MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis OG1RF chromosome

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017316	ATATA	2	10	1535	1544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017316	TAAAA	2	10	16427	16436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017316	TGTAA	2	10	35266	35275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017316	GATAA	2	10	40441	40450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017316	GAGAA	2	10	41476	41485	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017316	ATGCT	2	10	53118	53127	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017316	TCCAT	2	10	58957	58966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017316	TAAAA	2	10	88428	88437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017316	GTAAA	2	10	101184	101193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017316	AGTAT	2	10	113854	113863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017316	AAAAG	2	10	135585	135594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017316	AGTTT	2	10	154432	154441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017316	TAGAA	2	10	161788	161797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017316	ACAAA	2	10	163205	163214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017316	GATTT	2	10	163339	163348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017316	TGTCT	2	10	171170	171179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017316	GAAAA	2	10	186337	186346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017316	AAACA	2	10	196070	196079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017316	GTAAA	2	10	196108	196117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017316	AAGAG	2	10	209255	209264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017316	ATTCA	2	10	213332	213341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017316	TCGTG	2	10	214510	214519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017316	CCGTA	2	10	217537	217546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017316	AGGGA	2	10	218638	218647	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017316	AAAAG	2	10	220250	220259	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017316	CTTTT	2	10	220410	220419	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017316	TTGGT	2	10	220836	220845	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017316	TCCTT	2	10	228973	228982	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017316	TATCA	2	10	238949	238958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017316	AGGAA	2	10	274223	274232	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017316	CAAGA	2	10	291234	291243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017316	ATTTT	2	10	298922	298931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017316	TTGTA	2	10	314787	314796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017316	TAGTT	2	10	315557	315566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017316	AAGGA	2	10	322666	322675	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017316	CTAAA	2	10	327687	327696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017316	AAAAT	2	10	341239	341248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017316	CTTTT	2	10	360390	360399	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017316	TTTTA	2	10	362259	362268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017316	AAAGA	2	10	376418	376427	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017316	GAAGA	2	10	379905	379914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017316	TAACA	2	10	387010	387019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017316	GTAAG	2	10	393071	393080	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017316	ACGAT	2	10	415794	415803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017316	TCGTT	2	10	422866	422875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017316	AGTTA	2	10	423701	423710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017316	TAAAA	2	10	430308	430317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017316	ATAGA	2	10	431375	431384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017316	CTTTA	2	10	441231	441240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017316	GATAT	2	10	449892	449901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017316	CTTTA	2	10	449946	449955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017316	TAAAG	2	10	467818	467827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017316	TTTTA	2	10	488165	488174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017316	AATAG	2	10	500596	500605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017316	TTTGC	2	10	502664	502673	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017316	ATAAA	2	10	515196	515205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017316	ATAAA	2	10	535251	535260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017316	GTTCT	2	10	538731	538740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017316	CACTA	2	10	539212	539221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017316	AACAT	2	10	576553	576562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017316	AAACA	2	10	583587	583596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017316	GGGAA	2	10	586779	586788	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017316	GAAAA	2	10	588551	588560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017316	TTTTG	2	10	593063	593072	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017316	GTTCG	2	10	608551	608560	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017316	GATAA	2	10	618991	619000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017316	AATAA	2	10	625281	625290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017316	TAAAC	2	10	632118	632127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017316	CTAAA	2	10	635013	635022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017316	AATAA	2	10	642591	642600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017316	GAAGA	2	10	671987	671996	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017316	AATGA	2	10	689665	689674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017316	AAAAT	2	10	695270	695279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017316	CTTTT	2	10	701823	701832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017316	TATAA	2	10	701964	701973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017316	AAATA	2	10	702475	702484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017316	GGATG	2	10	702518	702527	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017316	GTTTT	2	10	702629	702638	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017316	AGTAA	2	10	724125	