MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017319	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017319	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017319	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	384545967
5	NC_017319	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	384545968
6	NC_017319	GTAG	2	8	968	975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017319	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	384545969
8	NC_017319	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	384545969
9	NC_017319	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	384545969
10	NC_017319	AATT	2	8	2345	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017319	AAAT	2	8	2362	2369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017319	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	384545970
13	NC_017319	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	384545970
14	NC_017319	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	384545970
15	NC_017319	TAAG	2	8	3656	3663	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
16	NC_017319	TAAA	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	384545971
17	NC_017319	TTTA	2	8	4308	4315	25 %	75 %	0 %	0 %	384545971
18	NC_017319	GTAT	2	8	4398	4405	25 %	50 %	25 %	0 %	384545971
19	NC_017319	AAGT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
20	NC_017319	GATA	2	8	5157	5164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017319	CCGG	2	8	5548	5555	0 %	0 %	50 %	50 %	384545973
22	NC_017319	CGAC	2	8	5980	5987	25 %	0 %	25 %	50 %	384545974
23	NC_017319	TCTG	2	8	6857	6864	0 %	50 %	25 %	25 %	384545975
24	NC_017319	CAGC	2	8	7080	7087	25 %	0 %	25 %	50 %	384545976
25	NC_017319	AGGA	2	8	7294	7301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017319	TATT	2	8	7455	7462	25 %	75 %	0 %	0 %	384545977
27	NC_017319	TGTT	2	8	8415	8422	0 %	75 %	25 %	0 %	384545977
28	NC_017319	AAAT	2	8	8759	8766	75 %	25 %	0 %	0 %	384545977
29	NC_017319	ACAT	2	8	8806	8813	50 %	25 %	0 %	25 %	384545977
30	NC_017319	TTTA	2	8	9130	9137	25 %	75 %	0 %	0 %	384545977
31	NC_017319	CATG	2	8	10033	10040	25 %	25 %	25 %	25 %	384545978
32	NC_017319	ATTG	2	8	10333	10340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017319	CCTG	2	8	10772	10779	0 %	25 %	25 %	50 %	384545980
34	NC_017319	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	384545981
35	NC_017319	TCTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	0 %	25 %	384545981
36	NC_017319	CATT	2	8	12051	12058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017319	TCCT	2	8	12251	12258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017319	TTTG	2	8	12516	12523	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017319	ATTG	2	8	12672	12679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017319	CCAG	2	8	13170	13177	25 %	0 %	25 %	50 %	384545983
41	NC_017319	CTGT	2	8	13675	13682	0 %	50 %	25 %	25 %	384545985
42	NC_017319	TACT	2	8	13795	13802	25 %	50 %	0 %	25 %	384545985
43	NC_017319	CAGT	2	8	13863	13870	25 %	25 %	25 %	25 %	384545986
44	NC_017319	ACTG	2	8	13877	13884	25 %	25 %	25 %	25 %	384545986
45	NC_017319	CGTC	2	8	14316	14323	0 %	25 %	25 %	50 %	384545986
46	NC_017319	GCCG	2	8	15573	15580	0 %	0 %	50 %	50 %	384545987
47	NC_017319	CTGG	2	8	15689	15696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017319	TCCG	2	8	16397	16404	0 %	25 %	25 %	50 %	384545989
