MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Edwardsiella tarda FL6-60 plasmid pFL6-60

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017318	CAGC	2	8	48	55	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017318	TGGT	2	8	108	115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017318	GGTC	2	8	919	926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017318	TCCG	2	8	1461	1468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017318	GCTG	2	8	2215	2222	0 %	25 %	50 %	25 %	387134044
6	NC_017318	GGAT	2	8	2226	2233	25 %	25 %	50 %	0 %	387134044
7	NC_017318	AGCC	2	8	2259	2266	25 %	0 %	25 %	50 %	387134044
8	NC_017318	AAGG	2	8	2577	2584	50 %	0 %	50 %	0 %	387134045
9	NC_017318	TGAG	2	8	2999	3006	25 %	25 %	50 %	0 %	387134045
10	NC_017318	GATG	2	8	3762	3769	25 %	25 %	50 %	0 %	387134047
11	NC_017318	GTTG	2	8	4486	4493	0 %	50 %	50 %	0 %	387134048
12	NC_017318	TCGA	2	8	5213	5220	25 %	25 %	25 %	25 %	387134050
13	NC_017318	TGAC	2	8	5490	5497	25 %	25 %	25 %	25 %	387134050
14	NC_017318	AGCG	2	8	6147	6154	25 %	0 %	50 %	25 %	387134050
15	NC_017318	AAGC	2	8	6341	6348	50 %	0 %	25 %	25 %	387134050
16	NC_017318	TGAA	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	387134050
17	NC_017318	CAAC	2	8	7541	7548	50 %	0 %	0 %	50 %	387134050
18	NC_017318	GGGC	2	8	7569	7576	0 %	0 %	75 %	25 %	387134050
19	NC_017318	TCGC	2	8	8416	8423	0 %	25 %	25 %	50 %	387134052
20	NC_017318	GTTT	2	8	8631	8638	0 %	75 %	25 %	0 %	387134052
21	NC_017318	TCCC	2	8	8781	8788	0 %	25 %	0 %	75 %	387134052
22	NC_017318	AAAG	2	8	9177	9184	75 %	0 %	25 %	0 %	387134053
23	NC_017318	ATAA	2	8	9337	9344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017318	TGAT	2	8	9395	9402	25 %	50 %	25 %	0 %	387134054
25	NC_017318	ACTA	2	8	10226	10233	50 %	25 %	0 %	25 %	387134055
26	NC_017318	TGAT	2	8	10799	10806	25 %	50 %	25 %	0 %	387134056
27	NC_017318	GATC	2	8	11046	11053	25 %	25 %	25 %	25 %	387134056
28	NC_017318	CCCG	2	8	11243	11250	0 %	0 %	25 %	75 %	387134056
29	NC_017318	CAGC	2	8	11406	11413	25 %	0 %	25 %	50 %	387134056
30	NC_017318	GGAT	2	8	11502	11509	25 %	25 %	50 %	0 %	387134056
31	NC_017318	CCTA	2	8	11702	11709	25 %	25 %	0 %	50 %	387134056
32	NC_017318	CCGG	2	8	12358	12365	0 %	0 %	50 %	50 %	387134056
33	NC_017318	CATT	2	8	12754	12761	25 %	50 %	0 %	25 %	387134056
34	NC_017318	GCAG	2	8	13443	13450	25 %	0 %	50 %	25 %	387134056
35	NC_017318	GGCC	2	8	13795	13802	0 %	0 %	50 %	50 %	387134056
36	NC_017318	TCAT	2	8	14768	14775	25 %	50 %	0 %	25 %	387134057
37	NC_017318	TTAA	2	8	15696	15703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017318	AGAT	2	8	16419	16426	50 %	25 %	25 %	0 %	387134059
39	NC_017318	AATA	2	8	16608	16615	75 %	25 %	0 %	0 %	387134059
40	NC_017318	ACGA	2	8	16746	16753	50 %	0 %	25 %	25 %	387134060
41	NC_017318	GCCA	2	8	17134	17141	25 %	0 %	25 %	50 %	387134060
42	NC_017318	GCCA	2	8	17197	17204	25 %	0 %	25 %	50 %	387134060
43	NC_017318	GCAG	2	8	17289	17296	25 %	0 %	50 %	25 %	387134060
44	NC_017318	GCCA	2	8	17386	17393	25 %	0 %	25 %	50 %	387134060
45	NC_017318	TGGA	2	8	18627	18634	25 %	25 %	50 %	0 %	387134060
46	NC_017318	ATGC	2	8	19707	19714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017318	AATC	2	8	19770	19777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017318	TAAA	2	8	19789	19796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017318	CAGT	2	8	20336	20343	25 %	25 %	25 %	25 %	387134062
50	NC_017318	AGAA	2	8	20392	20399	75 %	0 %	25 %	0 %	387134062
51	NC_017318	GCGA	2	8	20653	20660	25 %	0 %	50 %	25 %	387134062
52	NC_017318	GAAA	2	8	20721	20728	75 %	0 %	25 %	0 %	387134062
53	NC_017318	CTGA	2	8	21102	21109	25 %	25 %	25 %	25 %	387134062
54	NC_017318	CGTC	2	8	21676	21683	0 %	25 %	25 %	50 %	387134064
55	NC_017318	TCAT	2	8	22726	22733	25 %	50 %	0 %	25 %	387134066
56	NC_017318	ATGT	2	8	22828	22835	25 %	50 %	25 %	0 %	387134066
57	NC_017318	CCAG	2	8	22961	22968	25 %	0 %	25 %	50 %	387134066
58	NC_017318	GATG	2	8	23313	23320	25 %	25 %	50 %	0 %	387134067
