MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017311	CTGTC	2	10	8498	8507	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017311	CTGTC	2	10	8512	8521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017311	GGCGT	2	10	8738	8747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017311	GTGCG	2	10	14304	14313	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017311	GGGGC	2	10	14727	14736	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017311	GGGCG	2	10	15012	15021	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017311	GGTGC	2	10	20904	20913	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017311	TGGCG	2	10	20993	21002	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017311	ATAGT	2	10	25870	25879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017311	TGCCG	2	10	27152	27161	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017311	ACGCC	2	10	27575	27584	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017311	GGCAG	2	10	28711	28720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017311	GTGTG	2	10	29067	29076	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017311	GCCTC	2	10	31555	31564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017311	CCCGT	2	10	35703	35712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017311	GGGGA	2	10	46510	46519	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017311	CGGCA	2	10	75657	75666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017311	GGGAA	2	10	75697	75706	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017311	TGACG	2	10	79491	79500	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017311	GTGCA	2	10	99745	99754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017311	GGCCC	2	10	116848	116857	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017311	GCCAC	2	10	118022	118031	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017311	GCAAG	2	10	120350	120359	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017311	CCCGC	2	10	125241	125250	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_017311	GTCAC	2	10	127988	127997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017311	CGCAC	2	10	128071	128080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017311	CCTGA	2	10	134613	134622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017311	ACGCC	2	10	143675	143684	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017311	GCACC	2	10	152118	152127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017311	ACGCA	2	10	162392	162401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017311	GGCGG	2	10	162404	162413	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017311	TGCAC	2	10	170953	170962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017311	TGGCG	2	10	181849	181858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017311	GACAG	2	10	202174	202183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017311	TGGGT	2	10	202259	202268	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.