MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 2294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017310	TGCGC	2	10	705	714	0 %	20 %	40 %	40 %	387151874
2	NC_017310	ATCAA	2	10	990	999	60 %	20 %	0 %	20 %	387151874
3	NC_017310	ACAGA	2	10	2405	2414	60 %	0 %	20 %	20 %	387151876
4	NC_017310	CAGGA	2	10	3792	3801	40 %	0 %	40 %	20 %	387151878
5	NC_017310	GCCCA	2	10	4425	4434	20 %	0 %	20 %	60 %	387151879
6	NC_017310	CCCGG	2	10	4527	4536	0 %	0 %	40 %	60 %	387151879
7	NC_017310	CGCCT	2	10	6957	6966	0 %	20 %	20 %	60 %	387151881
8	NC_017310	CACGC	2	10	7179	7188	20 %	0 %	20 %	60 %	387151881
9	NC_017310	TGCGG	2	10	8220	8229	0 %	20 %	60 %	20 %	387151882
10	NC_017310	CCCAT	2	10	10368	10377	20 %	20 %	0 %	60 %	387151883
11	NC_017310	CTGCG	2	10	10768	10777	0 %	20 %	40 %	40 %	387151884
12	NC_017310	CGCGG	2	10	12564	12573	0 %	0 %	60 %	40 %	387151885
13	NC_017310	CGAGA	2	10	12580	12589	40 %	0 %	40 %	20 %	387151885
14	NC_017310	GCCGC	2	10	17950	17959	0 %	0 %	40 %	60 %	387151888
15	NC_017310	AGGGC	2	10	18323	18332	20 %	0 %	60 %	20 %	387151888
16	NC_017310	CCGCC	2	10	18335	18344	0 %	0 %	20 %	80 %	387151888
17	NC_017310	CGTAT	2	10	20250	20259	20 %	40 %	20 %	20 %	387151890
18	NC_017310	TGCCG	2	10	22414	22423	0 %	20 %	40 %	40 %	387151893
19	NC_017310	AGGGG	2	10	22458	22467	20 %	0 %	80 %	0 %	387151893
20	NC_017310	ACCGA	2	10	23931	23940	40 %	0 %	20 %	40 %	387151894
21	NC_017310	TCGAT	2	10	23989	23998	20 %	40 %	20 %	20 %	387151894
22	NC_017310	GCGCC	2	10	24300	24309	0 %	0 %	40 %	60 %	387151894
23	NC_017310	GTGCC	2	10	26973	26982	0 %	20 %	40 %	40 %	387151896
24	NC_017310	GCCCG	2	10	27119	27128	0 %	0 %	40 %	60 %	387151896
25	NC_017310	CACTG	2	10	29761	29770	20 %	20 %	20 %	40 %	387151897
26	NC_017310	CCGGC	2	10	30844	30853	0 %	0 %	40 %	60 %	387151898
27	NC_017310	CGCGT	2	10	31430	31439	0 %	20 %	40 %	40 %	387151898
28	NC_017310	ACGTG	2	10	32680	32689	20 %	20 %	40 %	20 %	387151899
29	NC_017310	CGAAC	2	10	32692	32701	40 %	0 %	20 %	40 %	387151899
30	NC_017310	CACGC	2	10	32985	32994	20 %	0 %	20 %	60 %	387151899
31	NC_017310	GTGGG	2	10	33856	33865	0 %	20 %	80 %	0 %	387151900
32	NC_017310	ACCCG	2	10	34976	34985	20 %	0 %	20 %	60 %	387151901
33	NC_017310	AAGGC	2	10	35032	35041	40 %	0 %	40 %	20 %	387151901
34	NC_017310	GCACG	2	10	37983	37992	20 %	0 %	40 %	40 %	387151902
35	NC_017310	CCGTG	2	10	38612	38621	0 %	20 %	40 %	40 %	387151903
36	NC_017310	GCAAC	2	10	39503	39512	40 %	0 %	20 %	40 %	387151903
37	NC_017310	ACGGA	2	10	42596	42605	40 %	0 %	40 %	20 %	387151906
38	NC_017310	GGGCA	2	10	47571	47580	20 %	0 %	60 %	20 %	387151909
39	NC_017310	GTCGC	2	10	48785	48794	0 %	20 %	40 %	40 %	387151909
40	NC_017310	CGGAA	2	10	49760	49769	40 %	0 %	40 %	20 %	387151909
41	NC_017310	GGGAA	2	10	51532	51541	40 %	0 %	60 %	0 %	387151912
42	NC_017310	TGCCA	2	10	55133	55142	20 %	20 %	20 %	40 %	387151914
43	NC_017310	CGTGA	2	10	55186	55195	20 %	20 %	40 %	20 %	387151914
44	NC_017310	GGGGT	2	10	55962	55971	0 %	20 %	80 %	0 %	387151915
45	NC_017310	GAAGT	2	10	56102	56111	40 %	20 %	40 %	0 %	387151915
46	NC_017310	GCAGG	2	10	57635	57644	20 %	0 %	60 %	20 %	387151916
