MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 2793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017322	CCGCG	2	10	1331	1340	0 %	0 %	40 %	60 %	384528108
2	NC_017322	CACGG	2	10	4068	4077	20 %	0 %	40 %	40 %	384528112
3	NC_017322	GCAGC	2	10	4900	4909	20 %	0 %	40 %	40 %	384528113
4	NC_017322	AGGCA	2	10	6275	6284	40 %	0 %	40 %	20 %	384528114
5	NC_017322	TTCCG	2	10	6687	6696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017322	CGACC	2	10	7339	7348	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017322	CGACC	2	10	10396	10405	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017322	GTCGT	2	10	10561	10570	0 %	40 %	40 %	20 %	384528119
9	NC_017322	GGGCA	2	10	12620	12629	20 %	0 %	60 %	20 %	384528121
10	NC_017322	GGTCG	2	10	14010	14019	0 %	20 %	60 %	20 %	384528122
11	NC_017322	CGATC	2	10	14823	14832	20 %	20 %	20 %	40 %	384528123
12	NC_017322	GCCGC	2	10	15760	15769	0 %	0 %	40 %	60 %	384528124
13	NC_017322	ATTCC	2	10	15990	15999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017322	GATCG	2	10	16575	16584	20 %	20 %	40 %	20 %	384528125
15	NC_017322	CGAGC	2	10	18202	18211	20 %	0 %	40 %	40 %	384528128
16	NC_017322	CACGG	2	10	19912	19921	20 %	0 %	40 %	40 %	384528130
17	NC_017322	GCACG	2	10	19922	19931	20 %	0 %	40 %	40 %	384528130
18	NC_017322	GGCGC	2	10	20718	20727	0 %	0 %	60 %	40 %	384528130
19	NC_017322	GGCAT	2	10	21921	21930	20 %	20 %	40 %	20 %	384528132
20	NC_017322	ACGCG	2	10	23389	23398	20 %	0 %	40 %	40 %	384528132
21	NC_017322	CCGCC	2	10	23595	23604	0 %	0 %	20 %	80 %	384528132
22	NC_017322	CCGGG	2	10	23870	23879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017322	CGATG	2	10	24493	24502	20 %	20 %	40 %	20 %	384528133
24	NC_017322	CGCGC	2	10	26124	26133	0 %	0 %	40 %	60 %	384528134
25	NC_017322	CGAAG	2	10	27882	27891	40 %	0 %	40 %	20 %	384528135
26	NC_017322	TCGAT	2	10	28592	28601	20 %	40 %	20 %	20 %	384528135
27	NC_017322	GCCCG	2	10	35235	35244	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017322	TGACC	2	10	36910	36919	20 %	20 %	20 %	40 %	384528140
29	NC_017322	CGGCT	2	10	37203	37212	0 %	20 %	40 %	40 %	384528141
30	NC_017322	CGGCG	2	10	38382	38391	0 %	0 %	60 %	40 %	384528142
31	NC_017322	CGGAC	2	10	38487	38496	20 %	0 %	40 %	40 %	384528142
32	NC_017322	GGCCG	2	10	41502	41511	0 %	0 %	60 %	40 %	384528145
33	NC_017322	CGCGT	2	10	44170	44179	0 %	20 %	40 %	40 %	384528148
34	NC_017322	CGCAG	2	10	46141	46150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017322	CCGGG	2	10	46456	46465	0 %	0 %	60 %	40 %	384528150
36	NC_017322	GCACG	2	10	47978	47987	20 %	0 %	40 %	40 %	384528151
37	NC_017322	GCTCG	2	10	48372	48381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017322	CGCGG	2	10	54041	54050	0 %	0 %	60 %	40 %	384528157
39	NC_017322	CGGCG	2	10	54712	54721	0 %	0 %	60 %	40 %	384528157
40	NC_017322	GGCGC	2	10	58229	58238	0 %	0 %	60 %	40 %	384528161
41	NC_017322	GATCA	2	10	59114	59123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017322	GCCCA	2	10	60347	60356	20 %	0 %	20 %	60 %	384528162
43	NC_017322	AGGTC	2	10	62446	62455	20 %	20 %	40 %	20 %	384528164
44	NC_017322	GCGCC	2	10	66537	66546	0 %	0 %	40 %	60 %	384528166
45	NC_017322	AGGAG	2	10	71622	71631	40 %	0 %	60 %	0 %	384528171
46	NC_017322	CCGCG	2	10	71745	71754	0 %	0 %	40 %	60 %	384528171
