MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda FL6-60 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017309	CGATGT	2	12	123770	123781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017309	TAAGAC	2	12	153115	153126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017309	TTAACA	2	12	154852	154863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017309	TAAGAC	2	12	188501	188512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017309	AAATAA	2	12	210220	210231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017309	CACGAT	2	12	218398	218409	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017309	TCAGGA	2	12	223996	224007	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017309	TTTTCA	2	12	235610	235621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017309	CAGATA	2	12	261449	261460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017309	GTTAAT	2	12	264349	264360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017309	GCGCTG	3	18	267308	267325	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017309	TTAAAT	2	12	268102	268113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017309	TCGCCG	2	12	300058	300069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017309	CAGTGT	2	12	332751	332762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017309	AATGAA	2	12	337061	337072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017309	AAGTTG	2	12	346949	346960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017309	ATCGCG	2	12	367388	367399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017309	TAACCC	5	30	380855	380884	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017309	CGGCGC	2	12	392564	392575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017309	GTATCC	2	12	395427	395438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017309	ACGCAG	2	12	399080	399091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017309	TTTACC	2	12	438336	438347	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017309	GAAAAA	2	12	478706	478717	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017309	TAGATT	2	12	495858	495869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017309	GATAGC	2	12	502014	502025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017309	TTTTTG	2	12	517267	517278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017309	ATATGT	2	12	545386	545397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017309	TTATTT	2	12	552602	552613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017309	ACGTGT	2	12	568522	568533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017309	TAAGAC	2	12	585492	585503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017309	ATAATG	2	12	595767	595778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017309	TGTTAT	2	12	596696	596707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017309	ATTTAA	2	12	628932	628943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017309	CGGCGT	2	12	655646	655657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017309	TTTATA	2	12	670429	670440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017309	ACAATG	2	12	718113	718124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017309	CCGCAG	2	12	766639	766650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017309	GCGCTG	2	12	766843	766854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017309	TTTAAT	2	12	773228	773239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017309	TGGGTG	2	12	773247	773258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017309	ATGTAA	2	12	788799	788810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017309	CGTCGC	2	12	851489	851500	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017309	AGCGCG	2	12	857812	857823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017309	TGACCC	2	12	881296	881307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017309	ATTGAT	2	12	882710	882721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017309	GTATTT	2	12	889087	889098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017309	ACGCTG	2	12	918357	918368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017309	GGCTTT	2	12	941514	941525	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017309	TTATTT	2	12	965949	965960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017309	AATCCC	2	12	976081	976092	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017309	TGCCGC	2	12	976345	976356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017309	GAATAT	2	12	983967	983978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017309	GATAAC	2	12	984465	984476	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017309	GCCGTC	2	12	1030047	1030058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017309	CAGAGC	2	12	1038558	1038569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017309	GCGCCG	2	12	1050463	1050474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017309	CTTAAA	2	12	1126792	1126803	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017309	GCCTTC	2	12	1147940	1147951	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017309	CTTTTT	2	12	1212348	1212359	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017309	CTCTCC	2	12	1224130	1224141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017309	GCGAGG	2	12	1255120	1255131	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017309	ACGGCC	2	12	1266304	1266315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017309	ATAGGA	2	12	1270543	1270554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017309	CAACGG	2	12	1311325	1311336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017309	GCGTCG	2	12	1335783	1335794	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017309	TTTCCC	7	42	1393180	1393221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017309	CCCTAT	2	12	1405343	1405354	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017309	CTTGCC	2	12	1405450	1405461	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017309	ATGTCT	2	12	1405973	1405984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017309	CGGCGC	2	12	1430519	1430530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017309	TGCGCG	2	12	1435855	1435866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017309	TCGCTC	2	12	1468427	1468438	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017309	TAAAAA	2	12	1468725	1468736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017309	CCCTCC	2	12	1475615	1475626	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_017309	GATTTT	2	12	1475752	1475763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017309	GGGGGA	2	12	1477504	1477515	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017309	AACATA	2	12	1539091	1539102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017309	TTCGCA	2	12	1574590	1574601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017309	CTTATT	2	12	1574699	1574710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017309	GGGCGC	2	12	1579466	1579477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017309	TGATAA	2	12	1588255	1588266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017309	TTATTT	2	12	1613408	1613419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017309	