724134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017316	AGGAA	2	10	768597	768606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017316	GTTTT	2	10	773267	773276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017316	TCTAT	2	10	794061	794070	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017316	ACTTT	2	10	794126	794135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017316	GAAAA	2	10	798298	798307	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017316	TTTTA	2	10	801897	801906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017316	AAGAG	2	10	806771	806780	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017316	TATAT	2	10	810294	810303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017316	ATTCA	2	10	818826	818835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017316	TCGTG	2	10	820001	820010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017316	CCGTA	2	10	822442	822451	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017316	AGGGA	2	10	823543	823552	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017316	AAAGA	2	10	828689	828698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017316	TGTTA	2	10	844407	844416	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017316	ATGTA	2	10	848670	848679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017316	CTTTT	2	10	858504	858513	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017316	ATTAT	2	10	867071	867080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017316	TAAAA	2	10	868032	868041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017316	CAAGA	2	10	872041	872050	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017316	TATTC	2	10	877481	877490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017316	TATGT	2	10	877550	877559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017316	ATTGG	2	10	887996	888005	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017316	ATCAA	2	10	888684	888693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017316	TAAAA	2	10	888715	888724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017316	ATTGT	2	10	890191	890200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017316	CTTTA	2	10	906083	906092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017316	TAAAC	2	10	936299	936308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017316	AAATG	2	10	936474	936483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017316	TAAAT	2	10	943369	943378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017316	AAAAC	2	10	947191	947200	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017316	ACATC	2	10	958802	958811	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017316	TATAT	2	10	963084	963093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017316	AGAAT	2	10	963763	963772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017316	CTTTT	2	10	985812	985821	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017316	AGAAA	2	10	991119	991128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017316	TAAAC	2	10	992676	992685	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017316	TGTAT	2	10	996591	996600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017316	CTTTT	2	10	1002847	1002856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017316	AGAAA	2	10	1041257	1041266	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017316	ATTTT	2	10	1043682	1043691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017316	ATCCT	2	10	1071025	1071034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017316	TTTTC	2	10	1090529	1090538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017316	TATAC	2	10	1091895	1091904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017316	GGAAG	2	10	1104339	1104348	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017316	CTTTC	2	10	1104358	1104367	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017316	CAAAA	2	10	1108958	1108967	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017316	GAAGG	2	10	1132448	1132457	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017316	TTGTT	2	10	1138113	1138122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017316	TTTAT	2	10	1145277	1145286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017316	AGTAA	2	10	1172415	1172424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017316	TCTTT	2	10	1173886	1173895	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017316	AGAAA	2	10	1190391	1190400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017316	TAATA	2	10	1218876	1218885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017316	AGTGT	2	10	1235725	1235734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017316	CTTTT	2	10	1262182	1262191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017316	ATTTT	2	10	1282673	1282682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017316	AATTT	2	10	1282749	1282758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017316	AAGCC	2	10	1295150	1295159	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017316	TATTC	2	10	1295237	1295246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017316	GTTGA	2	10	1298643	1298652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017316	ATTTT	2	10	1300719	1300728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017316	AGCGA	2	10	1306822	1306831	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017316	GATAG	2	10	1314686	1314695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017316	GAAAC	2	10	1317844	1317853	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017316	AAAAG	2	10	1318856	1318865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017316	TTCTT	2	10	1324003	1324012	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017316	ATTAC	2	10	1358908	1358917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_017316	TAACT	2	10	2649670	2649679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_017316	TTATG	2	10	2659892	2659901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017316	TTTGC	2	10	2669344	2669353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_017316	TAAAA	2	10	2673391	2673400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017316	GCAAA	2	10	2673867	2673876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_017316	TACGG	2	10	2688281	2688290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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300	NC_017316	ATATT	2	10	2734930	2734939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017316	CATAA	2	10	2736513	2736522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_017316	AGACC	2	10	2739013	2739022	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
303	NC_017316	AAATT	2	10	2739295	2739304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.