MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017311	AC	3	6	469	474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017311	GC	3	6	909	914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017311	GC	3	6	1596	1601	0 %	0 %	50 %	50 %	387133888
4	NC_017311	GC	3	6	1802	1807	0 %	0 %	50 %	50 %	387133888
5	NC_017311	CG	3	6	1889	1894	0 %	0 %	50 %	50 %	387133888
6	NC_017311	CT	3	6	2379	2384	0 %	50 %	0 %	50 %	387133889
7	NC_017311	GC	3	6	2523	2528	0 %	0 %	50 %	50 %	387133889
8	NC_017311	GC	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	387133890
9	NC_017311	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	387133890
10	NC_017311	CG	3	6	5182	5187	0 %	0 %	50 %	50 %	387133891
11	NC_017311	CG	3	6	5327	5332	0 %	0 %	50 %	50 %	387133891
12	NC_017311	CG	3	6	5618	5623	0 %	0 %	50 %	50 %	387133891
13	NC_017311	CG	4	8	9040	9047	0 %	0 %	50 %	50 %	387133893
14	NC_017311	GC	3	6	9628	9633	0 %	0 %	50 %	50 %	387133894
15	NC_017311	TG	3	6	10063	10068	0 %	50 %	50 %	0 %	387133894
16	NC_017311	GT	3	6	10432	10437	0 %	50 %	50 %	0 %	387133894
17	NC_017311	GT	3	6	10727	10732	0 %	50 %	50 %	0 %	387133894
18	NC_017311	GC	3	6	11439	11444	0 %	0 %	50 %	50 %	387133895
19	NC_017311	TC	3	6	12454	12459	0 %	50 %	0 %	50 %	387133896
20	NC_017311	GC	3	6	12719	12724	0 %	0 %	50 %	50 %	387133896
21	NC_017311	GC	4	8	12917	12924	0 %	0 %	50 %	50 %	387133897
22	NC_017311	GC	3	6	13608	13613	0 %	0 %	50 %	50 %	387133898
23	NC_017311	CG	3	6	13627	13632	0 %	0 %	50 %	50 %	387133898
24	NC_017311	CA	3	6	14641	14646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017311	CG	3	6	14705	14710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017311	GT	3	6	14876	14881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017311	GC	3	6	15537	15542	0 %	0 %	50 %	50 %	387133899
28	NC_017311	GC	3	6	15621	15626	0 %	0 %	50 %	50 %	387133899
29	NC_017311	GA	3	6	15999	16004	50 %	0 %	50 %	0 %	387133899
30	NC_017311	CG	3	6	16619	16624	0 %	0 %	50 %	50 %	387133900
31	NC_017311	CT	3	6	16719	16724	0 %	50 %	0 %	50 %	387133900
32	NC_017311	GA	3	6	17032	17037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017311	CA	3	6	18198	18203	50 %	0 %	0 %	50 %	387133901
34	NC_017311	GT	3	6	19033	19038	0 %	50 %	50 %	0 %	387133902
35	NC_017311	GC	3	6	19119	19124	0 %	0 %	50 %	50 %	387133902
36	NC_017311	CA	4	8	20420	20427	50 %	0 %	0 %	50 %	387133903
37	NC_017311	CG	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	387133903
38	NC_017311	GT	3	6	20836	20841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017311	AG	3	6	21045	21050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017311	GC	3	6	21399	21404	0 %	0 %	50 %	50 %	387133904
41	NC_017311	GC	3	6	21573	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	387133904
42	NC_017311	CG	3	6	21763	21768	0 %	0 %	50 %	50 %	387133904
43	NC_017311	GC	4	8	22466	22473	0 %	0 %	50 %	50 %	387133905
44	NC_017311	GA	3	6	22850	22855	50 %	0 %	50 %	0 %	387133905
45	NC_017311	TC	3	6	22884	22889	0 %	50 %	0 %	50 %	387133905
46	NC_017311	GC	3	6	23294	23299	0 %	0 %	50 %	50 %	387133906
47	NC_017311	GC	3	6	23515	23520	0 %	0 %	50 %	50 %	387133906
48	NC_017311	GC	3	6	23713	23718	0 %	0 %	50 %	50 %	387133906
