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Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 2252

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545967
2	NC_017319	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545967
3	NC_017319	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545968
4	NC_017319	TTG	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545968
5	NC_017319	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545968
6	NC_017319	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545968
7	NC_017319	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
8	NC_017319	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545969
9	NC_017319	AGC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545969
10	NC_017319	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545969
11	NC_017319	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545969
12	NC_017319	TAA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
13	NC_017319	ATG	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545969
14	NC_017319	TGC	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
15	NC_017319	TAA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
16	NC_017319	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545969
17	NC_017319	CTG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
18	NC_017319	CTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545969
19	NC_017319	AAG	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545969
20	NC_017319	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545969
21	NC_017319	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545969
22	NC_017319	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545970
23	NC_017319	CAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545970
24	NC_017319	CCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545970
25	NC_017319	AGT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545970
26	NC_017319	TAC	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545970
27	NC_017319	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545970
28	NC_017319	TAC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545970
29	NC_017319	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545970
30	NC_017319	ATA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545970
31	NC_017319	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545970
32	NC_017319	ATT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545971
33	NC_017319	CAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545971
34	NC_017319	TGA	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
35	NC_017319	TCC	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384545971
36	NC_017319	ATG	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
37	NC_017319	TGA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
38	NC_017319	AAT	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545971
39	NC_017319	TAA	3	9	4514	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545971
40	NC_017319	GAA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545971
41	NC_017319	TAT	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545971
42	NC_017319	ATG	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545971
43	NC_017319	GCT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545971
44	NC_017319	TTG	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545972
45	NC_017319	CAA	2	6	4861	4866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545972
46	NC_017319	ATT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545972
47	NC_017319	TAG	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545973
48	NC_017319	AAC	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545973
49	NC_017319	GTT	2	6	5440	5445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545973
50	NC_017319	GCT	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545973
51	NC_017319	GCT	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545973
52	NC_017319	CAC	3	9	5518	5526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545973
53	NC_017319	TCC	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384545973
54	NC_017319	CAG	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545974
55	NC_017319	GCC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545974
56	NC_017319	AGC	2	6	6110	6115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
57	NC_017319	TGA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545975
58	NC_017319	GAC	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
59	NC_017319	TTA	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545975
60	NC_017319	GTG	2	6	6404	6409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545975
61	NC_017319	CAG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545975
62	NC_017319	GAT	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545975
63	NC_017319	GCC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545975
64	NC_017319	TCA	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545975
65	NC_017319	TAA	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545975
66	NC_017319	GGC	2	6	7120	7125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545976
67	NC_017319	ATT	2	6	7262	7267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545976
68	NC_017319	TCT	2	6	7485	7490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545977
69	NC_017319	TAT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
70	NC_017319	TAC	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545977
71	NC_017319	TTA	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
72	NC_017319	ATA	2	6	7758	7763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
73	NC_017319	AAC	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545977
74	NC_017319	AAT	2	6	7877	7882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
75	NC_017319	ACT	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545977
76	NC_017319	TTA	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
77	NC_017319	GCA	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545977
78	NC_017319	AAT	2	6	8203	8208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
79	NC_017319	ATA	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
80	NC_017319	ATC	2	6	8494	8499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545977
81	NC_017319	AAC	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545977
82	NC_017319	TGG	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545977
83	NC_017319	TAA	2	6	8727	8732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
84	NC_017319	AAG	2	6	8839	8844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545977
85	NC_017319	ATA	2	6	9038	9043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545977
86	NC_017319	TAT	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545977
87	NC_017319	ATC	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545978
88	NC_017319	CTT	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545978
89	NC_017319	TAA	2	6	9786	9791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545978
90	NC_017319	ATA	2	6	9926	9931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545978
91	NC_017319	CAA	2	6	9998	10003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384545978
92	NC_017319	CAG	2	6	10507	10512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545979
93	NC_017319	TTC	2	6	10613	10618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545979
94	NC_017319	TGC	2	6	10804	10809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545980