47	NC_017322	GAAAC	2	10	72120	72129	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017322	TCGCC	2	10	73486	73495	0 %	20 %	20 %	60 %	384528173
49	NC_017322	TCCGC	2	10	73960	73969	0 %	20 %	20 %	60 %	384528174
50	NC_017322	TCATC	2	10	75513	75522	20 %	40 %	0 %	40 %	384528175
51	NC_017322	TGCCA	2	10	75845	75854	20 %	20 %	20 %	40 %	384528175
52	NC_017322	CCGTC	2	10	77336	77345	0 %	20 %	20 %	60 %	384528177
53	NC_017322	AGGGC	2	10	77847	77856	20 %	0 %	60 %	20 %	384528177
54	NC_017322	GCCGC	3	15	78383	78397	0 %	0 %	40 %	60 %	384528178
55	NC_017322	GCGCA	2	10	78484	78493	20 %	0 %	40 %	40 %	384528178
56	NC_017322	TCGAA	2	10	80086	80095	40 %	20 %	20 %	20 %	384528180
57	NC_017322	AAAAG	2	10	81105	81114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017322	GGGTC	2	10	81456	81465	0 %	20 %	60 %	20 %	384528182
59	NC_017322	ATCCG	2	10	82612	82621	20 %	20 %	20 %	40 %	384528182
60	NC_017322	CAGCG	2	10	85203	85212	20 %	0 %	40 %	40 %	384528185
61	NC_017322	CGACG	2	10	86062	86071	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017322	CTTTC	2	10	86658	86667	0 %	60 %	0 %	40 %	384528186
63	NC_017322	CCGAG	2	10	91019	91028	20 %	0 %	40 %	40 %	384528189
64	NC_017322	CGGCG	2	10	91793	91802	0 %	0 %	60 %	40 %	384528190
65	NC_017322	GGCTC	2	10	92342	92351	0 %	20 %	40 %	40 %	384528191
66	NC_017322	AAACA	2	10	94309	94318	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017322	GTCGA	2	10	94378	94387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017322	ACAAG	2	10	96070	96079	60 %	0 %	20 %	20 %	384528193
69	NC_017322	CCGCA	2	10	97337	97346	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017322	GGTCC	2	10	98418	98427	0 %	20 %	40 %	40 %	384528194
71	NC_017322	CGGAG	2	10	98874	98883	20 %	0 %	60 %	20 %	384528194
72	NC_017322	GGCCG	2	10	101865	101874	0 %	0 %	60 %	40 %	384528194
73	NC_017322	GGAAA	2	10	102179	102188	60 %	0 %	40 %	0 %	384528194
74	NC_017322	CGGGG	3	15	102795	102809	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017322	CGGGC	2	10	105210	105219	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017322	ACGGT	2	10	106231	106240	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017322	CGAGG	2	10	108603	108612	20 %	0 %	60 %	20 %	384528197
78	NC_017322	GGCCG	2	10	109025	109034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017322	TCGTC	2	10	113348	113357	0 %	40 %	20 %	40 %	384528203
80	NC_017322	TGATG	2	10	113625	113634	20 %	40 %	40 %	0 %	384528203
81	NC_017322	GCACA	2	10	113739	113748	40 %	0 %	20 %	40 %	384528203
82	NC_017322	GATGC	2	10	114783	114792	20 %	20 %	40 %	20 %	384528203
83	NC_017322	CGAGC	2	10	118856	118865	20 %	0 %	40 %	40 %	384528207
84	NC_017322	AGAGG	2	10	119178	119187	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017322	CGGCC	2	10	120883	120892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_017322	TCGCG	2	10	123235	123244	0 %	20 %	40 %	40 %	384528211
87	NC_017322	GTCGA	2	10	125641	125650	20 %	20 %	40 %	20 %	384528212
88	NC_017322	GAAGG	2	10	125710	125719	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017322	GGGCG	2	10	125790	125799	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017322	TGGGG	2	10	126377	126386	0 %	20 %	80 %	0 %	384528213
91	NC_017322	ACCGC	2	10	126646	126655	20 %	0 %	20 %	60 %	384528213
92	NC_017322	ATCGA	2	10	126837	126846	40 %	20 %	20 %	20 %	384528213