49	NC_017311	GC	3	6	24608	24613	0 %	0 %	50 %	50 %	387133907
50	NC_017311	GC	3	6	25482	25487	0 %	0 %	50 %	50 %	387133907
51	NC_017311	TG	3	6	25593	25598	0 %	50 %	50 %	0 %	387133907
52	NC_017311	CG	3	6	25670	25675	0 %	0 %	50 %	50 %	387133907
53	NC_017311	TA	3	6	26084	26089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017311	GC	3	6	27145	27150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017311	GC	3	6	27493	27498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017311	GC	3	6	27706	27711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017311	GC	3	6	28931	28936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017311	GC	3	6	29290	29295	0 %	0 %	50 %	50 %	387133911
59	NC_017311	TG	3	6	29575	29580	0 %	50 %	50 %	0 %	387133911
60	NC_017311	GT	3	6	30198	30203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017311	AG	3	6	31108	31113	50 %	0 %	50 %	0 %	387133912
62	NC_017311	AT	4	8	31212	31219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017311	GT	3	6	31224	31229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017311	CG	3	6	32099	32104	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
65	NC_017311	GC	3	6	32582	32587	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
66	NC_017311	GC	3	6	33445	33450	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
67	NC_017311	GC	3	6	33722	33727	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
68	NC_017311	CG	3	6	33859	33864	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
69	NC_017311	CG	3	6	33944	33949	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
70	NC_017311	GC	3	6	34402	34407	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
71	NC_017311	GC	3	6	34434	34439	0 %	0 %	50 %	50 %	387133914
72	NC_017311	AC	3	6	35086	35091	50 %	0 %	0 %	50 %	387133915
73	NC_017311	GC	4	8	36321	36328	0 %	0 %	50 %	50 %	387133916
74	NC_017311	GC	3	6	36419	36424	0 %	0 %	50 %	50 %	387133916
75	NC_017311	GC	3	6	37713	37718	0 %	0 %	50 %	50 %	387133916
76	NC_017311	GC	4	8	38355	38362	0 %	0 %	50 %	50 %	387133916
77	NC_017311	GC	3	6	38468	38473	0 %	0 %	50 %	50 %	387133916
78	NC_017311	CG	3	6	39987	39992	0 %	0 %	50 %	50 %	387133917
79	NC_017311	CG	3	6	40915	40920	0 %	0 %	50 %	50 %	387133918
80	NC_017311	GC	3	6	41865	41870	0 %	0 %	50 %	50 %	387133919
81	NC_017311	CG	3	6	42357	42362	0 %	0 %	50 %	50 %	387133919
82	NC_017311	GC	3	6	43144	43149	0 %	0 %	50 %	50 %	387133920
83	NC_017311	CG	3	6	43452	43457	0 %	0 %	50 %	50 %	387133920
84	NC_017311	CG	3	6	44266	44271	0 %	0 %	50 %	50 %	387133921
85	NC_017311	GA	3	6	45034	45039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017311	CG	3	6	45547	45552	0 %	0 %	50 %	50 %	387133922
87	NC_017311	CG	3	6	46618	46623	0 %	0 %	50 %	50 %	387133923
88	NC_017311	CG	3	6	46876	46881	0 %	0 %	50 %	50 %	387133923
89	NC_017311	CG	3	6	48204	48209	0 %	0 %	50 %	50 %	387133924
90	NC_017311	GC	4	8	48243	48250	0 %	0 %	50 %	50 %	387133924
91	NC_017311	GC	4	8	49486	49493	0 %	0 %	50 %	50 %	387133925
92	NC_017311	TG	3	6	49588	49593	0 %	50 %	50 %	0 %	387133925
93	NC_017311	GA	3	6	49898	49903	50 %	0 %	50 %	0 %	387133925
94	NC_017311	CG	3	6	50728	50733	0 %	0 %	50 %	50 %	387133926
