MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	GA	3	6	1318	1323	50 %	0 %	50 %	0 %	384545969
2	NC_017319	CT	3	6	1799	1804	0 %	50 %	0 %	50 %	384545969
3	NC_017319	CT	3	6	4011	4016	0 %	50 %	0 %	50 %	384545971
4	NC_017319	AT	3	6	4240	4245	50 %	50 %	0 %	0 %	384545971
5	NC_017319	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	384545972
6	NC_017319	TG	3	6	5273	5278	0 %	50 %	50 %	0 %	384545973
7	NC_017319	TG	3	6	6558	6563	0 %	50 %	50 %	0 %	384545975
8	NC_017319	AT	3	6	7014	7019	50 %	50 %	0 %	0 %	384545976
9	NC_017319	TA	3	6	7771	7776	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
10	NC_017319	TG	3	6	7831	7836	0 %	50 %	50 %	0 %	384545977
11	NC_017319	TA	3	6	8233	8238	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
12	NC_017319	AT	3	6	8368	8373	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
13	NC_017319	AT	4	8	8926	8933	50 %	50 %	0 %	0 %	384545977
14	NC_017319	AT	3	6	10106	10111	50 %	50 %	0 %	0 %	384545978
15	NC_017319	AT	3	6	10181	10186	50 %	50 %	0 %	0 %	384545978
16	NC_017319	TA	3	6	11338	11343	50 %	50 %	0 %	0 %	384545981
17	NC_017319	AT	3	6	11490	11495	50 %	50 %	0 %	0 %	384545981
18	NC_017319	AT	3	6	11622	11627	50 %	50 %	0 %	0 %	384545981
19	NC_017319	GT	3	6	11844	11849	0 %	50 %	50 %	0 %	384545981
20	NC_017319	TA	4	8	11857	11864	50 %	50 %	0 %	0 %	384545981
21	NC_017319	AC	3	6	14793	14798	50 %	0 %	0 %	50 %	384545986
22	NC_017319	GA	3	6	15099	15104	50 %	0 %	50 %	0 %	384545986
23	NC_017319	TG	3	6	15352	15357	0 %	50 %	50 %	0 %	384545987
24	NC_017319	AT	3	6	19457	19462	50 %	50 %	0 %	0 %	384545993
25	NC_017319	AT	3	6	19465	19470	50 %	50 %	0 %	0 %	384545993
26	NC_017319	AG	3	6	20099	20104	50 %	0 %	50 %	0 %	384545994
27	NC_017319	AT	3	6	21179	21184	50 %	50 %	0 %	0 %	384545995
28	NC_017319	TC	4	8	23422	23429	0 %	50 %	0 %	50 %	384545998
29	NC_017319	CG	3	6	23651	23656	0 %	0 %	50 %	50 %	384545998
30	NC_017319	TC	3	6	23765	23770	0 %	50 %	0 %	50 %	384545998
31	NC_017319	CG	3	6	27111	27116	0 %	0 %	50 %	50 %	384546003
32	NC_017319	GT	3	6	27309	27314	0 %	50 %	50 %	0 %	384546003
33	NC_017319	GA	3	6	28001	28006	50 %	0 %	50 %	0 %	384546003
34	NC_017319	AG	3	6	28660	28665	50 %	0 %	50 %	0 %	384546004
35	NC_017319	AT	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	384546004
36	NC_017319	TG	3	6	32353	32358	0 %	50 %	50 %	0 %	384546012
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39	NC_017319	GT	3	6	34923	34928	0 %	50 %	50 %	0 %	384546017
40	NC_017319	GA	3	6	34930	34935	50 %	0 %	50 %	0 %	384546017
41	NC_017319	TG	3	6	35050	35055	0 %	50 %	50 %	0 %	384546017
42	NC_017319	CG	3	6	35117	35122	0 %	0 %	50 %	50 %	384546017
43	NC_017319	AG	4	8	35230	35237	50 %	0 %	50 %	0 %	384546018
44	NC_017319	GC	3	6	35741	35746	0 %	0 %	50 %	50 %	384546019
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46	NC_017319	AG	3	6	36908	36913	50 %	0 %	50 %	0 %	384546020
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48	NC_017319	TA	3	6	38377	38382	50 %	50 %	0 %	0 %	384546022
49	NC_017319	AG	3	6	38616	38621	50 %	0 %	50 %	0 %	384546023
50	NC_017319	CT	3	6	42527	42532	0 %	50 %	0 %	50 %	384546026
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52	NC_017319	AT	3	6	44460	44465	50 %	50 %	0 %	0 %	384546029
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54	NC_017319	GC	3	6	46830	46835	0 %	0 %	50 %	50 %	384546034
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57	NC_017319	TG	3	6	47179	47184	0 %	50 %	50 %	0 %	384546034
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62	NC_017319	AG	3	6	48793	48798	50 %	0 %	50 %	0 %	384546036
63	NC_017319	GA	3	6	48957	48962	50 %	0 %	50 %	0 %	384546036
64	NC_017319	AC	3	6	51193	51198	50 %	0 %	0 %	50 %	384546040
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68	NC_017319	GC	3	6	56134	56139	0 %	0 %	50 %	50 %	384546043
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73	NC_017319	TG	3	6	58525	58530	0 %	50 %	50 %	0 %	384546046
74	NC_017319	CG	3	6	58592	58597	0 %	0 %	50 %	50 %	384546046
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109	NC_017319	GA	3	6	85570	85575	50 %	0 %	50 %	0 %	384546083
110	NC_017319	CT	3	6	85871	85876	0 %	50 %	0 %	50 %	384546084
111	NC_017319	TC	4	8	86146	86153	0 %	50 %	0 %	50 %	384546084
112	NC_017319	TG	3	6	87463	87468	0 %	50 %	50 %	0 %	384546086
113	NC_017319	AT	3	6	87919	87924	50 %	50 %	0 %	0 %	384546087
114	NC_017319	TA	3	6	91606	91611	50 %	50 %	0 %	0 %	384546091
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.