MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans 809 chromosome

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017317	TTGTAT	2	12	19936	19947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017317	TTCCTG	2	12	85949	85960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017317	GAGTCA	2	12	90965	90976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017317	TTGTGT	2	12	106157	106168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017317	CTCACT	2	12	177917	177928	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017317	TGGTGC	2	12	180383	180394	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017317	GAGGAT	2	12	186826	186837	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017317	TTCGCG	2	12	195241	195252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017317	GTCTAT	2	12	202266	202277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017317	AGGGGG	2	12	223138	223149	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017317	GGTAAG	2	12	245918	245929	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017317	GTCCAC	2	12	437946	437957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017317	GCAATG	2	12	456109	456120	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017317	ATTTTT	2	12	551454	551465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017317	GTGCCT	2	12	556170	556181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017317	GCTTTG	2	12	610904	610915	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017317	TGAGAA	2	12	658444	658455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017317	GATAAG	2	12	686118	686129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017317	AGCGAA	2	12	693406	693417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017317	TGCCTG	2	12	708488	708499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017317	TGCGCG	2	12	717807	717818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017317	CAAGCT	2	12	802124	802135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017317	CGTGGC	2	12	807170	807181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017317	ACGAAA	2	12	821700	821711	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017317	AATGAC	2	12	1004882	1004893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017317	GTGGTT	2	12	1048987	1048998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017317	TAGCGT	2	12	1065193	1065204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017317	GGACGT	2	12	1084553	1084564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017317	GATTGT	2	12	1088346	1088357	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017317	AGCGAA	2	12	1124262	1124273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017317	TCAACT	2	12	1170456	1170467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017317	AACCAC	2	12	1274063	1274074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017317	GCAATA	2	12	1405688	1405699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017317	CAACGC	2	12	1438863	1438874	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017317	GCTAAT	2	12	1452181	1452192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017317	TTCCTT	2	12	1520071	1520082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017317	TGTGCT	2	12	1534321	1534332	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017317	AAAAAT	2	12	1534489	1534500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017317	TATTTC	2	12	1566792	1566803	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017317	GACGGT	2	12	1592269	1592280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017317	CTTAGC	2	12	1596837	1596848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017317	CAAAGA	2	12	1625716	1625727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017317	GTCCCC	2	12	1710285	1710296	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017317	TTCCCA	2	12	1778545	1778556	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017317	CCAAAC	2	12	1921176	1921187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017317	AAAAGA	2	12	1942958	1942969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017317	ATTGCC	2	12	1957911	1957922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017317	ATTTAG	2	12	1959795	1959806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017317	ACCTTT	2	12	1967536	1967547	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017317	CGTTCC	2	12	1974101	1974112	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017317	ACCTAC	2	12	1975008	1975019	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017317	TTCGCT	2	12	1989557	1989568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017317	AAAACA	2	12	2000499	2000510	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017317	CCACAC	2	12	2108492	2108503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017317	CATTTC	2	12	2115174	2115185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017317	CCACAC	2	12	2164432	2164443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017317	AGAAAA	2	12	2183935	2183946	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017317	AAAAGA	2	12	2204483	2204494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017317	TCTCAA	2	12	2210434	2210445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017317	TTCAAT	2	12	2216729	2216740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017317	TTTAGT	2	12	2243212	2243223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017317	CAAAAG	2	12	2309445	2309456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017317	CTTGAA	2	12	2357340	2357351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017317	TTCGCT	2	12	2379491	2379502	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017317	CGTCCC	2	12	2387844	2387855	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017317	ACCTAA	2	12	2447307	2447318	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017317	CCATTA	2	12	2483594	2483605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017317	TTTTCT	2	12	2491658	2491669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.