MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 50597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017310	ACC	2	6	339	344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151874
2	NC_017310	CGC	2	6	359	364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151874
3	NC_017310	AAG	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151874
4	NC_017310	CTT	2	6	393	398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
5	NC_017310	CTT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
6	NC_017310	CTG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
7	NC_017310	TTG	2	6	562	567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151874
8	NC_017310	TCA	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151874
9	NC_017310	TTC	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151874
10	NC_017310	GCT	2	6	770	775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
11	NC_017310	GCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
12	NC_017310	CGT	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151874
13	NC_017310	ACG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151874
14	NC_017310	CAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151874
15	NC_017310	GAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151874
16	NC_017310	ACC	2	6	907	912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151874
17	NC_017310	ATC	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151874
18	NC_017310	GCG	2	6	1107	1112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151875
19	NC_017310	CTT	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151875
20	NC_017310	TCC	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151875
21	NC_017310	GCA	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151875
22	NC_017310	AAC	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151875
23	NC_017310	TGC	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
24	NC_017310	CAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151876
25	NC_017310	ATC	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
26	NC_017310	CAG	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151876
27	NC_017310	GAA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151876
28	NC_017310	CTG	2	6	2055	2060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
29	NC_017310	GAT	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151876
30	NC_017310	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151876
31	NC_017310	ATC	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
32	NC_017310	CAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151876
33	NC_017310	ACT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151876
34	NC_017310	GAC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151876
35	NC_017310	GCA	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
36	NC_017310	TCG	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
37	NC_017310	CGA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
38	NC_017310	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151877
39	NC_017310	GCG	2	6	2769	2774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
40	NC_017310	TGC	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
41	NC_017310	CGG	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
42	NC_017310	TCC	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151877
43	NC_017310	TCG	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
44	NC_017310	CAG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
45	NC_017310	GCT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151877
46	NC_017310	ACG	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
47	NC_017310	ACG	2	6	3325	3330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
48	NC_017310	GGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151877
49	NC_017310	CGA	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151877
50	NC_017310	AAG	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151878
51	NC_017310	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151878
52	NC_017310	AAG	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151878
53	NC_017310	GAT	3	9	3933	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151878
54	NC_017310	TAT	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387151878
55	NC_017310	AGA	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151879
56	NC_017310	CAA	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151879
57	NC_017310	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
58	NC_017310	GCC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151879
59	NC_017310	GGC	2	6	4545	4550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
60	NC_017310	CAG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
61	NC_017310	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
62	NC_017310	CAG	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
63	NC_017310	CAC	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
64	NC_017310	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
65	NC_017310	GTT	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151879
66	NC_017310	GCA	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
67	NC_017310	CAG	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
68	NC_017310	GTC	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151879
69	NC_017310	CAC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151879
70	NC_017310	GCA	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
71	NC_017310	GGC	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
72	NC_017310	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151879
73	NC_017310	ACG	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
74	NC_017310	CGA	2	6	5486	5491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151879
75	NC_017310	GAA	2	6	5869	5874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151880
76	NC_017310	CGC	2	6	5916	5921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151880
77	NC_017310	GAT	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
78	NC_017310	CAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151880
79	NC_017310	GCG	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151880
80	NC_017310	ACC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151880
81	NC_017310	TCA	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151880
82	NC_017310	TTG	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151880
83	NC_017310	TGA	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
84	NC_017310	AAG	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151880
85	NC_017310	AGC	2	6	6655	6660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151880
86	NC_017310	TGA	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151880
87	NC_017310	CTT	2	6	6975	6980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151881
88	NC_017310	CGA	2	6	7055	7060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
89	NC_017310	GCT	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
90	NC_017310	AGC	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
91	NC_017310	GGC	2	6	7254	7259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
92	NC_017310	CGT	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
93	NC_017310	ATG	2	6	7294	7299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151881
94	NC_017310	TCG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
95	NC_017310	GCA	3	9	7412	7420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
96	NC_017310	GTT	2	6	7436	7441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151881
97	NC_017310	ACC	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151881
98	NC_017310	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151881
99	NC_017310	GCG	2	6	7507	7512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
100	NC_017310	GCA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
101	NC_017310	GGC	2	6	7602	7607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
102	NC_017310	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
103	NC_017310	CTG	2	6	7734	7739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151881
104	NC_017310	CGA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151881
105	NC_017310	AGA	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151881
106	NC_017310	CGC	2	6	7821	7826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151881
107	NC_017310	GCG	2	6	7862	7867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151881
108	NC_017310	TTC	2	6	7881	7886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151882
109	NC_017310	GGC	2	6	7915	7920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151882
110	NC_017310	GGT	2	6	7951	7956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151882
111	NC_017310	CAG	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151882
112	NC_017310	TGA	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151882
113	NC_017310	GGC	2	6	8200	8205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151882
114	NC_017310	TCG	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
115	NC_017310	TCG	2	6	8304	8309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
116	NC_017310	GTC	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151882
117	NC_017310	GCG	2	6	8691	8696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
118	NC_017310	GAG	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151883
119	NC_017310	GCC	2	6	8863	8868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151883
120	NC_017310	GCG	2	6	8959	8964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
121	NC_017310	CGG	2	6	8973	8978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
122	NC_017310	CCG	2	6	8996	9001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151883
123	NC_017310	GCC	2	6	9050	9055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151883
124	NC_017310	GTG	2	6	9106	9111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151883
125	NC_017310	TCC	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151883
126	NC_017310	TCG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151883
127	NC_017310	GCG	2	6	9242	9247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
128	NC_017310	GAA	2	6	9274	9279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151883
129	NC_017310	GGC	2	6	9307	9312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
130	NC_017310	TCG	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151883
131	NC_017310	CTC	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387151883
132	NC_017310	CGA	2	6	9711	9716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151883
133	NC_017310	AGC	2	6	9783	9788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151883
134	NC_017310	GTA	2	6	9799	9804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151883
135	NC_017310	AGC	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151883
136	NC_017310	GGC	2	6	9885	9890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
137	NC_017310	TCG	2	6	9968	9973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151883
138	NC_017310	GCG	2	6	9979	9984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151883
139	NC_017310	GCA	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151883
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143	NC_017310	CCG	2	6	10343	10348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151883
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150	NC_017310	TGC	2	6	10692	10697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151884
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152	NC_017310	GCG	2	6	10760	10765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151884
153	NC_017310	CAT	2	6	10828	10833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151884
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155	NC_017310	GGT	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151884
156	NC_017310	GTA	2	6	10984	10989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151884
157	NC_017310	GCA	2	6	11052	11057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151884
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159	NC_017310	ACG	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151884
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163	NC_017310	GTG	2	6	11975	11980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151885
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241	NC_017310	TGC	2	6	17740	17745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151887
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254	NC_017310	GCG	2	6	18452	18457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151888
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