MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017311	GCGCA	2	10	328	337	20 %	0 %	40 %	40 %	387133887
2	NC_017311	TCAGG	2	10	2007	2016	20 %	20 %	40 %	20 %	387133889
3	NC_017311	CGATG	2	10	2093	2102	20 %	20 %	40 %	20 %	387133889
4	NC_017311	GCCTC	2	10	3986	3995	0 %	20 %	20 %	60 %	387133890
5	NC_017311	GCCCG	2	10	4744	4753	0 %	0 %	40 %	60 %	387133890
6	NC_017311	CTGCA	2	10	7446	7455	20 %	20 %	20 %	40 %	387133892
7	NC_017311	CTGTC	2	10	8498	8507	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017311	CTGTC	2	10	8512	8521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017311	GGCGT	2	10	8738	8747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017311	GTGCG	2	10	14304	14313	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017311	GGGGC	2	10	14727	14736	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017311	GGGCG	2	10	15012	15021	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017311	TCGAC	2	10	15097	15106	20 %	20 %	20 %	40 %	387133899
14	NC_017311	GGGCA	2	10	15214	15223	20 %	0 %	60 %	20 %	387133899
15	NC_017311	CGTGC	2	10	16104	16113	0 %	20 %	40 %	40 %	387133899
16	NC_017311	GGAAG	2	10	17895	17904	40 %	0 %	60 %	0 %	387133901
17	NC_017311	GGTGC	2	10	20904	20913	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017311	TGGCG	2	10	20993	21002	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017311	GCGCG	2	10	21595	21604	0 %	0 %	60 %	40 %	387133904
20	NC_017311	TCCTC	2	10	22117	22126	0 %	40 %	0 %	60 %	387133904
21	NC_017311	ACGCC	2	10	22204	22213	20 %	0 %	20 %	60 %	387133904
22	NC_017311	CGCGC	2	10	24388	24397	0 %	0 %	40 %	60 %	387133907
23	NC_017311	AGGGC	2	10	24409	24418	20 %	0 %	60 %	20 %	387133907
24	NC_017311	ATAGT	2	10	25870	25879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017311	TGCCG	2	10	27152	27161	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017311	ACGCC	2	10	27575	27584	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017311	GGCAG	2	10	28711	28720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017311	GTGTG	2	10	29067	29076	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017311	CGTGC	2	10	29683	29692	0 %	20 %	40 %	40 %	387133911
30	NC_017311	GCCTC	2	10	31555	31564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017311	TGGGG	2	10	31915	31924	0 %	20 %	80 %	0 %	387133914
32	NC_017311	TGCGC	2	10	32488	32497	0 %	20 %	40 %	40 %	387133914
33	NC_017311	TGCAG	2	10	32665	32674	20 %	20 %	40 %	20 %	387133914
34	NC_017311	AATGC	2	10	35179	35188	40 %	20 %	20 %	20 %	387133915
35	NC_017311	GGCCC	2	10	35555	35564	0 %	0 %	40 %	60 %	387133915
36	NC_017311	CCCGT	2	10	35703	35712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017311	CAGCG	2	10	36744	36753	20 %	0 %	40 %	40 %	387133916
38	NC_017311	GGGGC	2	10	39754	39763	0 %	0 %	80 %	20 %	387133917
39	NC_017311	TCGCC	2	10	42341	42350	0 %	20 %	20 %	60 %	387133919
40	NC_017311	AGGGC	2	10	42876	42885	20 %	0 %	60 %	20 %	387133920
41	NC_017311	ACGGC	2	10	45150	45159	20 %	0 %	40 %	40 %	387133922
42	NC_017311	TCGGG	2	10	45628	45637	0 %	20 %	60 %	20 %	387133922
43	NC_017311	TGCGG	2	10	45943	45952	0 %	20 %	60 %	20 %	387133922
44	NC_017311	GGGGA	2	10	46510	46519	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017311	GCTGG	2	10	46689	46698	0 %	20 %	60 %	20 %	387133923
