MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 6421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017310	TAG	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017310	CGA	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017310	CAC	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017310	AGC	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017310	GGT	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017310	CAG	2	6	5631	5636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017310	CGT	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017310	CAC	2	6	8511	8516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017310	CGG	2	6	8561	8566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017310	GGC	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017310	GCC	2	6	8647	8652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017310	CGC	2	6	11780	11785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017310	GTC	2	6	11799	11804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017310	TTG	2	6	12699	12704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017310	GCA	2	6	12732	12737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017310	GCC	2	6	12777	12782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017310	ACG	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017310	GGC	2	6	12870	12875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017310	CGG	2	6	12950	12955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017310	AGG	2	6	12985	12990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017310	ACG	2	6	12996	13001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017310	TGC	2	6	13017	13022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017310	TGC	2	6	15619	15624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017310	CAA	2	6	15651	15656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017310	GAT	2	6	15691	15696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017310	GGC	2	6	15739	15744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017310	TGC	2	6	15922	15927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017310	CGT	2	6	15955	15960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017310	CGC	2	6	15980	15985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017310	CGG	2	6	19395	19400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017310	TCA	2	6	19492	19497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017310	GAC	2	6	22203	22208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017310	CAG	2	6	22287	22292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017310	GAA	2	6	22300	22305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017310	CGC	3	9	22336	22344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017310	GTT	2	6	24859	24864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017310	CCG	2	6	24974	24979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017310	ACC	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017310	CAC	2	6	25132	25137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017310	GCG	2	6	25295	25300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017310	CAT	2	6	28987	28992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017310	CAA	2	6	29108	29113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017310	GTC	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017310	GCA	2	6	29981	29986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017310	GCC	2	6	30090	30095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017310	CGA	2	6	30175	30180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017310	TGC	2	6	30216	30221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017310	GAA	2	6	30358	30363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017310	CAA	2	6	30436	30441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017310	CAC	2	6	30482	30487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017310	ATA	2	6	31914	31919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017310	CGC	2	6	32131	32136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017310	GAG	2	6	32157	32162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017310	GAC	2	6	32255	32260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017310	CTC	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017310	TCC	2	6	33613	33618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017310	GAA	2	6	33748	33753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017310	CGC	2	6	33769	33774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017310	CCA	2	6	34692	34697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017310	TCC	2	6	34715	34720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017310	AGA	2	6	37087	37092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017310	GAA	2	6	37179	37184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017310	CCA	2	6	37197	37202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017310	CGG	2	6	38140	38145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017310	AAC	2	6	38240	38245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017310	AGC	2	6	38279	38284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017310	CAG	2	6	38315	38320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017310	AAC	2	6	38394	38399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017310	AAT	2	6	38438	38443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017310	ACG	2	6	38470	38475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017310	AGC	2	6	40009	40014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017310	CCG	2	6	40091	40096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017310	TGA	2	6	40103	40108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017310	ATG	2	6	40137	40142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017310	AGC	2	6	40264	40269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017310	AAG	2	6	40287	40292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017310	GTG	2	6	40460	40465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017310	AAC	2	6	41841	41846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017310	AGG	2	6	41866	41871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017310	GAG	2	6	41902	41907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017310	GCC	2	6	41914	41919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017310	GAA	2	6	41954	41959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017310	TCA	2	6	42021	42026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017310	CCG	2	6	42050	42055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017310	GCA	2	6	43472	43477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017310	AAC	2	6	43501	43506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017310	GGT	2	6	47136	47141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017310	CAG	2	6	50574	50579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017310	CGA	2	6	50647	50652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017310	TCA	2	6	50682	50687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017310	CCT	2	6	50734	50739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017310	TCA	2	6	50848	50853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017310	TCC	2	6	53002	53007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017310	TAA	2	6	53199	53204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017310	ATG	2	6	53299	53304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017310	TAA	2	6	53337	53342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017310	CAC	2	6	53388	53393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017310	CTG	2	6	53414	53419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017310	GAC	2	6	53491	53496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017310	GTT	2	6	53523	53528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017310	AGG	2	6	53553	53558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017310	GAT	2	6	55517	55522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017310	CAT	2	6	56749	56754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017310	CCG	2	6	56800	56805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017310	GCG	2	6	56808	56813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017310	CGC	2	6	56917	56922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017310	GTG	2	6	56999	57004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017310	GCC	2	6	60249	60254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017310	GGC	2	6	60275	60280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017310	GCC	2	6	60354	60359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017310	TCC	2	6	60644	60649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017310	CGC	2	6	60668	60673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017310	TCC	2	6	61551	61556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017310	GGC	2	6	61568	61573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017310	GCA	2	6	61723	61728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017310	TGC	2	6	61738	61743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017310	CCA	2	6	61917	61922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017310	AAT	2	6	62011	62016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017310	AGG	2	6	62077	62082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017310	CAT	2	6	64388	64393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017310	CGC	2	6	64433	64438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017310	ACC	2	6	65110	65115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017310	TGA	2	6	65256	65261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017310	CGT	2	6	65364	65369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017310	CGT	2	6	65420	65425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017310	CTG	2	6	65445	65450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017310	TGA	2	6	65538	65543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017310	GGT	2	6	66563	66568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017310	TCG	2	6	66760	66765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017310	GGC	2	6	66766	66771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017310	TTA	2	6	69385	69390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017310	ACG	2	6	69596	69601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017310	CCA	2	6	72069	72074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017310	TCG	2	6	72119	72124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017310	TCA	2	6	72183	72188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017310	TCA	2	6	72228	72233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017310	GGC	2	6	72315	72320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017310	GCC	2	6	72336	72341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017310	CAC	2	6	72396	72401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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