MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017323	TGCAA	2	10	20302	20311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017323	CGACC	2	10	23917	23926	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017323	ACAAA	2	10	42355	42364	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017323	GGTCG	2	10	46592	46601	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017323	GTTTT	2	10	70696	70705	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017323	GCCGG	2	10	73347	73356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017323	CTGCC	2	10	76577	76586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017323	GGCAG	2	10	77910	77919	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017323	CGGGA	2	10	82551	82560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017323	CCGCA	2	10	85706	85715	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017323	CGACC	2	10	93028	93037	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017323	GGGAG	2	10	112544	112553	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017323	CGCGG	2	10	147835	147844	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017323	ATCAG	2	10	148016	148025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017323	CCGGC	2	10	154341	154350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017323	AAAAC	2	10	166934	166943	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017323	TCGGA	2	10	172847	172856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017323	TGCAG	2	10	173933	173942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017323	GTGCG	2	10	192062	192071	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017323	CCTTG	2	10	206849	206858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017323	TCCGG	2	10	212189	212198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017323	GAGCG	2	10	216561	216570	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017323	GGGCA	2	10	218581	218590	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017323	TCACC	2	10	218732	218741	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017323	GAGCG	2	10	228265	228274	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017323	CGCCC	2	10	230847	230856	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_017323	AAATC	2	10	254677	254686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017323	TCCGG	2	10	276173	276182	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017323	GGTCG	2	10	292992	293001	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017323	CCTCG	2	10	293671	293680	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017323	TGCGA	2	10	295436	295445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017323	GACGT	2	10	321206	321215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017323	GGGCG	2	10	321304	321313	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017323	TTTTA	2	10	339284	339293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017323	GCCCT	2	10	340131	340140	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017323	AGAGC	2	10	355728	355737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017323	ATTTG	2	10	382936	382945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017323	CGACC	2	10	400124	400133	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017323	TGCGG	2	10	411572	411581	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017323	CGCAT	2	10	427195	427204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017323	GCCGC	2	10	432817	432826	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017323	GGCGG	2	10	459273	459282	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017323	GCAAG	2	10	471567	471576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017323	AAAAT	2	10	488607	488616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017323	CTTCG	2	10	494245	494254	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017323	TCCCG	2	10	497094	497103	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_017323	CCCCT	2	10	500673	500682	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_017323	TTTCA	2	10	500879	500888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017323	CCGGC	2	10	508971	508980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017323	CCGTT	2	10	517464	517473	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017323	ATCTA	2	10	517545	517554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017323	TTGCG	2	10	518888	518897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017323	GCGCA	2	10	525278	525287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017323	CGCTG	2	10	525303	525312	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017323	CGGGT	2	10	534601	534610	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017323	CTTGG	2	10	575286	575295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017323	GCGGA	2	10	581971	581980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017323	CGCCC	2	10	584694	584703	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_017323	ACCGT	2	10	607906	607915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017323	CCGAG	2	10	626279	626288	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017323	GGATG	2	10	627758	627767	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017323	GAAAC	2	10	627779	627788	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017323	CAACT	2	10	630237	630246	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017323	CGCGG	2	10	646265	646274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017323	GCCGG	2	10	649534	649543	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017323	GCCGC	2	10	652781	652790	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_017323	ATCGC	2	10	659638	659647	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017323	GATCG	2	10	659867	659876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017323	AGGAA	2	10	660487	660496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017323	TGCAC	2	10	683890	683899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017323	TCCCC	2	10	692953	692962	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017323	CGGTC	2	10	693050	693059	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017323	CGCGC	2	10	693084	693093	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_017323	GATCA	2	10	693099	693108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017323	GCGCC	2	10	709304	709313	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017323	GTCCC	2	10	716574	716583	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017323	AAATC	2	10	721980	721989	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017323	TCTGG	2	10	731386	731395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017323	CGCGC	2	10	731749	731758	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017323	TCCGA	2	10	734190	734199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017323	CCGCT	2	10	739159	739168	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017323	GAAAG	2	10	740970	740979	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017323	AATGA	2	10	744364	744373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017323	GAATG	2	10	747842	747851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017323	AGCCT	2	10	748057	748066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017323	TTTCT	2	10	749581	749590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017323	CGAAG	2	10	757105	757114	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017323	GAGCT	2	10	759756	759765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017323	CTTCC	2	10	769974	769983	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017323	CGACG	2	10	794669	794678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017323	ACTCC	2	10	797985	797994	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_017323	GATTC	2	10	829193	829202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017323	TTCCG	2	10	840507	840516	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017323	AAACG	2	10	845051	845060	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017323	