MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017322	CGCAGG	2	12	37848	37859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017322	GATGCC	2	12	59090	59101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017322	GACAGG	2	12	83885	83896	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017322	CGGAGG	2	12	86941	86952	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017322	CGGCCG	2	12	102756	102767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017322	GCAATC	2	12	103330	103341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017322	CATCGG	2	12	103584	103595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017322	ATCGGC	2	12	103627	103638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017322	TACCAA	2	12	103839	103850	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017322	CGGCAA	2	12	104844	104855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017322	GTCGGT	2	12	107043	107054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017322	CGATGC	2	12	119534	119545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017322	GCGAAG	2	12	120157	120168	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017322	TCGACG	2	12	120968	120979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017322	ATAGAG	2	12	121069	121080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017322	CAAAAA	2	12	160192	160203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017322	CGGGGA	2	12	230741	230752	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017322	AGGCGG	2	12	237375	237386	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017322	CATCGG	2	12	299637	299648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017322	CGGCTT	2	12	314785	314796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017322	GACAAG	2	12	338085	338096	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017322	AACAAA	2	12	370317	370328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017322	CTTCTG	2	12	393208	393219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017322	GAAGCG	2	12	431621	431632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017322	CGTCGG	2	12	451138	451149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017322	CCGAAC	2	12	471902	471913	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017322	GGCCGC	2	12	480890	480901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017322	GGCAGG	2	12	495273	495284	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017322	CGGAGG	2	12	582105	582116	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017322	AAATAT	2	12	592527	592538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017322	CGATAG	2	12	596873	596884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017322	TATAGG	2	12	610418	610429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017322	TCAACG	2	12	611517	611528	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017322	GGCCAT	2	12	614345	614356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017322	GTTAGA	2	12	619000	619011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017322	CTGGCT	2	12	646289	646300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017322	TCGGCA	2	12	666762	666773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017322	TGCCGC	2	12	666890	666901	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017322	GCTTGC	2	12	690147	690158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017322	TTCGGC	2	12	692836	692847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017322	GTTTAC	2	12	695901	695912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017322	CTTCCC	2	12	700337	700348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017322	GAATCG	2	12	712479	712490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017322	GCGCGT	2	12	720709	720720	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017322	GCATAG	2	12	724147	724158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017322	GTCCCG	2	12	752014	752025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017322	CTCCAG	2	12	762682	762693	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017322	TTTCCG	2	12	796933	796944	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017322	GTGCCG	2	12	807178	807189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017322	GCCTCA	2	12	810653	810664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017322	CCGGTC	2	12	823180	823191	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017322	CGGCGC	2	12	893045	893056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017322	TCGGCA	2	12	1002577	1002588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017322	TGCCGC	2	12	1002705	1002716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017322	GCGGGG	2	12	1016964	1016975	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017322	GACGCG	2	12	1027548	1027559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017322	CAGGAA	2	12	1043593	1043604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017322	TGCCGG	2	12	1095686	1095697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017322	CCGGCC	2	12	1099267	1099278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017322	CTCGGT	2	12	1119511	1119522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017322	GGGACC	2	12	1143678	1143689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017322	GCGGCC	2	12	1156456	1156467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017322	CGAATG	2	12	1163833	1163844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017322	TTTCCT	2	12	1168591	1168602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017322	AGACGG	2	12	1220427	1220438	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017322	GTCGCG	2	12	1263442	1263453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017322	CAAATT	2	12	1297845	1297856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017322	TCGGAA	2	12	1337257	1337268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017322	CGTTGA	2	12	1347004	1347015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017322	CACCCT	2	12	1376517	1376528	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017322	CCCCTG	2	12	1412692	1412703	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017322	AGGCTG	2	12	1419759	1419770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017322	GGTGCT	2	12	1419807	1419818	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017322	ACCGAA	2	12	1450978	1450989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017322	GCACCG	2	12	1480930	1480941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017322	TTCGGC	2	12	1507204	1507215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017322	TGAGAG	2	12	1518086	1518097	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017322	GGTCAT	2	12	1594602	1594613	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017322	CTGTCG	2	12	1648787	1648798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017322	CGCCAG	2	12	1735991	1736002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017322	GAGCCG	2	12	1740313	1740324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017322	GGGCTG	2	12	1761957	1761968	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017322	CCCCTG	2	12	1768583	1768594	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017322	CGGGAT	2	12	1772335	