46	NC_017311	TCTCG	2	10	47599	47608	0 %	40 %	20 %	40 %	387133924
47	NC_017311	CGCTG	2	10	48579	48588	0 %	20 %	40 %	40 %	387133925
48	NC_017311	CCCGG	2	10	49189	49198	0 %	0 %	40 %	60 %	387133925
49	NC_017311	CCTGC	2	10	49970	49979	0 %	20 %	20 %	60 %	387133925
50	NC_017311	CCGCG	2	10	50525	50534	0 %	0 %	40 %	60 %	387133926
51	NC_017311	CGGCA	2	10	52257	52266	20 %	0 %	40 %	40 %	387133927
52	NC_017311	CGCGC	2	10	52745	52754	0 %	0 %	40 %	60 %	387133927
53	NC_017311	CGTCC	2	10	53899	53908	0 %	20 %	20 %	60 %	387133928
54	NC_017311	GCGCT	2	10	56811	56820	0 %	20 %	40 %	40 %	387133930
55	NC_017311	GCGCG	2	10	57256	57265	0 %	0 %	60 %	40 %	387133931
56	NC_017311	GGCGT	2	10	59189	59198	0 %	20 %	60 %	20 %	387133932
57	NC_017311	ACGGG	2	10	59263	59272	20 %	0 %	60 %	20 %	387133932
58	NC_017311	GCAGG	2	10	62604	62613	20 %	0 %	60 %	20 %	387133937
59	NC_017311	TCAGG	2	10	62891	62900	20 %	20 %	40 %	20 %	387133937
60	NC_017311	GGGCG	2	10	63089	63098	0 %	0 %	80 %	20 %	387133937
61	NC_017311	GTTCC	2	10	65311	65320	0 %	40 %	20 %	40 %	387133939
62	NC_017311	GCACG	2	10	66568	66577	20 %	0 %	40 %	40 %	387133939
63	NC_017311	GGGCG	2	10	68304	68313	0 %	0 %	80 %	20 %	387133940
64	NC_017311	CGGGG	2	10	69438	69447	0 %	0 %	80 %	20 %	387133941
65	NC_017311	GGTCA	2	10	70470	70479	20 %	20 %	40 %	20 %	387133942
66	NC_017311	TGGCT	2	10	71145	71154	0 %	40 %	40 %	20 %	387133942
67	NC_017311	CACGC	2	10	71427	71436	20 %	0 %	20 %	60 %	387133942
68	NC_017311	GTACC	2	10	72082	72091	20 %	20 %	20 %	40 %	387133943
69	NC_017311	GGCAG	2	10	73097	73106	20 %	0 %	60 %	20 %	387133944
70	NC_017311	GCTGC	2	10	73951	73960	0 %	20 %	40 %	40 %	387133944
71	NC_017311	CACGC	2	10	74686	74695	20 %	0 %	20 %	60 %	387133945
72	NC_017311	CGGCA	2	10	75657	75666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017311	GGGAA	2	10	75697	75706	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017311	CGGGG	2	10	75906	75915	0 %	0 %	80 %	20 %	387133946
75	NC_017311	GACGG	2	10	76570	76579	20 %	0 %	60 %	20 %	387133946
76	NC_017311	GCACC	2	10	78320	78329	20 %	0 %	20 %	60 %	387133947
77	NC_017311	TGACG	2	10	79491	79500	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017311	GCATG	2	10	81331	81340	20 %	20 %	40 %	20 %	387133948
79	NC_017311	TCTTT	2	10	83107	83116	0 %	80 %	0 %	20 %	387133950
80	NC_017311	CGAGT	2	10	84036	84045	20 %	20 %	40 %	20 %	387133950
81	NC_017311	CGGAA	2	10	86197	86206	40 %	0 %	40 %	20 %	387133952
82	NC_017311	GTGCG	2	10	86951	86960	0 %	20 %	60 %	20 %	387133953
83	NC_017311	GGCGT	2	10	88295	88304	0 %	20 %	60 %	20 %	387133953
84	NC_017311	GCGAA	2	10	90188	90197	40 %	0 %	40 %	20 %	387133954
85	NC_017311	GTCGT	2	10	91636	91645	0 %	40 %	40 %	20 %	387133955
86	NC_017311	GCCGG	2	10	92409	92418	0 %	0 %	60 %	40 %	387133956
87	NC_017311	CAGGT	2	10	92766	92775	20 %	20 %	40 %	20 %	387133956
88	NC_017311	GCCCC	2	10	94247	94256	0 %	0 %	20 %	80 %	387133956
89	NC_017311	CCGTC	2	10	95495	95504	0 %	20 %	20 %	60 %	387133957
90	NC_017311	TGCAC	2	10	95522	95531	20 %	20 %	20 %	40 %	387133957
91	NC_017311	ATGGT	2	10	96943	96952	20 %	40 %	40 %	0 %	387133958
92	NC_017311	AGGCG	2	10	98281	98290	20 %	0 %	60 %	20 %	387133959