CGCCA	2	10	848661	848670	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017323	GAAAG	2	10	860836	860845	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017323	CTGCC	2	10	863371	863380	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017323	TAGAG	2	10	868694	868703	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017323	GTCAA	2	10	868780	868789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017323	GGTCG	2	10	895967	895976	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017323	GGGAG	2	10	912590	912599	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017323	TGTTA	2	10	917851	917860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017323	GACAG	2	10	940658	940667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017323	AAATA	2	10	954804	954813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017323	CCCCA	2	10	957634	957643	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_017323	GGAAA	2	10	961501	961510	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017323	GCCGG	2	10	965780	965789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017323	TTTGC	2	10	986826	986835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017323	GAAAA	2	10	1006362	1006371	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017323	AACAT	2	10	1018282	1018291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017323	ATCAA	2	10	1019845	1019854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017323	CTTTC	2	10	1030350	1030359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017323	TATTT	2	10	1033180	1033189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017323	CCAAG	2	10	1064793	1064802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017323	AAGCC	2	10	1071926	1071935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017323	AGGGC	2	10	1095052	1095061	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017323	GCGGT	2	10	1149697	1149706	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017323	TCCGG	2	10	1149746	1149755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017323	AGATT	2	10	1155398	1155407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017323	GGAAT	2	10	1155832	1155841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017323	GAAGG	2	10	1164763	1164772	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017323	TTGCG	2	10	1172684	1172693	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017323	TTTCC	2	10	1177104	1177113	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017323	GCGCC	2	10	1184281	1184290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017323	GGCGC	2	10	1197634	1197643	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017323	TCAAT	2	10	1209359	1209368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017323	TGCCG	2	10	1220886	1220895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017323	CGACC	2	10	1224929	1224938	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017323	ATGTT	2	10	1231156	1231165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017323	GGGGC	2	10	1252256	1252265	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017323	GTAAT	2	10	1257618	1257627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017323	GTTGC	2	10	1260898	1260907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017323	GAGGG	2	10	1270765	1270774	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017323	GGTCG	2	10	1271122	1271131	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017323	TCCAC	2	10	1275061	1275070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017323	CGTGC	2	10	1292313	1292322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017323	TGCCG	2	10	1303210	1303219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017323	GCCGA	2	10	1319449	1319458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017323	CTGCC	2	10	1329495	1329504	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017323	GAGGG	2	10	1337866	1337875	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017323	GGTCC	2	10	1342563	1342572	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017323	GGCCA	2	10	1349736	1349745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017323	CAACT	2	10	1357415	1357424	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017323	TGCAG	2	10	1361904	1361913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017323	TTGCG	2	10	1361962	1361971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017323	TTCCT	2	10	1375521	1375530	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017323	GGGGA	2	10	1377159	1377168	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017323	AGCCG	2	10	1383747	1383756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017323	CAAAG	2	10	1395627	1395636	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017323	CGAAG	2	10	1396341	1396350	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017323	GGGCA	2	10	1443960	1443969	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017323	GAAGC	2	10	1444241	1444250	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017323	CAGCC	2	10	1444585	1444594	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
154	NC_017323	CTGCC	2	10	1451226	1451235	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_017323	GGCAG	2	10	1451386	1451395	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017323	TTGAA	2	10	1465922	1465931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017323	GCGCC	2	10	1481108	1481117	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_017323	CCGGC	2	10	1481802	1481811	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_017323	AGCAC	2	10	1491673	1491682	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017323	CGGCT	2	10	1510446	1510455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017323	GTCGA	2	10	1536495	1536504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017323	GCGCG	2	10	1542770	1542779	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017323	GAGCA	2	10	1550114	1550123	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017323	AGGAC	2	10	1560556	1560565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017323	AGCGG	2	10	1561297	1561306	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017323	TCCCG	2	10	1571448	1571457	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
167	NC_017323	AGTGA	2	10	1575492	1575501	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017323	GGAGG	2	10	1581041	1581050	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017323	TTGCA	2	10	1586942	1586951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017323	GGCCG	2	10	1590743	1590752	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
171	NC_017323	GACCT	2	10	1596614	1596623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017323	CGTTG	2	10	1601380	1601389	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017323	GCAGC	2	10	1614020	1614029	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_017323	TCGGC	2	10	1614130	1614139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_017323	CCCAT	2	10	1642677	1642686	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
176	NC_017323	CAGAT	2	10	1644228	1644237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_017323	GCTGC	2	10	1644444	1644453	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
178	NC_017323	CGAGG	2	10	1646849	1646858	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
179	NC_017323	GGATC	2	10	1649633	1649642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_017323	TCGCC	2	10	1649930	1649939	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
181	NC_017323	TTTTG	2	10	1653829	1653838	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017323	CTTTT	2	10	1678711	1678720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017323	CTATT	2	10	1678724	1678733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_017323	GTTTC	2	10	1682976	1682985	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_017323	TTTGA	2	10	1682997	1683006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017323	ATTTG	2	10	1686745	1686754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.