47	NC_017310	TTCGG	2	10	58603	58612	0 %	40 %	40 %	20 %	387151917
48	NC_017310	GGAAG	2	10	62537	62546	40 %	0 %	60 %	0 %	387151920
49	NC_017310	GCCCC	2	10	62645	62654	0 %	0 %	20 %	80 %	387151920
50	NC_017310	CTGGG	2	10	62706	62715	0 %	20 %	60 %	20 %	387151920
51	NC_017310	TGCCC	2	10	65732	65741	0 %	20 %	20 %	60 %	387151922
52	NC_017310	CACGC	2	10	68375	68384	20 %	0 %	20 %	60 %	387151923
53	NC_017310	AGTGA	2	10	71493	71502	40 %	20 %	40 %	0 %	387151925
54	NC_017310	CGGTG	2	10	71614	71623	0 %	20 %	60 %	20 %	387151925
55	NC_017310	CCATG	2	10	73287	73296	20 %	20 %	20 %	40 %	387151927
56	NC_017310	AGGGC	2	10	74632	74641	20 %	0 %	60 %	20 %	387151927
57	NC_017310	CGCGG	2	10	77524	77533	0 %	0 %	60 %	40 %	387151929
58	NC_017310	GACGG	2	10	80216	80225	20 %	0 %	60 %	20 %	387151932
59	NC_017310	GGGCA	2	10	80238	80247	20 %	0 %	60 %	20 %	387151932
60	NC_017310	ACCGT	2	10	81726	81735	20 %	20 %	20 %	40 %	387151934
61	NC_017310	GGAAG	2	10	84313	84322	40 %	0 %	60 %	0 %	387151937
62	NC_017310	TGCCT	2	10	86372	86381	0 %	40 %	20 %	40 %	387151939
63	NC_017310	CACGG	2	10	86393	86402	20 %	0 %	40 %	40 %	387151939
64	NC_017310	CGGTG	2	10	86860	86869	0 %	20 %	60 %	20 %	387151939
65	NC_017310	GGTCG	2	10	87115	87124	0 %	20 %	60 %	20 %	387151939
66	NC_017310	GCGCC	2	10	87914	87923	0 %	0 %	40 %	60 %	387151940
67	NC_017310	GCATC	2	10	88022	88031	20 %	20 %	20 %	40 %	387151940
68	NC_017310	GACGG	2	10	88208	88217	20 %	0 %	60 %	20 %	387151940
69	NC_017310	TTCCC	2	10	88780	88789	0 %	40 %	0 %	60 %	387151941
70	NC_017310	CTGCG	2	10	89386	89395	0 %	20 %	40 %	40 %	387151942
71	NC_017310	TGCCA	2	10	89591	89600	20 %	20 %	20 %	40 %	387151942
72	NC_017310	GCAGG	2	10	91448	91457	20 %	0 %	60 %	20 %	387151943
73	NC_017310	CGTTG	2	10	93958	93967	0 %	40 %	40 %	20 %	387151946
74	NC_017310	CGGGG	2	10	94312	94321	0 %	0 %	80 %	20 %	387151947
75	NC_017310	CCTGT	2	10	95429	95438	0 %	40 %	20 %	40 %	387151949
76	NC_017310	CGGGG	2	10	96139	96148	0 %	0 %	80 %	20 %	387151950
77	NC_017310	GCCGT	2	10	96927	96936	0 %	20 %	40 %	40 %	387151950
78	NC_017310	GGCGT	2	10	96966	96975	0 %	20 %	60 %	20 %	387151951
79	NC_017310	CGCAG	2	10	97331	97340	20 %	0 %	40 %	40 %	387151951
80	NC_017310	CGGCG	2	10	98638	98647	0 %	0 %	60 %	40 %	387151952
81	NC_017310	GGGCC	2	10	99174	99183	0 %	0 %	60 %	40 %	387151953
82	NC_017310	CGCAC	3	15	100009	100023	20 %	0 %	20 %	60 %	387151954
83	NC_017310	ACGGG	2	10	100058	100067	20 %	0 %	60 %	20 %	387151954
84	NC_017310	GCGGG	2	10	102859	102868	0 %	0 %	80 %	20 %	387151955
85	NC_017310	GCCGG	2	10	104071	104080	0 %	0 %	60 %	40 %	387151956
86	NC_017310	TTCGG	2	10	104163	104172	0 %	40 %	40 %	20 %	387151956
87	NC_017310	GACGC	2	10	104556	104565	20 %	0 %	40 %	40 %	387151956
88	NC_017310	TCTCG	2	10	105357	105366	0 %	40 %	20 %	40 %	387151957
89	NC_017310	TTCTC	2	10	105449	105458	0 %	60 %	0 %	40 %	387151957
90	NC_017310	GAGGC	2	10	106470	106479	20 %	0 %	60 %	20 %	387151958
91	NC_017310	CATGC	2	10	107757	107766	20 %	20 %	20 %	40 %	387151960
92	NC_017310	GTGCG	2	10	108151	108160	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
93	NC_017310	GCGAC	2	10	108439	108448	20 %	0 %	40 %	40 %	387151960