49	NC_017319	ATCC	2	8	16942	16949	25 %	25 %	0 %	50 %	384545989
50	NC_017319	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	384545989
51	NC_017319	ATTC	2	8	17257	17264	25 %	50 %	0 %	25 %	384545989
52	NC_017319	TTGA	2	8	17570	17577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017319	CAAC	2	8	17748	17755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017319	ACTA	2	8	17868	17875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017319	ATGA	2	8	18008	18015	50 %	25 %	25 %	0 %	384545991
56	NC_017319	TCAG	2	8	18090	18097	25 %	25 %	25 %	25 %	384545991
57	NC_017319	AATA	2	8	18902	18909	75 %	25 %	0 %	0 %	384545993
58	NC_017319	TTTC	2	8	19072	19079	0 %	75 %	0 %	25 %	384545993
59	NC_017319	CAGA	2	8	19504	19511	50 %	0 %	25 %	25 %	384545993
60	NC_017319	AAAC	2	8	19653	19660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017319	ACGA	2	8	19707	19714	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017319	ATGA	2	8	20468	20475	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017319	AAAT	2	8	20806	20813	75 %	25 %	0 %	0 %	384545995
64	NC_017319	AAGT	2	8	21328	21335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017319	GCCT	2	8	21794	21801	0 %	25 %	25 %	50 %	384545996
66	NC_017319	GGCT	2	8	21892	21899	0 %	25 %	50 %	25 %	384545996
67	NC_017319	TCGC	2	8	23357	23364	0 %	25 %	25 %	50 %	384545998
68	NC_017319	CATT	2	8	23411	23418	25 %	50 %	0 %	25 %	384545998
69	NC_017319	CTTT	2	8	24351	24358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017319	GGGA	2	8	24703	24710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017319	CATC	2	8	24928	24935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017319	GCTG	2	8	25234	25241	0 %	25 %	50 %	25 %	384545999
73	NC_017319	CTCA	2	8	25729	25736	25 %	25 %	0 %	50 %	384546000
74	NC_017319	TCAG	2	8	25980	25987	25 %	25 %	25 %	25 %	384546000
75	NC_017319	CAGA	2	8	26179	26186	50 %	0 %	25 %	25 %	384546000
76	NC_017319	CCGT	2	8	26675	26682	0 %	25 %	25 %	50 %	384546002
77	NC_017319	ATTC	2	8	26818	26825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017319	TGCA	2	8	26885	26892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017319	TAAG	2	8	26973	26980	50 %	25 %	25 %	0 %	384546003
80	NC_017319	GGAT	2	8	27853	27860	25 %	25 %	50 %	0 %	384546003
81	NC_017319	ACCG	2	8	28169	28176	25 %	0 %	25 %	50 %	384546004
82	NC_017319	ACAG	2	8	28350	28357	50 %	0 %	25 %	25 %	384546004
83	NC_017319	ACGT	2	8	29031	29038	25 %	25 %	25 %	25 %	384546004
84	NC_017319	CTGG	2	8	29508	29515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017319	GGTT	2	8	29768	29775	0 %	50 %	50 %	0 %	384546006
86	NC_017319	TCCT	2	8	30215	30222	0 %	50 %	0 %	50 %	384546008
87	NC_017319	GCAT	2	8	30486	30493	25 %	25 %	25 %	25 %	384546008
88	NC_017319	TCCA	2	8	30755	30762	25 %	25 %	0 %	50 %	384546008
89	NC_017319	TCCA	2	8	30881	30888	25 %	25 %	0 %	50 %	384546008
90	NC_017319	AATG	2	8	31433	31440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017319	CAGT	2	8	31596	31603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017319	CCAC	2	8	32189	32196	25 %	0 %	0 %	75 %	384546012
93	NC_017319	ATAC	2	8	32369	32376	50 %	25 %	0 %	25 %	384546012
94	NC_017319	GTAA	2	8	32556	32563	50 %	25 %	25 %	0 %	384546012
95	NC_017319	CCAC	2	8	32570	32577	25 %	0 %	0 %	75 %	384546012
96	NC_017319	TCTT	2	8	32808	32815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017319	CCCG	2	8	33977	33984	0 %	0 %	25 %	75 %	384546016
