MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_4

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017321	CGC	2	6	83	88	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017321	CAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017321	TGA	3	9	590	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545955
4	NC_017321	GCG	2	6	650	655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017321	CCG	2	6	708	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017321	GCC	2	6	729	734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017321	GGT	2	6	806	811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017321	GAT	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545956
9	NC_017321	CTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545956
10	NC_017321	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545956
11	NC_017321	GAA	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545956
12	NC_017321	GCC	2	6	1077	1082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545956
13	NC_017321	GGC	2	6	1184	1189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545956
14	NC_017321	TAC	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545956
15	NC_017321	CCG	2	6	1341	1346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545956
16	NC_017321	CGG	2	6	1536	1541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545956
17	NC_017321	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545956
18	NC_017321	CGA	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545956
19	NC_017321	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545956
20	NC_017321	GAT	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545956
21	NC_017321	GCA	2	6	1795	1800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545956
22	NC_017321	ATG	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545956
23	NC_017321	GAT	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545956
24	NC_017321	GAA	2	6	1925	1930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545956
25	NC_017321	AGC	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545956
26	NC_017321	CAG	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545956
27	NC_017321	TGC	2	6	2280	2285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545956
28	NC_017321	TGT	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017321	TCT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017321	GGT	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017321	TTG	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017321	CTG	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017321	AGT	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545957
34	NC_017321	TGT	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545957
35	NC_017321	CTT	2	6	3138	3143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545957
36	NC_017321	TTA	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545957
37	NC_017321	TAT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545957
38	NC_017321	TAA	2	6	3223	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545957
39	NC_017321	GTT	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545957
40	NC_017321	CAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017321	TCT	2	6	3424	3429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545958
42	NC_017321	GCG	2	6	3444	3449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545958
43	NC_017321	CTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545958
44	NC_017321	GGT	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545958
45	NC_017321	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545958
46	NC_017321	TGG	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545958
47	NC_017321	CCA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017321	GCT	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017321	CTT	2	6	4025	4030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.