93	NC_017322	GAGGC	2	10	127280	127289	20 %	0 %	60 %	20 %	384528214
94	NC_017322	CCGGT	2	10	129623	129632	0 %	20 %	40 %	40 %	384528216
95	NC_017322	CGCGG	2	10	131108	131117	0 %	0 %	60 %	40 %	384528218
96	NC_017322	CGGTG	2	10	131784	131793	0 %	20 %	60 %	20 %	384528219
97	NC_017322	ACTGC	2	10	135385	135394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017322	AGCGG	2	10	136858	136867	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017322	AGACA	2	10	137869	137878	60 %	0 %	20 %	20 %	384528222
100	NC_017322	GAAGC	2	10	141718	141727	40 %	0 %	40 %	20 %	384528227
101	NC_017322	TGCCG	2	10	141861	141870	0 %	20 %	40 %	40 %	384528227
102	NC_017322	GATCG	2	10	143112	143121	20 %	20 %	40 %	20 %	384528228
103	NC_017322	GCGTC	2	10	144872	144881	0 %	20 %	40 %	40 %	384528229
104	NC_017322	TCATG	2	10	145227	145236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017322	TCGCG	2	10	145860	145869	0 %	20 %	40 %	40 %	384528230
106	NC_017322	CGCTT	2	10	147296	147305	0 %	40 %	20 %	40 %	384528231
107	NC_017322	GCACG	2	10	147344	147353	20 %	0 %	40 %	40 %	384528231
108	NC_017322	GAAGA	2	10	147366	147375	60 %	0 %	40 %	0 %	384528231
109	NC_017322	GGTCA	2	10	148231	148240	20 %	20 %	40 %	20 %	384528232
110	NC_017322	ATGCG	2	10	148394	148403	20 %	20 %	40 %	20 %	384528232
111	NC_017322	GCTCG	2	10	148524	148533	0 %	20 %	40 %	40 %	384528232
112	NC_017322	TCCGC	2	10	150400	150409	0 %	20 %	20 %	60 %	384528233
113	NC_017322	CTGCG	2	10	152885	152894	0 %	20 %	40 %	40 %	384528236
114	NC_017322	GCGCG	2	10	153145	153154	0 %	0 %	60 %	40 %	384528236
115	NC_017322	CGGCG	2	10	154525	154534	0 %	0 %	60 %	40 %	384528238
116	NC_017322	AATGG	2	10	156576	156585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017322	CCGGA	2	10	157373	157382	20 %	0 %	40 %	40 %	384528240
118	NC_017322	GGCCG	2	10	159455	159464	0 %	0 %	60 %	40 %	384528243
119	NC_017322	GAGCG	2	10	160122	160131	20 %	0 %	60 %	20 %	384528243
120	NC_017322	GCCCG	2	10	160536	160545	0 %	0 %	40 %	60 %	384528244
121	NC_017322	CGTCT	2	10	161359	161368	0 %	40 %	20 %	40 %	384528244
122	NC_017322	CGGCG	2	10	163918	163927	0 %	0 %	60 %	40 %	384528247
123	NC_017322	TTCGC	2	10	164240	164249	0 %	40 %	20 %	40 %	384528247
124	NC_017322	CCGGA	2	10	164303	164312	20 %	0 %	40 %	40 %	384528247
125	NC_017322	GGAGC	2	10	167340	167349	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017322	CTGGC	2	10	167997	168006	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017322	GGATC	2	10	170237	170246	20 %	20 %	40 %	20 %	384528253
128	NC_017322	TCGAC	2	10	171093	171102	20 %	20 %	20 %	40 %	384528253
129	NC_017322	GCCGC	2	10	173384	173393	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017322	GCGAA	2	10	173497	173506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017322	ATCGG	2	10	173589	173598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017322	AAGCG	2	10	173975	173984	40 %	0 %	40 %	20 %	384528255
133	NC_017322	ACCGC	2	10	175410	175419	20 %	0 %	20 %	60 %	384528255
134	NC_017322	CGCAG	2	10	178790	178799	20 %	0 %	40 %	40 %	384528257
135	NC_017322	CGGCG	2	10	181707	181716	0 %	0 %	60 %	40 %	384528260
136	NC_017322	ATCGG	2	10	182873	182882	20 %	20 %	40 %	20 %	384528260
137	NC_017322	CGGCG	2	10	186285	186294	0 %	0 %	60 %	40 %	384528264
138	NC_017322	CGACG	2	10	186887	186896	20 %	0 %	40 %	40 %	384528266