59	NC_017318	TAAT	2	8	23458	23465	50 %	50 %	0 %	0 %	387134068
60	NC_017318	GCCA	2	8	23493	23500	25 %	0 %	25 %	50 %	387134068
61	NC_017318	GCTG	2	8	23602	23609	0 %	25 %	50 %	25 %	387134068
62	NC_017318	GCTC	2	8	23713	23720	0 %	25 %	25 %	50 %	387134068
63	NC_017318	GCTG	2	8	23737	23744	0 %	25 %	50 %	25 %	387134068
64	NC_017318	AGTG	2	8	23815	23822	25 %	25 %	50 %	0 %	387134068
65	NC_017318	GCTG	2	8	23920	23927	0 %	25 %	50 %	25 %	387134068
66	NC_017318	CCAT	2	8	24237	24244	25 %	25 %	0 %	50 %	387134069
67	NC_017318	TGGC	2	8	24290	24297	0 %	25 %	50 %	25 %	387134069
68	NC_017318	TGCT	2	8	24909	24916	0 %	50 %	25 %	25 %	387134070
69	NC_017318	TCCC	2	8	25446	25453	0 %	25 %	0 %	75 %	387134072
70	NC_017318	CAGC	2	8	25637	25644	25 %	0 %	25 %	50 %	387134072
71	NC_017318	GAAC	2	8	25987	25994	50 %	0 %	25 %	25 %	387134073
72	NC_017318	GCTG	2	8	26288	26295	0 %	25 %	50 %	25 %	387134073
73	NC_017318	CAGC	2	8	26333	26340	25 %	0 %	25 %	50 %	387134073
74	NC_017318	CCAG	2	8	26579	26586	25 %	0 %	25 %	50 %	387134073
75	NC_017318	TTAT	2	8	26720	26727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017318	TGAT	2	8	27014	27021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017318	GTAG	2	8	28010	28017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017318	CTTA	2	8	28877	28884	25 %	50 %	0 %	25 %	387134076
79	NC_017318	CACC	2	8	29291	29298	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017318	GTCG	2	8	29980	29987	0 %	25 %	50 %	25 %	387134079
81	NC_017318	AAAC	2	8	30664	30671	75 %	0 %	0 %	25 %	387134081
82	NC_017318	GCAG	2	8	30993	31000	25 %	0 %	50 %	25 %	387134081
83	NC_017318	CTGG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	387134083
84	NC_017318	TCTG	2	8	32055	32062	0 %	50 %	25 %	25 %	387134084
85	NC_017318	TGTA	2	8	32363	32370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017318	AGTC	2	8	32633	32640	25 %	25 %	25 %	25 %	387134085
87	NC_017318	GGAG	2	8	33108	33115	25 %	0 %	75 %	0 %	387134085
88	NC_017318	CTGA	2	8	33604	33611	25 %	25 %	25 %	25 %	387134086
89	NC_017318	GAGC	2	8	34792	34799	25 %	0 %	50 %	25 %	387134087
90	NC_017318	CAGC	2	8	34896	34903	25 %	0 %	25 %	50 %	387134088
91	NC_017318	AATG	2	8	35117	35124	50 %	25 %	25 %	0 %	387134089
92	NC_017318	CGAT	2	8	35892	35899	25 %	25 %	25 %	25 %	387134091
93	NC_017318	GGCT	2	8	36679	36686	0 %	25 %	50 %	25 %	387134092
94	NC_017318	AAGG	2	8	37108	37115	50 %	0 %	50 %	0 %	387134093
95	NC_017318	GGCA	2	8	37500	37507	25 %	0 %	50 %	25 %	387134093
96	NC_017318	GGAT	2	8	37607	37614	25 %	25 %	50 %	0 %	387134093
97	NC_017318	TGGT	2	8	37788	37795	0 %	50 %	50 %	0 %	387134094
98	NC_017318	GTTG	2	8	38581	38588	0 %	50 %	50 %	0 %	387134096
99	NC_017318	CTAT	2	8	38619	38626	25 %	50 %	0 %	25 %	387134096
100	NC_017318	TAAT	2	8	39008	39015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017318	GTAT	2	8	39107	39114	25 %	50 %	25 %	0 %	387134098
102	NC_017318	GTGG	2	8	39338	39345	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017318	AGCC	2	8	39795	39802	25 %	0 %	25 %	50 %	387134100
104	NC_017318	GCTG	2	8	40144	40151	0 %	25 %	50 %	25 %	387134100
105	NC_017318	TGTC	2	8	40387	40394	0 %	50 %	25 %	25 %	387134101
106	NC_017318	CCCG	2	8	40429	40436	0 %	0 %	25 %	75 %	387134101
107	NC_017318	GATG	2	8	40462	40469	25 %	25 %	50 %	0 %	387134101
108	NC_017318	TTGG	2	8	40667	40674	0 %	50 %	50 %	0 %	387134101
109	NC_017318	CTGA	2	8	40720	40727	25 %	25 %	25 %	25 %	387134101
110	NC_017318	CCTC	2	8	40891	40898	0 %	25 %	0 %	75 %	387134101
111	NC_017318	TGGA	2	8	41197	41204	25 %	25 %	50 %	0 %	387134101
112	NC_017318	ACTG	2	8	41317	41324	25 %	25 %	25 %	25 %	387134101
113	NC_017318	CTAT	2	8	41891	41898	25 %	50 %	0 %	25 %	387134101
114	NC_017318	CAAT	2	8	42233	42240	50 %	25 %	0 %	25 %	387134101
115	NC_017318	AGGG	2	8	42290	42297	25 %	0 %	75 %	0 %	387134101
116	NC_017318	GCTG	2	8	43005	43012	0 %	25 %	50 %	25 %	387134103
117	NC_017318	AGCG	2	8	43286	43293	25 %	0 %	50 %	25 %	387134103

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.