95	NC_017311	GC	3	6	51324	51329	0 %	0 %	50 %	50 %	387133926
96	NC_017311	GC	3	6	51576	51581	0 %	0 %	50 %	50 %	387133927
97	NC_017311	GC	3	6	51629	51634	0 %	0 %	50 %	50 %	387133927
98	NC_017311	CG	3	6	51917	51922	0 %	0 %	50 %	50 %	387133927
99	NC_017311	GC	3	6	52107	52112	0 %	0 %	50 %	50 %	387133927
100	NC_017311	GC	4	8	52293	52300	0 %	0 %	50 %	50 %	387133927
101	NC_017311	CG	4	8	52865	52872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017311	GC	3	6	53150	53155	0 %	0 %	50 %	50 %	387133928
103	NC_017311	CG	3	6	53479	53484	0 %	0 %	50 %	50 %	387133928
104	NC_017311	CG	3	6	53991	53996	0 %	0 %	50 %	50 %	387133928
105	NC_017311	CG	3	6	54977	54982	0 %	0 %	50 %	50 %	387133929
106	NC_017311	CG	3	6	55607	55612	0 %	0 %	50 %	50 %	387133929
107	NC_017311	CG	3	6	55968	55973	0 %	0 %	50 %	50 %	387133930
108	NC_017311	TC	3	6	56074	56079	0 %	50 %	0 %	50 %	387133930
109	NC_017311	CG	3	6	57066	57071	0 %	0 %	50 %	50 %	387133931
110	NC_017311	GA	3	6	57195	57200	50 %	0 %	50 %	0 %	387133931
111	NC_017311	GC	3	6	57841	57846	0 %	0 %	50 %	50 %	387133931
112	NC_017311	CG	3	6	58068	58073	0 %	0 %	50 %	50 %	387133931
113	NC_017311	GC	3	6	58316	58321	0 %	0 %	50 %	50 %	387133931
114	NC_017311	CG	3	6	58922	58927	0 %	0 %	50 %	50 %	387133932
115	NC_017311	GC	3	6	58929	58934	0 %	0 %	50 %	50 %	387133932
116	NC_017311	GC	3	6	60501	60506	0 %	0 %	50 %	50 %	387133935
117	NC_017311	GC	3	6	60771	60776	0 %	0 %	50 %	50 %	387133935
118	NC_017311	GC	4	8	61280	61287	0 %	0 %	50 %	50 %	387133935
119	NC_017311	CG	3	6	61815	61820	0 %	0 %	50 %	50 %	387133936
120	NC_017311	GC	4	8	62558	62565	0 %	0 %	50 %	50 %	387133937
121	NC_017311	CG	3	6	63097	63102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017311	CG	3	6	63189	63194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017311	GC	3	6	64150	64155	0 %	0 %	50 %	50 %	387133938
124	NC_017311	GC	3	6	64294	64299	0 %	0 %	50 %	50 %	387133938
125	NC_017311	GC	3	6	64534	64539	0 %	0 %	50 %	50 %	387133938
126	NC_017311	TC	3	6	64947	64952	0 %	50 %	0 %	50 %	387133939
127	NC_017311	GC	4	8	65331	65338	0 %	0 %	50 %	50 %	387133939
128	NC_017311	CG	3	6	66427	66432	0 %	0 %	50 %	50 %	387133939
129	NC_017311	CG	3	6	67529	67534	0 %	0 %	50 %	50 %	387133940
130	NC_017311	GC	3	6	67642	67647	0 %	0 %	50 %	50 %	387133940
131	NC_017311	CG	3	6	68025	68030	0 %	0 %	50 %	50 %	387133940
132	NC_017311	GC	3	6	68805	68810	0 %	0 %	50 %	50 %	387133940
133	NC_017311	GC	3	6	69520	69525	0 %	0 %	50 %	50 %	387133941
134	NC_017311	GC	3	6	70726	70731	0 %	0 %	50 %	50 %	387133942
135	NC_017311	GC	3	6	70806	70811	0 %	0 %	50 %	50 %	387133942
136	NC_017311	GC	3	6	71780	71785	0 %	0 %	50 %	50 %	387133943
137	NC_017311	CG	3	6	71807	71812	0 %	0 %	50 %	50 %	387133943
138	NC_017311	GC	3	6	72101	72106	0 %	0 %	50 %	50 %	387133943
139	NC_017311	GT	3	6	72720	72725	0 %	50 %	50 %	0 %	387133943
140	NC_017311	GC	3	6	73478	73483	0 %	0 %	50 %	50 %	387133944
141	NC_017311	GC	3	6	73586	73591	0 %	0 %	50 %	50 %	387133944
142	NC_017311	TC	3	6	74118	74123	0 %	50 %	0 %	50 %	387133944
143	NC_017311	CG	4	8	75374	75381	0 %	0 %	50 %	50 %	387133945
144	NC_017311	GC	3	6	75580	75585	0 %	0 %	50 %	50 %	387133945
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.