139	NC_017322	AGCTG	2	10	187251	187260	20 %	20 %	40 %	20 %	384528266
140	NC_017322	CCGGC	2	10	187760	187769	0 %	0 %	40 %	60 %	384528267
141	NC_017322	CCGGC	2	10	188748	188757	0 %	0 %	40 %	60 %	384528268
142	NC_017322	AGCCG	2	10	189392	189401	20 %	0 %	40 %	40 %	384528268
143	NC_017322	CGTCG	2	10	189884	189893	0 %	20 %	40 %	40 %	384528269
144	NC_017322	GCCGC	2	10	192628	192637	0 %	0 %	40 %	60 %	384528272
145	NC_017322	GGCAT	2	10	192867	192876	20 %	20 %	40 %	20 %	384528272
146	NC_017322	CCGTT	2	10	196288	196297	0 %	40 %	20 %	40 %	384528274
147	NC_017322	AAGCG	2	10	196753	196762	40 %	0 %	40 %	20 %	384528274
148	NC_017322	ACCGG	2	10	196897	196906	20 %	0 %	40 %	40 %	384528274
149	NC_017322	TGGTC	2	10	197263	197272	0 %	40 %	40 %	20 %	384528275
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151	NC_017322	CGGCG	2	10	198927	198936	0 %	0 %	60 %	40 %	384528278
152	NC_017322	CCGGC	2	10	200931	200940	0 %	0 %	40 %	60 %	384528279
153	NC_017322	GATCG	2	10	201968	201977	20 %	20 %	40 %	20 %	384528280
154	NC_017322	GGTTC	2	10	202090	202099	0 %	40 %	40 %	20 %	384528280
155	NC_017322	GGCAT	2	10	202554	202563	20 %	20 %	40 %	20 %	384528280
156	NC_017322	CGCGC	2	10	202920	202929	0 %	0 %	40 %	60 %	384528281
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158	NC_017322	GAGCC	2	10	203239	203248	20 %	0 %	40 %	40 %	384528281
159	NC_017322	CGATG	2	10	203330	203339	20 %	20 %	40 %	20 %	384528281
160	NC_017322	GCCGC	2	10	203429	203438	0 %	0 %	40 %	60 %	384528282
161	NC_017322	AGGTG	2	10	204901	204910	20 %	20 %	60 %	0 %	384528283
162	NC_017322	ACGGC	2	10	206085	206094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_017322	CGCGC	2	10	210065	210074	0 %	0 %	40 %	60 %	384528288
170	NC_017322	CGGGG	2	10	210403	210412	0 %	0 %	80 %	20 %	384528289
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172	NC_017322	GAATT	2	10	213259	213268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017322	TCGAT	2	10	214135	214144	20 %	40 %	20 %	20 %	384528291
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176	NC_017322	TCTCC	2	10	219027	219036	0 %	40 %	0 %	60 %	384528295
177	NC_017322	TGCCG	2	10	219858	219867	0 %	20 %	40 %	40 %	384528296
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179	NC_017322	TCGCT	2	10	224171	224180	0 %	40 %	20 %	40 %	384528297
180	NC_017322	GATCG	2	10	225696	225705	20 %	20 %	40 %	20 %	384528297
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183	NC_017322	TCGCG	2	10	229914	229923	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017322	CGATC	2	10	230900	230909	20 %	20 %	20 %	40 %	384528300
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195	NC_017322	TCGAG	2	10	252788	252797	20 %	20 %	40 %	20 %	384528331
196	NC_017322	ACGGA	2	10	254030	254039	40 %	0 %	40 %	20 %	384528332
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234	NC_017322	ATCGC	2	10	307003	307012	20 %	20 %	20 %	40 %	384528385
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244	NC_017322	TTTGG	2	10	327992	328001	0 %	60 %	40 %	0 %	384528407
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246	NC_017322	CGCGA	2	10	331934	331943	20 %	0 %	40 %	40 %	384528409
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248	NC_017322	GAGCC	2	10	334555	334564	20 %	0 %	40 %	40 %	384528411
