MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017311	AGAT	2	8	7	14	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017311	AGAA	2	8	15	22	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017311	TCTA	2	8	26	33	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017311	GGCT	2	8	412	419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017311	CCGG	2	8	608	615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017311	GGGC	2	8	1017	1024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017311	GGCA	2	8	3394	3401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017311	CGTC	2	8	3424	3431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017311	CCTT	2	8	8407	8414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017311	GTCT	2	8	8426	8433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017311	CCCG	2	8	8560	8567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017311	CCGT	2	8	8587	8594	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017311	TCCG	2	8	8809	8816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017311	TCCG	2	8	8830	8837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017311	GGGC	2	8	9298	9305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017311	GTGC	2	8	14711	14718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017311	GCAG	2	8	16423	16430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017311	CGGG	2	8	16494	16501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017311	TCGT	2	8	16535	16542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017311	GGCG	2	8	16895	16902	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017311	TTTG	2	8	17302	17309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017311	TGAT	2	8	19814	19821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017311	GGGT	2	8	21161	21168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017311	GTTG	2	8	27050	27057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017311	TGCA	2	8	28775	28782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017311	GCAG	2	8	28890	28897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017311	GCGG	2	8	29129	29136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017311	GGCC	2	8	29236	29243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017311	CCGT	2	8	35683	35690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017311	CGGA	2	8	44971	44978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017311	GCAC	2	8	45095	45102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017311	CGGA	2	8	68937	68944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017311	GGAG	2	8	79611	79618	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017311	CGGG	2	8	81354	81361	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017311	AGAT	2	8	81479	81486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017311	GCAA	2	8	81592	81599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017311	GTGC	2	8	84894	84901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017311	GCGG	2	8	92335	92342	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017311	CAGC	2	8	92355	92362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017311	TTCA	2	8	99688	99695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017311	GCTT	2	8	99780	99787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017311	CCGA	2	8	105390	105397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017311	ATTT	2	8	105565	105572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017311	GCCC	2	8	105862	105869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017311	GGCG	2	8	115702	115709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017311	CCTG	2	8	116861	116868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017311	GCAC	2	8	116954	116961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017311	GGCA	2	8	116975	116982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017311	GCAT	2	8	120360	120367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017311	ACCG	2	8	123545	123552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017311	GACA	2	8	125145	125152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017311	TGGC	2	8	128046	128053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017311	GGCG	2	8	134636	134643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017311	CTGC	2	8	134858	134865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017311	ATCT	2	8	139241	139248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017311	CGCC	2	8	139288	139295	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_017311	CCAG	2	8	140224	140231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017311	CCCG	2	8	148116	148123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017311	CGAG	2	8	149511	149518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017311	CGCC	2	8	151930	151937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017311	CACG	2	8	159227	159234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017311	CGCA	2	8	159839	159846	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017311	ATTC	2	8	162632	162639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017311	AATC	2	8	170638	170645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017311	CGAC	2	8	171153	171160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017311	CGGG	2	8	172138	172145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017311	CTTT	2	8	178403	178410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017311	GATG	2	8	178635	178642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017311	ATCC	2	8	178696	178703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017311	GCCT	2	8	178774	178781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017311	CAGG	2	8	178909	178916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017311	CGGG	2	8	179165	179172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017311	CGCC	2	8	181034	181041	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_017311	CGCC	2	8	181182	181189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_017311	GCCC	2	8	181753	181760	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017311	CGGG	2	8	181927	181934	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017311	TGGC	2	8	186465	186472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017311	ACGG	2	8	186669	186676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017311	AGAC	2	8	186828	186835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017311	CCGA	2	8	186868	186875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017311	CGGG	2	8	193005	193012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017311	TCCC	2	8	194232	194239	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017311	AGCC	2	8	196427	196434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017311	CCCT	2	8	196586	196593	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017311	TGCC	2	8	197050	197057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017311	GCTG	2	8	197245	197252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017311	CCCG	2	8	197428	197435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017311	CAGG	2	8	202046	202053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.