95	NC_017319	GAC	3	9	10835	10843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545980
96	NC_017319	CCA	2	6	10886	10891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384545980
97	NC_017319	TCA	2	6	11418	11423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545981
98	NC_017319	TGC	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545981
99	NC_017319	TAT	2	6	11536	11541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545981
100	NC_017319	TGA	2	6	11543	11548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545981
101	NC_017319	TTG	2	6	11666	11671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545981
102	NC_017319	TAT	2	6	11705	11710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384545981
103	NC_017319	CCG	2	6	12179	12184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545982
104	NC_017319	TGA	2	6	12235	12240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545982
105	NC_017319	CTG	2	6	12885	12890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545983
106	NC_017319	CGC	2	6	12970	12975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384545983
107	NC_017319	TCG	2	6	13052	13057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545983
108	NC_017319	TCA	2	6	13062	13067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545983
109	NC_017319	TCT	2	6	13076	13081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545983
110	NC_017319	TGT	2	6	13098	13103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545983
111	NC_017319	GGC	2	6	13143	13148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545983
112	NC_017319	GCT	2	6	13161	13166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545983
113	NC_017319	CTG	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545983
114	NC_017319	TCA	2	6	13363	13368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545984
115	NC_017319	AGA	2	6	13382	13387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545984
116	NC_017319	GAA	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384545985
117	NC_017319	CTT	2	6	13761	13766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545985
118	NC_017319	GGT	2	6	13829	13834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545985
119	NC_017319	CGG	2	6	13848	13853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545985
120	NC_017319	TCG	2	6	13956	13961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384545986
121	NC_017319	TCA	2	6	14040	14045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545986
122	NC_017319	TCA	2	6	14052	14057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545986
123	NC_017319	ATC	2	6	14126	14131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545986
124	NC_017319	TCC	2	6	14296	14301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384545986
125	NC_017319	CAG	2	6	14332	14337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545986
126	NC_017319	CAG	2	6	14368	14373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545986
127	NC_017319	GAT	2	6	14445	14450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545986
128	NC_017319	ATC	2	6	14504	14509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545986
129	NC_017319	TAA	2	6	14561	14566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545986
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133	NC_017319	GCG	2	6	14838	14843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384545986
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252	NC_017319	TGA	2	6	28821	28826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546004
253	NC_017319	GAA	2	6	28833	28838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546004
254	NC_017319	TTA	2	6	28859	28864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546004
255	NC_017319	CTG	2	6	28865	28870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546004
256	NC_017319	TAT	2	6	28905	28910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546004
257	NC_017319	ATG	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546005
258	NC_017319	AAC	2	6	29365	29370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546005
259	NC_017319	ATG	2	6	29597	29602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546006
260	NC_017319	ACG	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546006
261	NC_017319	CTT	2	6	29815	29820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546006
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265	NC_017319	GTA	2	6	30180	30185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546008
266	NC_017319	GTA	2	6	30349	30354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546008
267	NC_017319	CTT	2	6	30436	30441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546008
268	NC_017319	TGC	2	6	30466	30471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546008
269	NC_017319	TTC	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546008
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271	NC_017319	TAC	2	6	30703	30708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546008
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273	NC_017319	GTG	2	6	30925	30930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546008
274	NC_017319	TTC	2	6	31105	31110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546008
275	NC_017319	TGG	2	6	31213	31218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546008
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277	NC_017319	ATG	2	6	31348	31353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546009
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281	NC_017319	CAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546011
282	NC_017319	ATC	2	6	32094	32099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546011
283	NC_017319	ATA	2	6	32115	32120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546011
284	NC_017319	GGA	2	6	32140	32145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546012
285	NC_017319	TCG	2	6	32169	32174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546012
286	NC_017319	ATG	2	6	32515	32520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546012
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319	NC_017319	TGC	2	6	36590	36595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546020
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322	NC_017319	TTG	2	6	36623	36628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546020
323	NC_017319	TCT	2	6	36715	36720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546020
324	NC_017319	CAA	2	6	36733	36738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546020
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330	NC_017319	TAA	3	9	37001	37009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
331	NC_017319	ATA	2	6	37173	37178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
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342	NC_017319	TCT	2	6	39150	39155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546024
343	NC_017319	CTG	2	6	39160	39165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546024
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373	NC_017319	AAC	2	6	41802	41807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
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499	NC_017319	TCG	2	6	54808	54813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546043
500	NC_017319	CTT	2	6	54860	54865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546043

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