93	NC_017311	GTGCC	2	10	98404	98413	0 %	20 %	40 %	40 %	387133959
94	NC_017311	GTGCA	2	10	99745	99754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017311	TGCCC	2	10	101153	101162	0 %	20 %	20 %	60 %	387133963
96	NC_017311	GCCGG	2	10	101211	101220	0 %	0 %	60 %	40 %	387133963
97	NC_017311	GCCCC	2	10	101853	101862	0 %	0 %	20 %	80 %	387133964
98	NC_017311	ACGGC	2	10	102042	102051	20 %	0 %	40 %	40 %	387133964
99	NC_017311	CGACC	2	10	102421	102430	20 %	0 %	20 %	60 %	387133964
100	NC_017311	CCGCG	2	10	103347	103356	0 %	0 %	40 %	60 %	387133964
101	NC_017311	GACTG	2	10	107331	107340	20 %	20 %	40 %	20 %	387133967
102	NC_017311	CGGTG	2	10	109590	109599	0 %	20 %	60 %	20 %	387133968
103	NC_017311	GCGTG	2	10	110439	110448	0 %	20 %	60 %	20 %	387133968
104	NC_017311	TGCGC	2	10	111637	111646	0 %	20 %	40 %	40 %	387133970
105	NC_017311	GCCGT	2	10	114855	114864	0 %	20 %	40 %	40 %	387133971
106	NC_017311	CGATG	2	10	116026	116035	20 %	20 %	40 %	20 %	387133972
107	NC_017311	GGCCC	2	10	116848	116857	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017311	CCGGC	2	10	117047	117056	0 %	0 %	40 %	60 %	387133973
109	NC_017311	GCGCC	2	10	117467	117476	0 %	0 %	40 %	60 %	387133973
110	NC_017311	GCCAC	2	10	118022	118031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_017311	GCGCA	2	10	118516	118525	20 %	0 %	40 %	40 %	387133974
112	NC_017311	GCCCT	2	10	118859	118868	0 %	20 %	20 %	60 %	387133974
113	NC_017311	GCAAG	2	10	120350	120359	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017311	GGCAC	2	10	122505	122514	20 %	0 %	40 %	40 %	387133977
115	NC_017311	CCCGC	2	10	125241	125250	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
116	NC_017311	CGGCG	2	10	127607	127616	0 %	0 %	60 %	40 %	387133982
117	NC_017311	GTCAC	2	10	127988	127997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017311	CGCAC	2	10	128071	128080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017311	CCGTC	2	10	130363	130372	0 %	20 %	20 %	60 %	387133984
120	NC_017311	GCCAC	2	10	133726	133735	20 %	0 %	20 %	60 %	387133987
121	NC_017311	CGCGC	2	10	133946	133955	0 %	0 %	40 %	60 %	387133987
122	NC_017311	CCTGA	2	10	134613	134622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017311	CTGCG	2	10	136449	136458	0 %	20 %	40 %	40 %	387133989
124	NC_017311	GGGCC	2	10	137610	137619	0 %	0 %	60 %	40 %	387133991
125	NC_017311	GGCAC	2	10	137916	137925	20 %	0 %	40 %	40 %	387133992
126	NC_017311	CCGTC	2	10	138171	138180	0 %	20 %	20 %	60 %	387133993
127	NC_017311	CCCTG	2	10	138873	138882	0 %	20 %	20 %	60 %	387133993
128	NC_017311	GCCGC	2	10	143349	143358	0 %	0 %	40 %	60 %	387133999
129	NC_017311	ACGCC	2	10	143675	143684	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017311	GCCAC	2	10	145934	145943	20 %	0 %	20 %	60 %	387134001
131	NC_017311	CGGCA	2	10	146852	146861	20 %	0 %	40 %	40 %	387134001
132	NC_017311	CCCCG	2	10	147341	147350	0 %	0 %	20 %	80 %	387134001
133	NC_017311	TCGCC	2	10	149843	149852	0 %	20 %	20 %	60 %	387134006
134	NC_017311	TCCTC	2	10	151492	151501	0 %	40 %	0 %	60 %	387134008
135	NC_017311	GCACC	2	10	152118	152127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017311	CGGCA	2	10	155334	155343	20 %	0 %	40 %	40 %	387134012