1772346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017322	CGGTGC	2	12	1779342	1779353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017322	AGACCG	2	12	1779383	1779394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017322	ATGCCG	2	12	1815155	1815166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017322	GGCGCT	2	12	1848773	1848784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017322	ACGGCG	2	12	1848904	1848915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017322	AGAAGG	2	12	1866785	1866796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017322	CGGGAT	2	12	1922521	1922532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017322	CAAGGC	2	12	1930822	1930833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017322	CCGCGT	2	12	1981328	1981339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017322	GCCTCC	2	12	1994151	1994162	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017322	CATTGG	2	12	2007797	2007808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017322	GTAACT	2	12	2028087	2028098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017322	GGGCTG	2	12	2037007	2037018	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017322	CCGGTT	2	12	2063213	2063224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017322	CGGCCG	2	12	2133112	2133123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017322	TCTGCA	2	12	2170716	2170727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017322	GAGGCC	2	12	2188618	2188629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017322	TTTGCT	2	12	2209937	2209948	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017322	TGATTC	2	12	2242909	2242920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017322	GGACGA	2	12	2251429	2251440	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017322	GCGATG	2	12	2280344	2280355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017322	AAGAGG	2	12	2282010	2282021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017322	CCTACA	2	12	2283615	2283626	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017322	ATCTCC	2	12	2290723	2290734	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017322	AAATGA	2	12	2384995	2385006	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017322	GCGCTC	2	12	2392940	2392951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017322	ACGATC	2	12	2393225	2393236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017322	GCGGCC	2	12	2421847	2421858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017322	TCGAGG	2	12	2425344	2425355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017322	TCGCCC	2	12	2434923	2434934	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017322	CACGGT	2	12	2480754	2480765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017322	GGCTGC	2	12	2512155	2512166	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017322	CCGGAT	2	12	2517352	2517363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017322	GAGAAA	2	12	2520491	2520502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017322	TTTCTC	2	12	2522370	2522381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017322	GAATAA	2	12	2533133	2533144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017322	GACCGA	2	12	2535479	2535490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017322	ACGTAA	2	12	2561213	2561224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017322	AGCGGC	2	12	2605842	2605853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017322	AGAGCG	2	12	2627964	2627975	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017322	GTCTAG	2	12	2649909	2649920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017322	TCATGT	2	12	2742540	2742551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017322	ACATGA	2	12	2742575	2742586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017322	GAAGCG	2	12	2759472	2759483	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017322	GCGTTC	2	12	2764772	2764783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017322	ATTCCC	2	12	2814310	2814321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017322	GATTGA	2	12	2837669	2837680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017322	GAAAAG	2	12	2839716	2839727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017322	CAAGCG	2	12	2889039	2889050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017322	TATGTG	2	12	2915877	2915888	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017322	CCGGAT	2	12	2917182	2917193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017322	GAGAAA	2	12	2920321	2920332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017322	TTTCTC	2	12	2922201	2922212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017322	CCGAGT	2	12	2945084	2945095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017322	ACGTAA	2	12	3024923	3024934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017322	CATGTT	2	12	3082338	3082349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017322	CAGCCC	2	12	3134991	3135002	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017322	GGGGCC	2	12	3165634	3165645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017322	GAATCG	2	12	3166480	3166491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017322	GCATAT	2	12	3177909	3177920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017322	CCTCTC	2	12	3193485	3193496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017322	CTCGGT	2	12	3241050	3241061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017322	AGTGTC	2	12	3279088	3279099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017322	TCCCGC	2	12	3325565	3325576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017322	ACCGAG	2	12	3330790	3330801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017322	CGTTTC	2	12	3349324	3349335	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017322	AGAGAA	2	12	3356085	3356096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017322	TTTCTC	2	12	3357966	3357977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017322	ATCCGG	2	12	3361102	3361113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017322	CAAAAG	2	12	3392194	3392205	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_017322	TATTTT	2	12	3404265	3404276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017322	TTCGTC	2	12	3422570	3422581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017322	GATGCC	2	12	3422938	3422949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017322	GCGCGA	2	12	3433781	3433792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017322	AGCCGC	2	12	3450312	3450323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
160	NC_017322	CAGCGG	2	12	3482286	3482297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017322	CGCGCT	2	12	3524433	3524444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_017322	CTGCCC	2	12	3525543	3525554	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_017322	ATGGTG	2	12	3595586	3595597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017322	TCGACT	2	12	3622545	3622556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017322	CGGGAA	2	12	3639812	3639823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_017322	GGATAT	2	12	3646602	3646613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.