	TGCGC	2	10	156063	156072	0 %	20 %	40 %	40 %	384533080
110	NC_017323	TCACC	2	10	156360	156369	20 %	20 %	0 %	60 %	384533080
111	NC_017323	AGGGC	2	10	163126	163135	20 %	0 %	60 %	20 %	384533085
112	NC_017323	GAACG	2	10	163136	163145	40 %	0 %	40 %	20 %	384533085
113	NC_017323	AAGGC	2	10	166138	166147	40 %	0 %	40 %	20 %	384533088
114	NC_017323	TGCCG	2	10	166668	166677	0 %	20 %	40 %	40 %	384533088
115	NC_017323	AAAAC	2	10	166934	166943	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017323	GCCGT	2	10	167095	167104	0 %	20 %	40 %	40 %	384533089
117	NC_017323	AGGGC	2	10	168669	168678	20 %	0 %	60 %	20 %	384533090
118	NC_017323	GCTCG	2	10	171899	171908	0 %	20 %	40 %	40 %	384533092
119	NC_017323	TCGGA	2	10	172847	172856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017323	TGCAG	2	10	173933	173942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017323	CGAGG	2	10	174227	174236	20 %	0 %	60 %	20 %	384533095
122	NC_017323	GACGA	2	10	174260	174269	40 %	0 %	40 %	20 %	384533095
123	NC_017323	CGGCC	2	10	176162	176171	0 %	0 %	40 %	60 %	384533097
124	NC_017323	GAGCA	2	10	176663	176672	40 %	0 %	40 %	20 %	384533097
125	NC_017323	AGCGA	2	10	179429	179438	40 %	0 %	40 %	20 %	384533100
126	NC_017323	CTCGC	2	10	179921	179930	0 %	20 %	20 %	60 %	384533100
127	NC_017323	TTTCG	2	10	180175	180184	0 %	60 %	20 %	20 %	384533100
128	NC_017323	GGCGC	2	10	183998	184007	0 %	0 %	60 %	40 %	384533104
129	NC_017323	TCCGA	2	10	188896	188905	20 %	20 %	20 %	40 %	384533108
130	NC_017323	GATCG	2	10	190471	190480	20 %	20 %	40 %	20 %	384533109
131	NC_017323	GCTCT	2	10	190708	190717	0 %	40 %	20 %	40 %	384533109
132	NC_017323	GTGCG	2	10	192062	192071	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017323	AGGGC	2	10	194896	194905	20 %	0 %	60 %	20 %	384533112
134	NC_017323	CGCCC	2	10	195219	195228	0 %	0 %	20 %	80 %	384533113
135	NC_017323	CGAAA	2	10	196686	196695	60 %	0 %	20 %	20 %	384533115
136	NC_017323	GTCCA	2	10	197653	197662	20 %	20 %	20 %	40 %	384533116
137	NC_017323	CGAAG	2	10	199186	199195	40 %	0 %	40 %	20 %	384533118
138	NC_017323	TCCCG	2	10	199675	199684	0 %	20 %	20 %	60 %	384533119
139	NC_017323	ACCGT	2	10	200819	200828	20 %	20 %	20 %	40 %	384533119
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141	NC_017323	AGCGG	2	10	201839	201848	20 %	0 %	60 %	20 %	384533119
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143	NC_017323	TCGGC	2	10	203678	203687	0 %	20 %	40 %	40 %	384533123
144	NC_017323	GCTTC	2	10	203870	203879	0 %	40 %	20 %	40 %	384533123
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148	NC_017323	TCCGG	2	10	212189	212198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017323	GAAGA	2	10	212292	212301	60 %	0 %	40 %	0 %	384533131
150	NC_017323	AGGCG	2	10	213366	213375	20 %	0 %	60 %	20 %	384533132
151	NC_017323	ACGCG	2	10	213803	213812	20 %	0 %	40 %	40 %	384533132
152	NC_017323	CGTGC	2	10	214571	214580	0 %	20 %	40 %	40 %	384533133
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154	NC_017323	CTTCG	2	10	216963	216972	0 %	40 %	20 %	40 %	384533136
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157	NC_017323	GGGCA	2	10	219007	219016	20 %	0 %	60 %	20 %	384533138
158	NC_017323	GGCCA	2	10	221565	221574	20 %	0 %	40 %	40 %	384533141
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161	NC_017323	GACGG	2	10	222870	222879	20 %	0 %	60 %	20 %	384533141
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181	NC_017323	GTCGC	2	10	256659	256668	0 %	20 %	40 %	40 %	384533162
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260	NC_017323	CGGGC	2	10	361457	361466	0 %	0 %	60 %	40 %	384533260
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264	NC_017323	CGGCG	2	10	369796	369805	0 %	0 %	60 %	40 %	384533266
265	NC_017323	TCGGC	2	10	370577	370586	0 %	20 %	40 %	40 %	384533266
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434	NC_017323	AAGCC	2	10	596881	596890	40 %	0 %	20 %	40 %	384533456
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