MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis OG1RF chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017316	TAAAAA	2	12	127151	127162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017316	ACCTCT	2	12	189745	189756	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017316	GTTATT	2	12	196049	196060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017316	TAGGCG	2	12	217297	217308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017316	TGGAAG	2	12	218747	218758	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017316	TCATAT	2	12	219185	219196	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017316	TTTTAT	2	12	220013	220024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017316	AAAAAG	2	12	270655	270666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017316	AAAAAG	2	12	301278	301289	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017316	GTCCTC	2	12	339087	339098	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017316	TACAAA	2	12	354091	354102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017316	AAATAT	2	12	390592	390603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017316	ATTAAA	2	12	456924	456935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017316	TTTTCA	2	12	480448	480459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017316	TGAAAA	2	12	480611	480622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017316	AAACAA	2	12	488392	488403	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017316	TTACAT	2	12	558328	558339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017316	GGTGAC	2	12	560796	560807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017316	TAGAAG	2	12	575646	575657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017316	AAAGGA	2	12	586767	586778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017316	GAATAA	2	12	593088	593099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017316	CTTTTT	2	12	606303	606314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017316	ATATAA	2	12	608640	608651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017316	TTTTAT	2	12	647130	647141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017316	TTAAAA	2	12	703233	703244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017316	AGTCTA	2	12	731930	731941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017316	TTCATT	2	12	766568	766579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017316	ATTGTT	2	12	791787	791798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017316	AATAAA	2	12	797597	797608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017316	CTTTTT	2	12	803499	803510	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017316	TAGGCG	2	12	822202	822213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017316	TGGAAG	2	12	823652	823663	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017316	TATTTT	2	12	857334	857345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017316	AAAAAG	2	12	902420	902431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017316	AAAAAT	2	12	904547	904558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017316	AATGAA	2	12	923542	923553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017316	AAAGGA	2	12	928467	928478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017316	GTTATT	2	12	959950	959961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017316	ACTATC	2	12	1015799	1015810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017316	TTTGTA	2	12	1024753	1024764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017316	TTTTTC	2	12	1037077	1037088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017316	TTTAAA	2	12	1041297	1041308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017316	TAAAAA	2	12	1061624	1061635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017316	AAAAAG	2	12	1090495	1090506	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017316	AATTCC	2	12	1144188	1144199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017316	AAGAAA	2	12	1187632	1187643	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017316	GAGATA	2	12	1245473	1245484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017316	ATACTA	2	12	1250425	1250436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017316	ATAAAA	2	12	1516686	1516697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017316	TGGTTA	2	12	1543165	1543176	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017316	TAAAAA	2	12	1554798	1554809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017316	ATTGTA	2	12	1565207	1565218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017316	TTTTAT	2	12	1580028	1580039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017316	TTTCAT	2	12	1663544	1663555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017316	TATAAA	2	12	1689296	1689307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017316	ATACTT	2	12	1689419	1689430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017316	CGAAAA	2	12	1724875	1724886	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017316	TTGCCT	2	12	1738430	1738441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017316	AGTTAT	2	12	1786261	1786272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017316	ATTCAA	2	12	1787445	1787456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017316	TATACT	2	12	1972417	1972428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017316	AGCTAA	2	12	1982440	1982451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017316	TTTTAA	2	12	1992119	1992130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017316	TTATTT	2	12	2045030	2045041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017316	CTTTTT	2	12	2065297	2065308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017316	TCATTC	2	12	2166872	2166883	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017316	TCTTTT	2	12	2219881	2219892	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017316	TATTTT	2	12	2231594	2231605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017316	GATAAA	2	12	2234393	2234404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017316	CAATGA	2	12	2234411	2234422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017316	TTTTGC	2	12	2310262	2310273	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017316	CTTCCA	2	12	2310621	2310632	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017316	CGCCTA	2	12	2312071	2312082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017316	CTTTCT	2	12	2342242	2342253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017316	AAATAA	2	12	2470224	2470235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017316	TTTTTA	2	12	2534978	2534989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017316	TTTTTA	2	12	2542850	2542861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017316	TTTTTC	2	12	2551637	2551648	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017316	AATGAA	2	12	2562404	2562415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017316	AATGAA	2	12	2562844	2562855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017316	TCAATT	2	12	2618731	2618742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017316	CAACGT	2	12	2623742	2623753	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017316	TCCTCA	2	12	2625094	2625105	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017316	ATATGA	2	12	2686631	2686642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017316	CTTCCA	2	12	2687069	2687080	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017316	CGCCTA	2	12	2688519	2688530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.