98	NC_017319	TCCT	2	8	34021	34028	0 %	50 %	0 %	50 %	384546016
99	NC_017319	GCGG	2	8	34033	34040	0 %	0 %	75 %	25 %	384546016
100	NC_017319	TGCC	2	8	34176	34183	0 %	25 %	25 %	50 %	384546016
101	NC_017319	CGGC	2	8	34682	34689	0 %	0 %	50 %	50 %	384546016
102	NC_017319	GGAT	2	8	34963	34970	25 %	25 %	50 %	0 %	384546017
103	NC_017319	AGCA	2	8	35808	35815	50 %	0 %	25 %	25 %	384546019
104	NC_017319	CTCA	2	8	36348	36355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017319	TCTT	2	8	36844	36851	0 %	75 %	0 %	25 %	384546020
106	NC_017319	AGAT	2	8	37330	37337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017319	TTTA	2	8	37362	37369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017319	CAGT	2	8	37859	37866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017319	GAAG	2	8	37911	37918	50 %	0 %	50 %	0 %	384546021
110	NC_017319	TCCT	2	8	38725	38732	0 %	50 %	0 %	50 %	384546023
111	NC_017319	GCTG	2	8	39065	39072	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
112	NC_017319	TGGC	2	8	39198	39205	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
113	NC_017319	ATAC	2	8	39420	39427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017319	GCGT	2	8	40475	40482	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
115	NC_017319	GCTG	2	8	40654	40661	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
116	NC_017319	GTTT	2	8	40718	40725	0 %	75 %	25 %	0 %	384546025
117	NC_017319	CTGG	2	8	41040	41047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017319	ATCT	2	8	41421	41428	25 %	50 %	0 %	25 %	384546026
119	NC_017319	ACAA	2	8	42078	42085	75 %	0 %	0 %	25 %	384546026
120	NC_017319	GAAT	2	8	42625	42632	50 %	25 %	25 %	0 %	384546026
121	NC_017319	GCAG	2	8	42703	42710	25 %	0 %	50 %	25 %	384546026
122	NC_017319	TGAC	2	8	42861	42868	25 %	25 %	25 %	25 %	384546026
123	NC_017319	TTAC	2	8	43663	43670	25 %	50 %	0 %	25 %	384546028
124	NC_017319	GTAT	2	8	43850	43857	25 %	50 %	25 %	0 %	384546028
125	NC_017319	GTGG	2	8	44030	44037	0 %	25 %	75 %	0 %	384546028
126	NC_017319	TCTG	2	8	44303	44310	0 %	50 %	25 %	25 %	384546028
127	NC_017319	AGGA	2	8	44740	44747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017319	ACTG	2	8	44811	44818	25 %	25 %	25 %	25 %	384546030
129	NC_017319	AACG	2	8	45116	45123	50 %	0 %	25 %	25 %	384546030
130	NC_017319	ATTT	2	8	45248	45255	25 %	75 %	0 %	0 %	384546030
131	NC_017319	CGTT	2	8	45341	45348	0 %	50 %	25 %	25 %	384546031
132	NC_017319	CAAC	2	8	46129	46136	50 %	0 %	0 %	50 %	384546034
133	NC_017319	TCCT	2	8	46149	46156	0 %	50 %	0 %	50 %	384546034
134	NC_017319	GCGG	2	8	46161	46168	0 %	0 %	75 %	25 %	384546034
135	NC_017319	TGCC	2	8	46304	46311	0 %	25 %	25 %	50 %	384546034
136	NC_017319	CGGC	2	8	46810	46817	0 %	0 %	50 %	50 %	384546034
137	NC_017319	GGAT	2	8	47092	47099	25 %	25 %	50 %	0 %	384546034
138	NC_017319	TAAA	2	8	48022	48029	75 %	25 %	0 %	0 %	384546036
139	NC_017319	TTTA	2	8	48577	48584	25 %	75 %	0 %	0 %	384546036
140	NC_017319	ATTT	2	8	49117	49124	25 %	75 %	0 %	0 %	384546036
141	NC_017319	TGTA	2	8	49260	49267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017319	GATA	2	8	49423	49430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017319	TCCT	2	8	49606	49613	0 %	50 %	0 %	50 %	384546037
144	NC_017319	GCTG	2	8	49946	49953	0 %	25 %	50 %	25 %	384546038
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