94	NC_017310	CGCGC	2	10	108449	108458	0 %	0 %	40 %	60 %	387151960
95	NC_017310	TCGGT	2	10	109693	109702	0 %	40 %	40 %	20 %	387151960
96	NC_017310	TGGGC	2	10	109754	109763	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
97	NC_017310	CGGGC	2	10	110017	110026	0 %	0 %	60 %	40 %	387151960
98	NC_017310	GACCA	2	10	112300	112309	40 %	0 %	20 %	40 %	387151961
99	NC_017310	GCCGC	2	10	112879	112888	0 %	0 %	40 %	60 %	387151962
100	NC_017310	CTCGC	2	10	115081	115090	0 %	20 %	20 %	60 %	387151962
101	NC_017310	TCGGC	2	10	115262	115271	0 %	20 %	40 %	40 %	387151962
102	NC_017310	CGGCG	2	10	120173	120182	0 %	0 %	60 %	40 %	387151967
103	NC_017310	GCCGT	2	10	120822	120831	0 %	20 %	40 %	40 %	387151968
104	NC_017310	GTGCC	2	10	123693	123702	0 %	20 %	40 %	40 %	387151970
105	NC_017310	GCGGT	2	10	124579	124588	0 %	20 %	60 %	20 %	387151970
106	NC_017310	CAGTC	2	10	126515	126524	20 %	20 %	20 %	40 %	387151970
107	NC_017310	CCTCG	2	10	127909	127918	0 %	20 %	20 %	60 %	387151971
108	NC_017310	TGCCG	2	10	128456	128465	0 %	20 %	40 %	40 %	387151971
109	NC_017310	GTGCA	2	10	128469	128478	20 %	20 %	40 %	20 %	387151971
110	NC_017310	AGCGA	2	10	128655	128664	40 %	0 %	40 %	20 %	387151971
111	NC_017310	GCTGT	2	10	132752	132761	0 %	40 %	40 %	20 %	387151974
112	NC_017310	AGTGA	2	10	133817	133826	40 %	20 %	40 %	0 %	387151976
113	NC_017310	TGGCG	2	10	136892	136901	0 %	20 %	60 %	20 %	387151978
114	NC_017310	ACGGA	2	10	139067	139076	40 %	0 %	40 %	20 %	387151981
115	NC_017310	CATCG	2	10	140572	140581	20 %	20 %	20 %	40 %	387151982
116	NC_017310	GCGTG	2	10	141491	141500	0 %	20 %	60 %	20 %	387151982
117	NC_017310	ACGGC	2	10	141701	141710	20 %	0 %	40 %	40 %	387151982
118	NC_017310	ATGGA	2	10	143672	143681	40 %	20 %	40 %	0 %	387151983
119	NC_017310	GTGCC	2	10	145088	145097	0 %	20 %	40 %	40 %	387151985
120	NC_017310	CCATG	2	10	147215	147224	20 %	20 %	20 %	40 %	387151986
121	NC_017310	GTGCA	2	10	159354	159363	20 %	20 %	40 %	20 %	387151992
122	NC_017310	CATGG	2	10	164703	164712	20 %	20 %	40 %	20 %	387151993
123	NC_017310	TGCGG	2	10	164983	164992	0 %	20 %	60 %	20 %	387151993
124	NC_017310	CACCC	2	10	165681	165690	20 %	0 %	0 %	80 %	387151994
125	NC_017310	CGCAG	2	10	166610	166619	20 %	0 %	40 %	40 %	387151994
126	NC_017310	CCACG	2	10	169520	169529	20 %	0 %	20 %	60 %	387151997
127	NC_017310	GCGCC	2	10	170048	170057	0 %	0 %	40 %	60 %	387151997
128	NC_017310	TTGCC	2	10	172180	172189	0 %	40 %	20 %	40 %	387151999
129	NC_017310	GGTGA	2	10	172348	172357	20 %	20 %	60 %	0 %	387151999
130	NC_017310	TGTCG	2	10	172481	172490	0 %	40 %	40 %	20 %	387151999
131	NC_017310	TGCCC	2	10	172649	172658	0 %	20 %	20 %	60 %	387151999
132	NC_017310	GGGCA	2	10	174204	174213	20 %	0 %	60 %	20 %	387152000
133	NC_017310	GGTGA	2	10	174296	174305	20 %	20 %	60 %	0 %	387152000
134	NC_017310	GGCGC	2	10	178878	178887	0 %	0 %	60 %	40 %	387152003
135	NC_017310	GTTCT	2	10	179029	179038	0 %	60 %	20 %	20 %	387152003
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391	NC_017310	GCGAT	2	10	588168	588177	20 %	20 %	40 %	20 %	387152339
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