137	NC_017311	ACGCC	2	10	155699	155708	20 %	0 %	20 %	60 %	387134012
138	NC_017311	AACGC	2	10	156487	156496	40 %	0 %	20 %	40 %	387134013
139	NC_017311	CCGGC	2	10	158285	158294	0 %	0 %	40 %	60 %	387134016
140	NC_017311	GCGAT	2	10	159345	159354	20 %	20 %	40 %	20 %	387134017
141	NC_017311	GCCCA	2	10	160354	160363	20 %	0 %	20 %	60 %	387134018
142	NC_017311	GCAGC	2	10	161826	161835	20 %	0 %	40 %	40 %	387134018
143	NC_017311	GGCAT	2	10	162088	162097	20 %	20 %	40 %	20 %	387134018
144	NC_017311	ACGCA	2	10	162392	162401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017311	GGCGG	2	10	162404	162413	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017311	CTCCC	2	10	163363	163372	0 %	20 %	0 %	80 %	387134019
147	NC_017311	GGACA	2	10	163597	163606	40 %	0 %	40 %	20 %	387134019
148	NC_017311	TGCCG	2	10	164237	164246	0 %	20 %	40 %	40 %	387134019
149	NC_017311	TGTCG	2	10	164247	164256	0 %	40 %	40 %	20 %	387134019
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151	NC_017311	TGGTC	2	10	167570	167579	0 %	40 %	40 %	20 %	387134022
152	NC_017311	GGCTT	2	10	169140	169149	0 %	40 %	40 %	20 %	387134024
153	NC_017311	TGCAC	2	10	170953	170962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_017311	GCAGC	2	10	174223	174232	20 %	0 %	40 %	40 %	387134028
155	NC_017311	CGCGC	2	10	174915	174924	0 %	0 %	40 %	60 %	387134028
156	NC_017311	CAGCC	2	10	174959	174968	20 %	0 %	20 %	60 %	387134028
157	NC_017311	ATTTG	2	10	176233	176242	20 %	60 %	20 %	0 %	387134029
158	NC_017311	GCCGT	2	10	176409	176418	0 %	20 %	40 %	40 %	387134029
159	NC_017311	TGCCC	2	10	177100	177109	0 %	20 %	20 %	60 %	387134029
160	NC_017311	TACCG	2	10	178061	178070	20 %	20 %	20 %	40 %	387134029
161	NC_017311	CGCAG	2	10	179467	179476	20 %	0 %	40 %	40 %	387134030
162	NC_017311	CGGCA	2	10	179514	179523	20 %	0 %	40 %	40 %	387134030
163	NC_017311	TGGCG	2	10	181849	181858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017311	GCGCC	2	10	182552	182561	0 %	0 %	40 %	60 %	387134031
165	NC_017311	CCGCC	2	10	183149	183158	0 %	0 %	20 %	80 %	387134031
166	NC_017311	CATGG	2	10	188187	188196	20 %	20 %	40 %	20 %	387134034
167	NC_017311	AGGCA	2	10	188783	188792	40 %	0 %	40 %	20 %	387134034
168	NC_017311	GGCAG	2	10	188811	188820	20 %	0 %	60 %	20 %	387134034
169	NC_017311	CGCGC	2	10	189271	189280	0 %	0 %	40 %	60 %	387134034
170	NC_017311	CCCCG	2	10	189809	189818	0 %	0 %	20 %	80 %	387134034
171	NC_017311	CCCGC	3	15	190439	190453	0 %	0 %	20 %	80 %	387134034
172	NC_017311	GTGCC	2	10	191307	191316	0 %	20 %	40 %	40 %	387134035
173	NC_017311	CGCGG	2	10	192169	192178	0 %	0 %	60 %	40 %	387134035
174	NC_017311	ACGGC	2	10	192342	192351	20 %	0 %	40 %	40 %	387134035
175	NC_017311	CTGCG	2	10	195880	195889	0 %	20 %	40 %	40 %	387134038
176	NC_017311	GGTGG	2	10	197765	197774	0 %	20 %	80 %	0 %	387134039
177	NC_017311	CACGA	2	10	200326	200335	40 %	0 %	20 %	40 %	387134040
178	NC_017311	TCACG	2	10	200569	200578	20 %	20 %	20 %	40 %	387134040
179	NC_017311	GCACG	2	10	201093	201102	20 %	0 %	40 %	40 %	387134040
180	NC_017311	GACAG	2	10	202174	202183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_017311	TGGGT	2	10	202259	202268	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.