249	NC_017322	GATCG	2	10	335779	335788	20 %	20 %	40 %	20 %	384528412
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260	NC_017322	GGCAT	2	10	351861	351870	20 %	20 %	40 %	20 %	384528425
261	NC_017322	TCCGC	2	10	351918	351927	0 %	20 %	20 %	60 %	384528425
262	NC_017322	TCCGG	2	10	354259	354268	0 %	20 %	40 %	40 %	384528426
263	NC_017322	GCGCC	2	10	355659	355668	0 %	0 %	40 %	60 %	384528427
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266	NC_017322	CCGTC	2	10	357592	357601	0 %	20 %	20 %	60 %	384528428
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268	NC_017322	GCGAA	2	10	359748	359757	40 %	0 %	40 %	20 %	384528428
269	NC_017322	TGCAC	2	10	360085	360094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_017322	CGACC	2	10	360228	360237	20 %	0 %	20 %	60 %	384528429
271	NC_017322	CAAAG	2	10	360659	360668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_017322	GACGA	2	10	363595	363604	40 %	0 %	40 %	20 %	384528432
273	NC_017322	GCCCA	2	10	364330	364339	20 %	0 %	20 %	60 %	384528433
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282	NC_017322	CTGCG	2	10	369450	369459	0 %	20 %	40 %	40 %	384528437
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284	NC_017322	ATTGC	2	10	370238	370247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_017322	CGGCT	2	10	378939	378948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
293	NC_017322	CGCGC	2	10	379834	379843	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
294	NC_017322	GCTCA	2	10	381179	381188	20 %	20 %	20 %	40 %	384528451
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303	NC_017322	CCGCT	2	10	393279	393288	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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382	NC_017322	CGCGG	2	10	515673	515682	0 %	0 %	60 %	40 %	384528578
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384	NC_017322	GCGAG	2	10	515953	515962	20 %	0 %	60 %	20 %	384528578
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386	NC_017322	GCCGG	2	10	517601	517610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
387	NC_017322	TTGCG	2	10	517860	517869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
388	NC_017322	CGGGC	2	10	519985	519994	0 %	0 %	60 %	40 %	384528581
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392	NC_017322	ATCGC	2	10	530072	530081	20 %	20 %	20 %	40 %	384528589
393	NC_017322	CGAGC	2	10	532979	532988	20 %	0 %	40 %	40 %	384528591
394	NC_017322	CGCCC	2	10	533916	533925	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
395	NC_017322	TTCCG	2	10	536253	536262	0 %	40 %	20 %	40 %	384528595
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397	NC_017322	GCCGC	2	10	541351	541360	0 %	0 %	40 %	60 %	384528601
398	NC_017322	AGCGG	2	10	543230	543239	20 %	0 %	60 %	20 %	384528602
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401	NC_017322	GTTTC	2	10	546061	546070	0 %	60 %	20 %	20 %	384528604
402	NC_017322	GATCG	2	10	546134	546143	20 %	20 %	40 %	20 %	384528604
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497	NC_017322	CGGCG	2	10	676922	676931	0 %	0 %	60 %	40 %	384528732
498	NC_017322	CCTCG	2	10	677572	677581	0 %	20 %	20 %	60 %	384528733
499	NC_017322	AAAGG	2	10	677706	677715	60 %	0 %	40 %	0 %	384528733
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