ACGATG	2	12	1637180	1637191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017309	CGTAGC	2	12	1661415	1661426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017309	CCAGCG	2	12	1661575	1661586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017309	ATTACA	4	24	1689560	1689583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017309	CGCGAT	2	12	1694971	1694982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017309	GTCACA	2	12	1711441	1711452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017309	ATCGGC	2	12	1723382	1723393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017309	ATCTGA	2	12	1725359	1725370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017309	GCGCCT	2	12	1725848	1725859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017309	CGGCGC	2	12	1736734	1736745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017309	GGCGCT	2	12	1737038	1737049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017309	ATTACC	2	12	1744231	1744242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017309	CGGACG	2	12	1744290	1744301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017309	CGTAGG	2	12	1770121	1770132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017309	TGAATA	2	12	1801707	1801718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017309	GAAAAT	2	12	1801908	1801919	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017309	TTTATT	2	12	1813478	1813489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017309	GACATC	2	12	1821864	1821875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017309	TGATGC	2	12	1835916	1835927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017309	GGCGCC	2	12	1844690	1844701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017309	CGCGGT	2	12	1855185	1855196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017309	GTCAAG	2	12	1870372	1870383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017309	AATAAA	2	12	1884274	1884285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017309	ATCCAC	2	12	1885007	1885018	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017309	ATAGCA	2	12	1894360	1894371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017309	GAACAG	2	12	1897903	1897914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017309	CCGGCC	2	12	1939392	1939403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017309	GCCTGA	2	12	1953965	1953976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017309	CGCGGC	2	12	1958779	1958790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017309	GAGGCA	12	72	1963822	1963893	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017309	TAAATT	2	12	1975335	1975346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017309	TAATCC	2	12	1984434	1984445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017309	CCTGTT	2	12	2022438	2022449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017309	ATATTG	2	12	2022492	2022503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017309	CGCCGT	2	12	2022615	2022626	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017309	CGTCGC	2	12	2024449	2024460	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017309	GCTATG	2	12	2043295	2043306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017309	GCGCTC	2	12	2045589	2045600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017309	CCCCAC	2	12	2061448	2061459	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_017309	GCCGCA	2	12	2076105	2076116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017309	TCAAAA	2	12	2094701	2094712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017309	CGATAT	2	12	2101829	2101840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017309	CGGATT	2	12	2103736	2103747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017309	GACGTC	2	12	2104752	2104763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017309	GCCCTT	2	12	2170211	2170222	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017309	ATCAAA	2	12	2182535	2182546	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017309	CGATAA	2	12	2183780	2183791	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017309	CCGCGC	2	12	2198952	2198963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017309	CACGCC	2	12	2216720	2216731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017309	GTTATC	2	12	2231342	2231353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017309	TACGCC	2	12	2240540	2240551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017309	ATTTTT	2	12	2316585	2316596	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017309	GTTGCA	2	12	2316931	2316942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017309	TATTTT	2	12	2319910	2319921	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017309	ATTTAA	2	12	2324690	2324701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017309	TAAAAT	2	12	2326305	2326316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017309	ATCGCC	2	12	2326902	2326913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017309	CCCCCT	2	12	2326960	2326971	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
141	NC_017309	CGTCAC	2	12	2334881	2334892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017309	GCCGAC	2	12	2340520	2340531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017309	TCAGTT	2	12	2341174	2341185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017309	ATTTTA	2	12	2362735	2362746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017309	GGCGCG	2	12	2365525	2365536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017309	TCCGGA	2	12	2380430	2380441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017309	GGACGC	2	12	2393793	2393804	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017309	GGCGCC	2	12	2416104	2416115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017309	CTGACG	2	12	2436648	2436659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017309	TGAGAG	2	12	2446001	2446012	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017309	ATTGCC	2	12	2446070	2446081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017309	AAATCC	2	12	2465928	2465939	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017309	TCGGCG	2	12	2501769	2501780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017309	ACCATT	2	12	2505123	2505134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017309	ATTATC	2	12	2541805	2541816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017309	ATCTTC	2	12	2543519	2543530	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017309	GACTGG	2	12	2548888	2548899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_017309	TATGAA	2	12	2557190	2557201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017309	GGCGCA	2	12	2568327	2568338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017309	GCGCGG	2	12	2583112	2583123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_017309	GGCGCC	2	12	2660523	2660534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_017309	CGGCGC	2	12	2679192	2679203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_017309	ATCACC	2	12	2739313	2739324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_017309	TTAAAT	2	12	2745633	2745644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.